233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47218 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_47218  predicted protein  100 
 
 
619 aa  1283    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.134275  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70645  predicted protein  25.44 
 
 
570 aa  160  5e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0413957  normal  0.317652 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03408  MFS peptide transporter Ptr2, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01490)  23.98 
 
 
587 aa  149  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4020  amino acid/peptide transporter  30.88 
 
 
456 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.319297  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0405  amino acid/peptide transporter  27.65 
 
 
458 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0035417  hitchhiker  0.00401498 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4136  amino acid/peptide transporter  30.88 
 
 
456 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4162  amino acid/peptide transporter  30.59 
 
 
456 aa  143  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.790543  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66905  predicted protein  25.44 
 
 
577 aa  142  3e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.705777 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0002  proton/peptide symporter family protein  27.95 
 
 
516 aa  134  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08903  MFS peptide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02550)  23.76 
 
 
628 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4030  amino acid/peptide transporter  27.48 
 
 
515 aa  131  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0004  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  27.48 
 
 
515 aa  132  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000099426 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3938  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  27.48 
 
 
515 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000127118 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3969  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  27.12 
 
 
517 aa  127  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01073  MFS peptide transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_1G12240)  25.22 
 
 
601 aa  118  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4137  amino acid/peptide transporter  35.23 
 
 
437 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.728655  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4021  amino acid/peptide transporter  35.98 
 
 
435 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.925576  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2667  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  27.86 
 
 
521 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.63918  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0404  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  38.24 
 
 
434 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117264  hitchhiker  0.000442814 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1598  amino acid/peptide transporter  26.76 
 
 
451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4163  amino acid/peptide transporter  34.09 
 
 
437 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.65473  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1524  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  34.92 
 
 
450 aa  114  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.868386  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1274  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  31.89 
 
 
517 aa  110  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2411  proton/peptide symporter family protein  31.98 
 
 
517 aa  108  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1248  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  34.3 
 
 
513 aa  106  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0301309  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1599  oligopeptide transporter  30.23 
 
 
522 aa  100  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.941268  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2147  proton-dependent oligopeptide transporter family protein  34.59 
 
 
478 aa  100  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02440  peptide transporter, putative  23.86 
 
 
632 aa  94.4  6e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.369095  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41479  predicted protein  24.14 
 
 
601 aa  75.5  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  35.76 
 
 
504 aa  74.7  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  27.78 
 
 
446 aa  70.9  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  27.78 
 
 
446 aa  70.9  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  28.47 
 
 
479 aa  69.3  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36233  proton-dependent oligopeptide transporter, POT family  23.69 
 
 
637 aa  69.7  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20752  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0510  permease  27.53 
 
 
463 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  26.97 
 
 
463 aa  67  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08915  hypothetical peptide transporter (Eurofung)  24.59 
 
 
606 aa  66.6  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.42802  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  33.57 
 
 
451 aa  66.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  26.49 
 
 
495 aa  66.6  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  32.89 
 
 
501 aa  66.6  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  31.21 
 
 
490 aa  66.2  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194.1  peptide transporter  31.08 
 
 
324 aa  65.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  30.87 
 
 
501 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  32.79 
 
 
558 aa  65.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  30.87 
 
 
501 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  30.87 
 
 
501 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2903  amino acid/peptide transporter  30.51 
 
 
584 aa  65.1  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422026 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  30.57 
 
 
491 aa  64.7  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  32.88 
 
 
462 aa  64.3  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0163  amino acid/peptide transporter  26.33 
 
 
707 aa  63.9  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  30.13 
 
 
500 aa  63.9  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  31.47 
 
 
501 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  26.75 
 
 
444 aa  63.2  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  32.21 
 
 
489 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  32.21 
 
 
489 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  30.57 
 
 
489 aa  63.5  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  37.9 
 
 
497 aa  62.8  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  31.54 
 
 
489 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00673  oligopeptide transporter  32.82 
 
 
284 aa  62.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.340061  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  23.43 
 
 
463 aa  62  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  31.51 
 
 
462 aa  62  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  29.94 
 
 
490 aa  61.6  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  29.94 
 
 
489 aa  61.2  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  28.78 
 
 
499 aa  61.2  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  25.42 
 
 
449 aa  61.2  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  25.42 
 
 
449 aa  61.2  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  31.85 
 
 
497 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  29.53 
 
 
501 aa  60.8  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  28.18 
 
 
492 aa  60.5  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2851  hypothetical protein  20.23 
 
 
500 aa  60.1  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2720  hypothetical protein  20.6 
 
 
500 aa  60.1  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  28.49 
 
 
497 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  27.47 
 
 
533 aa  60.1  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  28.18 
 
 
492 aa  60.1  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  28.02 
 
 
498 aa  59.7  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  28.21 
 
 
461 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  24.27 
 
 
461 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3766  amino acid/peptide transporter  25.57 
 
 
482 aa  59.7  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000840749  normal  0.111557 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  24.27 
 
 
461 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  24.27 
 
 
461 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  24.27 
 
 
461 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  24.27 
 
 
461 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  28.21 
 
 
461 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  25.42 
 
 
449 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  24.27 
 
 
461 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  25 
 
 
449 aa  59.3  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  24.27 
 
 
461 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  24.27 
 
 
461 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  30.48 
 
 
510 aa  58.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  24.27 
 
 
461 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0078  amino acid/peptide transporter  25.93 
 
 
603 aa  58.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  31.14 
 
 
509 aa  58.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  25 
 
 
471 aa  58.5  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  30.16 
 
 
497 aa  58.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  27.56 
 
 
461 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  34.96 
 
 
528 aa  58.2  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  33.33 
 
 
490 aa  57.8  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  30.48 
 
 
510 aa  57.8  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  30.61 
 
 
477 aa  57.8  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  24.75 
 
 
461 aa  57.4  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>