198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_70645 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_66905  predicted protein  79.31 
 
 
577 aa  901    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.705777 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70645  predicted protein  100 
 
 
570 aa  1179    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0413957  normal  0.317652 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03408  MFS peptide transporter Ptr2, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01490)  49.65 
 
 
587 aa  573  1.0000000000000001e-162  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08903  MFS peptide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02550)  40.67 
 
 
628 aa  423  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01073  MFS peptide transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_1G12240)  38.27 
 
 
601 aa  382  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_006686  CND02440  peptide transporter, putative  31 
 
 
632 aa  281  2e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.369095  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41479  predicted protein  32.38 
 
 
601 aa  278  2e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36233  proton-dependent oligopeptide transporter, POT family  33.1 
 
 
637 aa  272  1e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20752  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08915  hypothetical peptide transporter (Eurofung)  29.46 
 
 
606 aa  248  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.42802  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0405  amino acid/peptide transporter  29.08 
 
 
458 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0035417  hitchhiker  0.00401498 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47218  predicted protein  25.44 
 
 
619 aa  160  5e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.134275  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2147  proton-dependent oligopeptide transporter family protein  26.18 
 
 
478 aa  152  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4020  amino acid/peptide transporter  29.02 
 
 
456 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.319297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4136  amino acid/peptide transporter  29.02 
 
 
456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4162  amino acid/peptide transporter  28.79 
 
 
456 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.790543  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1598  amino acid/peptide transporter  27.72 
 
 
451 aa  138  3.0000000000000003e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1524  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  26.01 
 
 
450 aa  137  7.000000000000001e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.868386  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1599  oligopeptide transporter  26.15 
 
 
522 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.941268  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4137  amino acid/peptide transporter  26.22 
 
 
437 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.728655  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4163  amino acid/peptide transporter  26.44 
 
 
437 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.65473  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0404  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  26.92 
 
 
434 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117264  hitchhiker  0.000442814 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1248  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  24.69 
 
 
513 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0301309  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4021  amino acid/peptide transporter  24.89 
 
 
435 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.925576  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2411  proton/peptide symporter family protein  24.27 
 
 
517 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1274  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  23.99 
 
 
517 aa  104  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4030  amino acid/peptide transporter  23.56 
 
 
515 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0002  proton/peptide symporter family protein  22.81 
 
 
516 aa  102  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0004  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  24.32 
 
 
515 aa  101  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000099426 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3969  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  24.85 
 
 
517 aa  101  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3938  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  23.93 
 
 
515 aa  100  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000127118 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2667  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  23.63 
 
 
521 aa  98.2  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.63918  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47148  predicted protein  22.93 
 
 
775 aa  75.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  22.68 
 
 
444 aa  74.7  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  21.26 
 
 
489 aa  73.9  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  21.26 
 
 
489 aa  73.9  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  21.06 
 
 
491 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  28.77 
 
 
479 aa  73.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  21.38 
 
 
489 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2746  amino acid/peptide transporter  29.54 
 
 
482 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210246  normal  0.74954 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  22.84 
 
 
489 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  19.34 
 
 
462 aa  71.2  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  22.52 
 
 
490 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  29.52 
 
 
482 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  20.66 
 
 
462 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  21.68 
 
 
500 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  22.24 
 
 
490 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  26.54 
 
 
484 aa  68.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  32.35 
 
 
497 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  24.2 
 
 
432 aa  68.2  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  22.75 
 
 
451 aa  67.4  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  23.96 
 
 
509 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  28.81 
 
 
489 aa  66.6  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  23.67 
 
 
497 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  24.09 
 
 
498 aa  66.2  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  27 
 
 
501 aa  65.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  23.68 
 
 
504 aa  64.7  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  19.71 
 
 
501 aa  64.3  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  22.73 
 
 
461 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  22.93 
 
 
461 aa  63.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  26.7 
 
 
497 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  26.49 
 
 
558 aa  63.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  35.71 
 
 
499 aa  63.5  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  29.47 
 
 
495 aa  62.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  20.54 
 
 
501 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  22.09 
 
 
461 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  20.54 
 
 
501 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  22.31 
 
 
461 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  22.11 
 
 
461 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  20.54 
 
 
501 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  22.11 
 
 
461 aa  61.6  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  22.11 
 
 
461 aa  61.6  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  22.11 
 
 
461 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  22.11 
 
 
461 aa  61.6  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  27.73 
 
 
498 aa  61.2  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  27.03 
 
 
489 aa  61.2  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  22.31 
 
 
461 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  22.11 
 
 
461 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1255  amino acid/peptide transporter  26.09 
 
 
551 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3023  amino acid/peptide transporter  26.09 
 
 
500 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2907  amino acid/peptide transporter  26.09 
 
 
500 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  29.34 
 
 
498 aa  60.5  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0348  amino acid/peptide transporter  26.57 
 
 
500 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.781642  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1531  amino acid/peptide transporter  26.57 
 
 
500 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1721  amino acid/peptide transporter  26.57 
 
 
500 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97984  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0382  amino acid/peptide transporter  26.57 
 
 
500 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  28.25 
 
 
461 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194.1  peptide transporter  27.37 
 
 
324 aa  59.7  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0113  amino acid/peptide transporter  25.12 
 
 
506 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2221  amino acid/peptide transporter  25.12 
 
 
551 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  22.49 
 
 
533 aa  59.3  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  25.99 
 
 
461 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3261  amino acid/peptide transporter  25.12 
 
 
506 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0234728 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  23.94 
 
 
463 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4868  amino acid/peptide transporter  24.64 
 
 
507 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  21.78 
 
 
501 aa  59.3  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5415  amino acid/peptide transporter  24.64 
 
 
506 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4728  amino acid/peptide transporter  24.64 
 
 
506 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4508  amino acid/peptide transporter  24.14 
 
 
507 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182547  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4440  amino acid/peptide transporter  26.11 
 
 
513 aa  57  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1814  putative tripeptide transporter permease  25.74 
 
 
502 aa  57  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000684589  decreased coverage  0.000347242 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>