127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47148 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_47148  predicted protein  100 
 
 		 775 aa  1576    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03408  MFS peptide transporter Ptr2, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01490)  26.81 
 
 		 587 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2147  proton-dependent oligopeptide transporter family protein  28.12 
 
 		 478 aa  114  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0405  amino acid/peptide transporter  27.54 
 
 		 458 aa  111  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0035417  hitchhiker  0.00401498 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4162  amino acid/peptide transporter  26.75 
 
 		 456 aa  91.7  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.790543  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0004  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  23.48 
 
 		 515 aa  91.7  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000099426 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4136  amino acid/peptide transporter  26.51 
 
 		 456 aa  91.3  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3969  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  23.48 
 
 		 517 aa  91.3  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3938  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  23.48 
 
 		 515 aa  90.9  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000127118 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4030  amino acid/peptide transporter  23.48 
 
 		 515 aa  90.9  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.052619 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01073  MFS peptide transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_1G12240)  25.11 
 
 		 601 aa  89.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4020  amino acid/peptide transporter  26.54 
 
 		 456 aa  89.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.319297  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0002  proton/peptide symporter family protein  23.02 
 
 		 516 aa  89  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1598  amino acid/peptide transporter  26.19 
 
 		 451 aa  89  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4163  amino acid/peptide transporter  25.84 
 
 		 437 aa  88.2  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.65473  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1599  oligopeptide transporter  26.23 
 
 		 522 aa  86.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.941268  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2411  proton/peptide symporter family protein  23.41 
 
 		 517 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4137  amino acid/peptide transporter  25.58 
 
 		 437 aa  84.7  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.728655  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08903  MFS peptide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02550)  22.71 
 
 		 628 aa  82.4  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4021  amino acid/peptide transporter  25.64 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.925576  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1274  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  24.54 
 
 		 517 aa  79  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66905  predicted protein  23 
 
 		 577 aa  78.2  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.705777 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1524  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  27.88 
 
 		 450 aa  77  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.868386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70645  predicted protein  22.93 
 
 		 570 aa  75.5  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0413957  normal  0.317652 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1248  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  24.6 
 
 		 513 aa  75.5  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0301309  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0404  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  24.87 
 
 		 434 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117264  hitchhiker  0.000442814 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2667  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  30 
 
 		 521 aa  65.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.63918  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  25.63 
 
 		 504 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  24.45 
 
 		 462 aa  62  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41479  predicted protein  23.92 
 
 		 601 aa  59.3  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  23.72 
 
 		 462 aa  59.3  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  25.45 
 
 		 517 aa  58.5  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  28.93 
 
 		 497 aa  57.8  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  25.66 
 
 		 451 aa  57  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  26.42 
 
 		 444 aa  57.4  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  23.34 
 
 		 463 aa  56.6  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1438  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  29.14 
 
 		 683 aa  56.2  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  25 
 
 		 516 aa  56.6  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  28.89 
 
 		 502 aa  56.2  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  30.56 
 
 		 499 aa  56.2  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  31.05 
 
 		 489 aa  55.8  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00673  oligopeptide transporter  29.03 
 
 		 284 aa  55.5  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.340061  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  25.57 
 
 		 558 aa  55.1  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  22.81 
 
 		 479 aa  54.3  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0683  di-/tripeptide transporter  25.73 
 
 		 165 aa  54.3  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0486429  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  24.3 
 
 		 500 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  25.82 
 
 		 491 aa  53.5  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  26.9 
 
 		 495 aa  53.5  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  26.47 
 
 		 489 aa  53.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  28.65 
 
 		 527 aa  53.1  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0510  permease  26.42 
 
 		 463 aa  53.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  26.3 
 
 		 512 aa  53.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  26.3 
 
 		 512 aa  53.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47218  predicted protein  30.53 
 
 		 619 aa  53.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.134275  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  23.44 
 
 		 490 aa  52.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  26.39 
 
 		 490 aa  52.8  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  23.13 
 
 		 464 aa  52  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  27.49 
 
 		 501 aa  52  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  27.49 
 
 		 501 aa  52  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  23.7 
 
 		 461 aa  52  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  27.03 
 
 		 510 aa  52  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4508  amino acid/peptide transporter  22.97 
 
 		 507 aa  52  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  26.98 
 
 		 510 aa  51.6  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  26.24 
 
 		 520 aa  50.8  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  22.72 
 
 		 461 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  24.16 
 
 		 489 aa  50.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  27.27 
 
 		 482 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  25.09 
 
 		 501 aa  50.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  22.25 
 
 		 461 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  22.45 
 
 		 461 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  22.19 
 
 		 461 aa  49.3  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  22.19 
 
 		 461 aa  49.3  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  22.19 
 
 		 461 aa  49.3  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  27.22 
 
 		 528 aa  49.3  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2746  amino acid/peptide transporter  27.94 
 
 		 482 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210246  normal  0.74954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  23.79 
 
 		 489 aa  48.9  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  23.79 
 
 		 489 aa  48.9  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36233  proton-dependent oligopeptide transporter, POT family  21.34 
 
 		 637 aa  48.9  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  22.88 
 
 		 489 aa  48.9  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  27.86 
 
 		 498 aa  48.9  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  23.6 
 
 		 524 aa  48.5  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  21.39 
 
 		 461 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  23.15 
 
 		 497 aa  48.1  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  25.83 
 
 		 507 aa  48.1  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  22.19 
 
 		 461 aa  48.1  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  24.11 
 
 		 501 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0392  di-tripeptide transporter, putative  25.21 
 
 		 501 aa  47  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  29.48 
 
 		 497 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  21.93 
 
 		 461 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2221  amino acid/peptide transporter  25.28 
 
 		 551 aa  47  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4252  amino acid/peptide transporter  27.52 
 
 		 486 aa  47  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  24.11 
 
 		 501 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0770  inner membrane transporter YbgH  28.26 
 
 		 493 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.493131 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0867  inner membrane transporter YbgH  28.26 
 
 		 493 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1255  amino acid/peptide transporter  25.28 
 
 		 551 aa  46.6  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  27.27 
 
 		 490 aa  46.2  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3023  amino acid/peptide transporter  25.28 
 
 		 500 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2907  amino acid/peptide transporter  25.28 
 
 		 500 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  25.41 
 
 		 517 aa  46.2  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0832  inner membrane transporter YbgH  28.26 
 
 		 493 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  hitchhiker  0.00189799 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>