259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00673 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00673  oligopeptide transporter  100 
 
 		 284 aa  568  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.340061  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2667  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  75.98 
 
 		 521 aa  357  9.999999999999999e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.63918  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1274  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  62.16 
 
 		 517 aa  280  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0002  proton/peptide symporter family protein  65.53 
 
 		 516 aa  270  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3938  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  65.53 
 
 		 515 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000127118 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4030  amino acid/peptide transporter  65.53 
 
 		 515 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0004  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  65.53 
 
 		 515 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000099426 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3969  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  65.69 
 
 		 517 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2411  proton/peptide symporter family protein  59.64 
 
 		 517 aa  262  4e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1599  oligopeptide transporter  52.53 
 
 		 522 aa  203  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.941268  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0405  amino acid/peptide transporter  48.02 
 
 		 458 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0035417  hitchhiker  0.00401498 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4162  amino acid/peptide transporter  46.35 
 
 		 456 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.790543  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4136  amino acid/peptide transporter  45.92 
 
 		 456 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4020  amino acid/peptide transporter  46.35 
 
 		 456 aa  191  9e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.319297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2147  proton-dependent oligopeptide transporter family protein  51.22 
 
 		 478 aa  183  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1598  amino acid/peptide transporter  45.59 
 
 		 451 aa  170  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1248  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  44.07 
 
 		 513 aa  170  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0301309  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1524  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  48 
 
 		 450 aa  169  7e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.868386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4163  amino acid/peptide transporter  43.84 
 
 		 437 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.65473  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4137  amino acid/peptide transporter  43.84 
 
 		 437 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.728655  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4021  amino acid/peptide transporter  44.83 
 
 		 435 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.925576  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0404  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  43.35 
 
 		 434 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117264  hitchhiker  0.000442814 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  34.36 
 
 		 512 aa  98.2  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  34.36 
 
 		 512 aa  98.2  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  30.22 
 
 		 504 aa  93.2  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  31.72 
 
 		 558 aa  90.9  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  35.02 
 
 		 533 aa  89.7  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  31.68 
 
 		 446 aa  89.4  6e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  31.68 
 
 		 446 aa  89.4  6e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  32.35 
 
 		 499 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  35.79 
 
 		 517 aa  86.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  35.79 
 
 		 517 aa  86.3  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  32.04 
 
 		 497 aa  86.3  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  31.84 
 
 		 483 aa  85.5  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  30.56 
 
 		 497 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  32.08 
 
 		 498 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  33.64 
 
 		 507 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1438  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  30.22 
 
 		 683 aa  84  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  31.53 
 
 		 497 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  30.74 
 
 		 489 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194.1  peptide transporter  33.33 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  28.69 
 
 		 501 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  31.96 
 
 		 497 aa  80.9  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  34.29 
 
 		 517 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  29.49 
 
 		 516 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1954  amino acid/peptide transporter  32.53 
 
 		 501 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  28.99 
 
 		 516 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  32.54 
 
 		 489 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  30.65 
 
 		 479 aa  79.3  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  32.3 
 
 		 509 aa  79.3  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  31.55 
 
 		 462 aa  79.3  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  33.9 
 
 		 501 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  34.29 
 
 		 516 aa  79.3  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  31.22 
 
 		 471 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  33.9 
 
 		 501 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  33.9 
 
 		 501 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  28.33 
 
 		 491 aa  79  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  32.16 
 
 		 490 aa  79  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  31.82 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  34.68 
 
 		 501 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  31.1 
 
 		 539 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  31.58 
 
 		 496 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  31.1 
 
 		 539 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  31.1 
 
 		 539 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  30.46 
 
 		 489 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  31.1 
 
 		 539 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  32.09 
 
 		 462 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  31.36 
 
 		 490 aa  77  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  35.22 
 
 		 498 aa  76.6  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  30.41 
 
 		 489 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  30.41 
 
 		 489 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  30.43 
 
 		 484 aa  75.9  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  32.29 
 
 		 524 aa  75.9  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  31.58 
 
 		 495 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  29.51 
 
 		 534 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04001  predicted transporter  28.5 
 
 		 485 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3861  amino acid/peptide transporter  28.5 
 
 		 485 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4371  amino acid/peptide transporter  28.5 
 
 		 485 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.113976  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3897  amino acid/peptide transporter  28.5 
 
 		 485 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03963  hypothetical protein  28.5 
 
 		 485 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4685  amino acid/peptide transporter  28.5 
 
 		 485 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  32.95 
 
 		 501 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5646  amino acid/peptide transporter  28.5 
 
 		 485 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4599  amino acid/peptide transporter  28.5 
 
 		 485 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.148198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  32.95 
 
 		 500 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  28.31 
 
 		 489 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  33.33 
 
 		 528 aa  73.6  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  31.79 
 
 		 461 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  28.95 
 
 		 451 aa  73.2  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  31.84 
 
 		 482 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  31.79 
 
 		 461 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  29.81 
 
 		 527 aa  72.8  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  31.79 
 
 		 461 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  31.58 
 
 		 520 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0685  di-/tripeptide transporter  31.43 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.284877  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  24.89 
 
 		 444 aa  70.5  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4252  amino acid/peptide transporter  31.25 
 
 		 486 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2719  inner membrane transporter YbgH  27.18 
 
 		 486 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.945342  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2936  inner membrane transporter YbgH  27.18 
 
 		 486 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2802  inner membrane transporter YbgH  27.18 
 
 		 486 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.883594  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>