271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1274 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0002  proton/peptide symporter family protein  66.73 
 
 		 516 aa  695    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1274  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  100 
 
 		 517 aa  1031    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3969  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  67.25 
 
 		 517 aa  699    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2667  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  68.65 
 
 		 521 aa  689    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.63918  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3938  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  67.25 
 
 		 515 aa  691    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000127118 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4030  amino acid/peptide transporter  66.86 
 
 		 515 aa  691    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0004  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  67.18 
 
 		 515 aa  677    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000099426 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2411  proton/peptide symporter family protein  66.01 
 
 		 517 aa  669    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0405  amino acid/peptide transporter  44.02 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0035417  hitchhiker  0.00401498 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4162  amino acid/peptide transporter  45.02 
 
 		 456 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.790543  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4136  amino acid/peptide transporter  44.81 
 
 		 456 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4020  amino acid/peptide transporter  44.81 
 
 		 456 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.319297  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1598  amino acid/peptide transporter  39.91 
 
 		 451 aa  306  6e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00673  oligopeptide transporter  62.16 
 
 		 284 aa  280  4e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.340061  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1248  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  34.82 
 
 		 513 aa  277  3e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0301309  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2147  proton-dependent oligopeptide transporter family protein  35.62 
 
 		 478 aa  242  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4137  amino acid/peptide transporter  33.48 
 
 		 437 aa  240  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.728655  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4163  amino acid/peptide transporter  33.63 
 
 		 437 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.65473  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1599  oligopeptide transporter  54.55 
 
 		 522 aa  211  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.941268  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1524  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  50.23 
 
 		 450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.868386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0404  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  43 
 
 		 434 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117264  hitchhiker  0.000442814 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4021  amino acid/peptide transporter  41 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.925576  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  29.25 
 
 		 517 aa  127  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  29.03 
 
 		 517 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  27.17 
 
 		 509 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08903  MFS peptide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02550)  25.58 
 
 		 628 aa  120  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  28.27 
 
 		 498 aa  120  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  26.54 
 
 		 483 aa  118  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01073  MFS peptide transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_1G12240)  24.29 
 
 		 601 aa  117  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  26.91 
 
 		 497 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  27.48 
 
 		 496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  25.22 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  26.72 
 
 		 499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  27.06 
 
 		 520 aa  114  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03408  MFS peptide transporter Ptr2, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01490)  25.83 
 
 		 587 aa  114  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  26.42 
 
 		 497 aa  113  7.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1954  amino acid/peptide transporter  27.74 
 
 		 501 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  29.59 
 
 		 512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  29.59 
 
 		 512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  26.54 
 
 		 497 aa  110  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47218  predicted protein  31.89 
 
 		 619 aa  110  8.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.134275  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  25 
 
 		 510 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  24.72 
 
 		 501 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  24.72 
 
 		 501 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  27.18 
 
 		 524 aa  107  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  26.18 
 
 		 498 aa  105  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70645  predicted protein  23.89 
 
 		 570 aa  104  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0413957  normal  0.317652 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  27.31 
 
 		 495 aa  104  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  26.59 
 
 		 558 aa  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  25.62 
 
 		 533 aa  103  9e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  25.88 
 
 		 510 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  23.59 
 
 		 497 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  25.67 
 
 		 504 aa  100  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  24.43 
 
 		 517 aa  97.8  4e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  24.94 
 
 		 501 aa  97.4  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  25.52 
 
 		 446 aa  97.1  7e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  25.52 
 
 		 446 aa  97.1  7e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66905  predicted protein  23.18 
 
 		 577 aa  96.7  8e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.705777 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  24.68 
 
 		 516 aa  97.1  8e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  24.41 
 
 		 479 aa  96.7  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1814  putative tripeptide transporter permease  26.24 
 
 		 502 aa  95.9  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000684589  decreased coverage  0.000347242 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0392  di-tripeptide transporter, putative  25.11 
 
 		 501 aa  95.1  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  26.06 
 
 		 482 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  24.9 
 
 		 516 aa  93.6  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1438  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  33.51 
 
 		 683 aa  92.8  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  25.17 
 
 		 483 aa  92  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  24.89 
 
 		 499 aa  92.4  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0509  putative tripeptide transporter permease  27.33 
 
 		 514 aa  92.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4508  amino acid/peptide transporter  26.65 
 
 		 507 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  23.3 
 
 		 506 aa  90.9  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  23.52 
 
 		 490 aa  90.5  7e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  25.11 
 
 		 527 aa  90.1  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1778  putative tripeptide transporter permease  26.5 
 
 		 501 aa  89.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  25.59 
 
 		 544 aa  89.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2548  putative tripeptide transporter permease  25.73 
 
 		 488 aa  89.7  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1886  putative tripeptide transporter permease  26.5 
 
 		 511 aa  89.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348979  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  28.99 
 
 		 444 aa  89.7  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1890  putative tripeptide transporter permease  23.78 
 
 		 501 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17650  amino acid/peptide transporter (peptide:H symporter)  26.33 
 
 		 511 aa  89  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  25.55 
 
 		 539 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  26.93 
 
 		 534 aa  88.6  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  22.7 
 
 		 506 aa  88.2  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1722  putative tripeptide transporter permease  23.78 
 
 		 501 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00217506  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  25.62 
 
 		 484 aa  88.2  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1549  putative tripeptide transporter permease  23.78 
 
 		 501 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.507438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1562  putative tripeptide transporter permease  23.78 
 
 		 501 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0485322  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1622  putative tripeptide transporter permease  23.78 
 
 		 501 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.185719  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  25.15 
 
 		 539 aa  87  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  25.5 
 
 		 539 aa  86.7  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  25.61 
 
 		 489 aa  87  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  25.15 
 
 		 539 aa  86.7  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  25.32 
 
 		 499 aa  86.7  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  27.41 
 
 		 502 aa  86.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08915  hypothetical peptide transporter (Eurofung)  22.69 
 
 		 606 aa  85.5  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.42802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4252  amino acid/peptide transporter  25.32 
 
 		 486 aa  85.5  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  35.23 
 
 		 498 aa  85.5  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  30.54 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02440  peptide transporter, putative  22.49 
 
 		 632 aa  85.1  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.369095  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  23.35 
 
 		 495 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  30.54 
 
 		 461 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>