264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1524 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1524  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  100 
 
 
450 aa  914    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.868386  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2147  proton-dependent oligopeptide transporter family protein  53.86 
 
 
478 aa  479  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1599  oligopeptide transporter  53.61 
 
 
522 aa  421  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.941268  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1248  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  43.23 
 
 
513 aa  390  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0301309  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0405  amino acid/peptide transporter  42.45 
 
 
458 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0035417  hitchhiker  0.00401498 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4020  amino acid/peptide transporter  43.98 
 
 
456 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.319297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4136  amino acid/peptide transporter  43.98 
 
 
456 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4162  amino acid/peptide transporter  44.21 
 
 
456 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.790543  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4137  amino acid/peptide transporter  41.5 
 
 
437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.728655  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4163  amino acid/peptide transporter  41.25 
 
 
437 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.65473  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0404  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  42.16 
 
 
434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117264  hitchhiker  0.000442814 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1598  amino acid/peptide transporter  41.31 
 
 
451 aa  301  1e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4021  amino acid/peptide transporter  40.15 
 
 
435 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.925576  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1274  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  50.23 
 
 
517 aa  208  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3969  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  49.3 
 
 
517 aa  206  6e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2667  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  50.66 
 
 
521 aa  204  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.63918  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4030  amino acid/peptide transporter  49.3 
 
 
515 aa  202  8e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0004  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  49.3 
 
 
515 aa  202  8e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000099426 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0002  proton/peptide symporter family protein  48.84 
 
 
516 aa  202  9e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3938  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  49.3 
 
 
515 aa  202  9e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000127118 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2411  proton/peptide symporter family protein  46.53 
 
 
517 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00673  oligopeptide transporter  48 
 
 
284 aa  179  8e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.340061  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70645  predicted protein  25.66 
 
 
570 aa  140  4.999999999999999e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0413957  normal  0.317652 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03408  MFS peptide transporter Ptr2, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01490)  27.72 
 
 
587 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  28.3 
 
 
446 aa  127  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  28.3 
 
 
446 aa  127  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66905  predicted protein  25.6 
 
 
577 aa  125  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.705777 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  27.78 
 
 
489 aa  123  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  27.78 
 
 
489 aa  123  8e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  27.55 
 
 
489 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  28.36 
 
 
490 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  27.8 
 
 
490 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  26.76 
 
 
489 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08903  MFS peptide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02550)  25.1 
 
 
628 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  27.57 
 
 
489 aa  117  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  26.59 
 
 
491 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47218  predicted protein  34.92 
 
 
619 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.134275  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  26.46 
 
 
463 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  25.49 
 
 
471 aa  113  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  26.2 
 
 
479 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  27.13 
 
 
500 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0510  permease  26 
 
 
463 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  26.17 
 
 
501 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  26.17 
 
 
501 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  26.83 
 
 
444 aa  110  5e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  25.95 
 
 
501 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  26.54 
 
 
501 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  27.68 
 
 
462 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  26.46 
 
 
501 aa  107  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  25.92 
 
 
497 aa  104  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  27.27 
 
 
498 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  27.99 
 
 
504 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  26.44 
 
 
462 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  33.98 
 
 
497 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01073  MFS peptide transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_1G12240)  25.21 
 
 
601 aa  101  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  26.96 
 
 
484 aa  101  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  26.04 
 
 
461 aa  100  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  31.1 
 
 
432 aa  99.8  9e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  25.06 
 
 
461 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  25.06 
 
 
461 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  25.54 
 
 
451 aa  97.4  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  24.24 
 
 
477 aa  97.1  6e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1438  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  30.39 
 
 
683 aa  97.1  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  26.39 
 
 
489 aa  96.7  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  25.76 
 
 
461 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  25.54 
 
 
461 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  25.54 
 
 
461 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  25.54 
 
 
461 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  25.54 
 
 
461 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  25.54 
 
 
461 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  24.95 
 
 
516 aa  95.1  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2746  amino acid/peptide transporter  26.21 
 
 
482 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210246  normal  0.74954 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  25.54 
 
 
461 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  25.54 
 
 
461 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  24.55 
 
 
495 aa  94.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  25.76 
 
 
461 aa  94  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50811  POT family transporter: dipeptide/tripeptide:proton  25.93 
 
 
449 aa  94  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.030888 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1058  amino acid/peptide transporter  26.28 
 
 
467 aa  92.8  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  25.75 
 
 
461 aa  92.8  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  31.53 
 
 
558 aa  91.3  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4252  amino acid/peptide transporter  25.64 
 
 
486 aa  91.3  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  28.63 
 
 
533 aa  89.7  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  31.08 
 
 
497 aa  89  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  25.4 
 
 
482 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  25.11 
 
 
499 aa  87.4  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  25.55 
 
 
516 aa  87.4  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0509  putative tripeptide transporter permease  25 
 
 
514 aa  87  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  25.06 
 
 
452 aa  86.7  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  25.06 
 
 
452 aa  86.7  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  27.96 
 
 
464 aa  86.7  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47148  predicted protein  28.12 
 
 
775 aa  85.9  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  24.57 
 
 
506 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  25.23 
 
 
463 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  34.86 
 
 
498 aa  84.7  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1088  amino acid/peptide transporter  29.28 
 
 
584 aa  84.3  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  23.71 
 
 
510 aa  84.3  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  30.61 
 
 
501 aa  84  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0920  amino acid/peptide transporter  24.38 
 
 
436 aa  84  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000308736  unclonable  5.10372e-19 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  25.97 
 
 
520 aa  83.6  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194.1  peptide transporter  27.01 
 
 
324 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>