283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4162 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_4020  amino acid/peptide transporter  97.37 
 
 		 456 aa  847    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.319297  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0405  amino acid/peptide transporter  75.11 
 
 		 458 aa  676    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0035417  hitchhiker  0.00401498 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4162  amino acid/peptide transporter  100 
 
 		 456 aa  914    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.790543  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4136  amino acid/peptide transporter  99.34 
 
 		 456 aa  909    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4163  amino acid/peptide transporter  49.89 
 
 		 437 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.65473  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4137  amino acid/peptide transporter  49.66 
 
 		 437 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.728655  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4021  amino acid/peptide transporter  48.55 
 
 		 435 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.925576  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0002  proton/peptide symporter family protein  43.03 
 
 		 516 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4030  amino acid/peptide transporter  43.39 
 
 		 515 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3969  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  43.43 
 
 		 517 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1274  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  45.02 
 
 		 517 aa  376  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3938  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  43.2 
 
 		 515 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000127118 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0004  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  44.84 
 
 		 515 aa  375  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000099426 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2147  proton-dependent oligopeptide transporter family protein  46.37 
 
 		 478 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0404  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  48.71 
 
 		 434 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117264  hitchhiker  0.000442814 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2411  proton/peptide symporter family protein  44.87 
 
 		 517 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2667  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  45.23 
 
 		 521 aa  362  9e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.63918  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1524  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  42.89 
 
 		 450 aa  338  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.868386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1599  oligopeptide transporter  44.28 
 
 		 522 aa  335  9e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.941268  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1248  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  38.93 
 
 		 513 aa  320  3e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0301309  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1598  amino acid/peptide transporter  43.03 
 
 		 451 aa  311  1e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00673  oligopeptide transporter  46.35 
 
 		 284 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.340061  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03408  MFS peptide transporter Ptr2, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01490)  28.36 
 
 		 587 aa  172  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47218  predicted protein  30.03 
 
 		 619 aa  152  8.999999999999999e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.134275  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70645  predicted protein  28.79 
 
 		 570 aa  147  3e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0413957  normal  0.317652 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01073  MFS peptide transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_1G12240)  26.76 
 
 		 601 aa  142  9e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.598208 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08903  MFS peptide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02550)  26.33 
 
 		 628 aa  140  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66905  predicted protein  29.53 
 
 		 577 aa  140  6e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.705777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  27.62 
 
 		 509 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  28.89 
 
 		 498 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  28.3 
 
 		 497 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  27.27 
 
 		 463 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  27.58 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  26.1 
 
 		 497 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  28 
 
 		 479 aa  128  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  27.29 
 
 		 497 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  29.33 
 
 		 471 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  28.87 
 
 		 527 aa  124  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  25.48 
 
 		 495 aa  123  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  27.72 
 
 		 499 aa  123  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  26.89 
 
 		 444 aa  122  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  27.51 
 
 		 534 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  27.11 
 
 		 516 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  26.12 
 
 		 461 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  26.23 
 
 		 461 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  27.21 
 
 		 489 aa  117  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  27.21 
 
 		 489 aa  117  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  27.55 
 
 		 462 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  26.53 
 
 		 489 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  26 
 
 		 461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1525  di-/tripeptide transporter  26.2 
 
 		 528 aa  114  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0251804  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  27.47 
 
 		 449 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  27.47 
 
 		 449 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  26.54 
 
 		 462 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  27.95 
 
 		 449 aa  114  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  26.58 
 
 		 497 aa  113  6e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  26.23 
 
 		 491 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  26.17 
 
 		 446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  26.17 
 
 		 446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  26.2 
 
 		 489 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  26.48 
 
 		 501 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0652  tripeptide permease TppB  25.97 
 
 		 504 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.068993  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  27.71 
 
 		 449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  25.93 
 
 		 501 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  26.85 
 
 		 489 aa  111  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  25.93 
 
 		 501 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  25.6 
 
 		 501 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  26.05 
 
 		 498 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  26.21 
 
 		 490 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  25.56 
 
 		 490 aa  110  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  25.99 
 
 		 501 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1814  putative tripeptide transporter permease  27.02 
 
 		 502 aa  110  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000684589  decreased coverage  0.000347242 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  23.7 
 
 		 477 aa  110  7.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  27.27 
 
 		 504 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  28.31 
 
 		 484 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0742  proton/peptide symporter family protein  27.23 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  29.37 
 
 		 464 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  26 
 
 		 461 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  26.09 
 
 		 501 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  27.59 
 
 		 463 aa  107  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  27.17 
 
 		 524 aa  107  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  26 
 
 		 461 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  26 
 
 		 461 aa  106  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  26 
 
 		 461 aa  106  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  26 
 
 		 461 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50811  POT family transporter: dipeptide/tripeptide:proton  27.68 
 
 		 449 aa  106  8e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.030888 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  26 
 
 		 461 aa  106  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  26 
 
 		 461 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  28.33 
 
 		 499 aa  106  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  26 
 
 		 461 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  26.77 
 
 		 516 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  26.71 
 
 		 500 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2719  inner membrane transporter YbgH  28.96 
 
 		 486 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.945342  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2936  inner membrane transporter YbgH  28.96 
 
 		 486 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2761  inner membrane transporter YbgH  28.96 
 
 		 486 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2823  inner membrane transporter YbgH  28.96 
 
 		 486 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2802  inner membrane transporter YbgH  28.96 
 
 		 486 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.883594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  27.58 
 
 		 483 aa  103  5e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  25.76 
 
 		 461 aa  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  27.29 
 
 		 520 aa  103  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>