264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1248 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1248  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  100 
 
 		 513 aa  1048    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0301309  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2147  proton-dependent oligopeptide transporter family protein  44.98 
 
 		 478 aa  413  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1524  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  43.23 
 
 		 450 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.868386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1599  oligopeptide transporter  41.78 
 
 		 522 aa  342  9e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.941268  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0405  amino acid/peptide transporter  40.45 
 
 		 458 aa  326  7e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0035417  hitchhiker  0.00401498 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4136  amino acid/peptide transporter  38.95 
 
 		 456 aa  305  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4162  amino acid/peptide transporter  38.74 
 
 		 456 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.790543  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4020  amino acid/peptide transporter  38.53 
 
 		 456 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.319297  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1598  amino acid/peptide transporter  35.32 
 
 		 451 aa  284  2.0000000000000002e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1274  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  36.05 
 
 		 517 aa  270  5.9999999999999995e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4137  amino acid/peptide transporter  34.97 
 
 		 437 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.728655  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2411  proton/peptide symporter family protein  36.36 
 
 		 517 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4163  amino acid/peptide transporter  34.35 
 
 		 437 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.65473  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0404  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  36.5 
 
 		 434 aa  257  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117264  hitchhiker  0.000442814 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4021  amino acid/peptide transporter  33.69 
 
 		 435 aa  256  8e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.925576  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3938  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  35.47 
 
 		 515 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000127118 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4030  amino acid/peptide transporter  35.47 
 
 		 515 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3969  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  37 
 
 		 517 aa  243  5e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0002  proton/peptide symporter family protein  35.47 
 
 		 516 aa  242  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0004  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  37.24 
 
 		 515 aa  242  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000099426 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2667  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  43.8 
 
 		 521 aa  182  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.63918  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00673  oligopeptide transporter  44.07 
 
 		 284 aa  170  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.340061  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  25.1 
 
 		 446 aa  127  7e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  25.1 
 
 		 446 aa  127  7e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  26.23 
 
 		 461 aa  124  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  26.21 
 
 		 497 aa  123  8e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  27.25 
 
 		 463 aa  123  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  25.78 
 
 		 461 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  25.78 
 
 		 461 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  26.05 
 
 		 498 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  26.89 
 
 		 490 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  27.66 
 
 		 501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70645  predicted protein  24.69 
 
 		 570 aa  114  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0413957  normal  0.317652 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  26.07 
 
 		 501 aa  114  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  24.64 
 
 		 497 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  25.53 
 
 		 501 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03408  MFS peptide transporter Ptr2, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01490)  23.99 
 
 		 587 aa  111  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  26.54 
 
 		 461 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  26.54 
 
 		 461 aa  111  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  26.54 
 
 		 461 aa  111  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  26.54 
 
 		 461 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  26.54 
 
 		 461 aa  111  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  25.97 
 
 		 501 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  26.54 
 
 		 461 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  26.32 
 
 		 461 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  26.54 
 
 		 461 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  26.44 
 
 		 489 aa  110  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  26.44 
 
 		 489 aa  110  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66905  predicted protein  25.72 
 
 		 577 aa  110  5e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.705777 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  26.2 
 
 		 501 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  26.54 
 
 		 461 aa  110  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0510  permease  26.8 
 
 		 463 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  26.2 
 
 		 501 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  27.03 
 
 		 500 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  26.75 
 
 		 461 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  26.67 
 
 		 489 aa  109  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  26.36 
 
 		 497 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  25.54 
 
 		 517 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  25.56 
 
 		 489 aa  108  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  26.9 
 
 		 462 aa  107  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  26.11 
 
 		 499 aa  107  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  26.08 
 
 		 499 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  24.73 
 
 		 517 aa  107  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  24.39 
 
 		 509 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  27.05 
 
 		 479 aa  106  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  25.22 
 
 		 490 aa  106  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47218  predicted protein  34.3 
 
 		 619 aa  106  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.134275  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  26.23 
 
 		 489 aa  106  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  25.71 
 
 		 489 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  25.5 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  25.78 
 
 		 452 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  26.44 
 
 		 462 aa  104  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  25.78 
 
 		 452 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  23.77 
 
 		 498 aa  103  7e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  23.96 
 
 		 471 aa  103  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08903  MFS peptide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02550)  21 
 
 		 628 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1954  amino acid/peptide transporter  25 
 
 		 501 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01073  MFS peptide transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_1G12240)  24.7 
 
 		 601 aa  101  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  23.69 
 
 		 497 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  24.12 
 
 		 483 aa  101  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  24.65 
 
 		 512 aa  101  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  24.65 
 
 		 512 aa  101  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  25.5 
 
 		 507 aa  100  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  27.24 
 
 		 520 aa  100  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  24.55 
 
 		 451 aa  99  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  22.84 
 
 		 495 aa  99  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  24.2 
 
 		 534 aa  97.8  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  25.44 
 
 		 524 aa  97.4  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  24.32 
 
 		 444 aa  97.1  7e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194.1  peptide transporter  26.61 
 
 		 324 aa  96.3  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  25.81 
 
 		 499 aa  96.7  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  24.95 
 
 		 516 aa  95.1  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  26.13 
 
 		 463 aa  95.9  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  25.14 
 
 		 496 aa  94.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  24.75 
 
 		 517 aa  94  6e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  25 
 
 		 516 aa  93.6  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  23.82 
 
 		 533 aa  92.8  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  26.89 
 
 		 464 aa  90.1  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  23.92 
 
 		 506 aa  90.1  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  24.14 
 
 		 506 aa  90.1  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>