280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4020 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0405  amino acid/peptide transporter  74.17 
 
 
458 aa  676    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0035417  hitchhiker  0.00401498 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4162  amino acid/peptide transporter  97.37 
 
 
456 aa  847    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.790543  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4020  amino acid/peptide transporter  100 
 
 
456 aa  916    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.319297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4136  amino acid/peptide transporter  98.03 
 
 
456 aa  902    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4163  amino acid/peptide transporter  50.11 
 
 
437 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.65473  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4137  amino acid/peptide transporter  50.11 
 
 
437 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.728655  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4021  amino acid/peptide transporter  48.99 
 
 
435 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.925576  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0002  proton/peptide symporter family protein  42.63 
 
 
516 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3969  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  42.83 
 
 
517 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3938  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  42.41 
 
 
515 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000127118 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4030  amino acid/peptide transporter  42.6 
 
 
515 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1274  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  44.81 
 
 
517 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0004  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  44.4 
 
 
515 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000099426 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2411  proton/peptide symporter family protein  44.03 
 
 
517 aa  371  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0404  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  48.47 
 
 
434 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117264  hitchhiker  0.000442814 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2147  proton-dependent oligopeptide transporter family protein  46.15 
 
 
478 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2667  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  43.9 
 
 
521 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.63918  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1524  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  42.95 
 
 
450 aa  336  5.999999999999999e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.868386  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1599  oligopeptide transporter  44.04 
 
 
522 aa  333  6e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.941268  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1248  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  38.91 
 
 
513 aa  316  6e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0301309  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1598  amino acid/peptide transporter  43.03 
 
 
451 aa  310  4e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00673  oligopeptide transporter  46.35 
 
 
284 aa  196  6e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.340061  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03408  MFS peptide transporter Ptr2, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01490)  29.2 
 
 
587 aa  177  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47218  predicted protein  30.29 
 
 
619 aa  155  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.134275  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70645  predicted protein  29.02 
 
 
570 aa  151  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0413957  normal  0.317652 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66905  predicted protein  29.93 
 
 
577 aa  140  3e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.705777 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08903  MFS peptide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02550)  26.61 
 
 
628 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01073  MFS peptide transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_1G12240)  25.68 
 
 
601 aa  140  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  27.41 
 
 
509 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  28.44 
 
 
498 aa  132  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  27.43 
 
 
497 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  28.41 
 
 
471 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  26.64 
 
 
463 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  27.29 
 
 
479 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  27 
 
 
451 aa  124  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  25.88 
 
 
497 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  29.4 
 
 
527 aa  123  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  27.49 
 
 
534 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  28.6 
 
 
516 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  26.82 
 
 
497 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  27.83 
 
 
499 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  24.63 
 
 
495 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  26.89 
 
 
444 aa  122  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  27.31 
 
 
462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  25.88 
 
 
461 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  26 
 
 
461 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  25.76 
 
 
461 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  26.54 
 
 
462 aa  113  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1525  di-/tripeptide transporter  26.2 
 
 
528 aa  113  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0251804  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  26.42 
 
 
446 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  26.42 
 
 
446 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0652  tripeptide permease TppB  26.2 
 
 
504 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.068993  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  26.74 
 
 
489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  26.74 
 
 
489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1814  putative tripeptide transporter permease  27.48 
 
 
502 aa  111  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000684589  decreased coverage  0.000347242 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  26.07 
 
 
489 aa  111  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  26.61 
 
 
501 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  26.06 
 
 
491 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  26.19 
 
 
497 aa  110  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  26.75 
 
 
449 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  26.75 
 
 
449 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  25.56 
 
 
490 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  26.91 
 
 
483 aa  109  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  25.6 
 
 
501 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  25.97 
 
 
501 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  26.51 
 
 
449 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  28.54 
 
 
484 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  27.05 
 
 
504 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  25.49 
 
 
501 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  25.97 
 
 
489 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  25.74 
 
 
490 aa  107  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  25.49 
 
 
501 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  27.39 
 
 
524 aa  107  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  29.37 
 
 
464 aa  107  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  25.55 
 
 
501 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  26.51 
 
 
449 aa  106  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  24.06 
 
 
477 aa  106  9e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  26.39 
 
 
489 aa  106  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  26.98 
 
 
516 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  28.03 
 
 
499 aa  106  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  24.84 
 
 
498 aa  105  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50811  POT family transporter: dipeptide/tripeptide:proton  27.42 
 
 
449 aa  104  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.030888 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  27.12 
 
 
463 aa  103  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  26.48 
 
 
500 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0742  proton/peptide symporter family protein  26.49 
 
 
395 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2719  inner membrane transporter YbgH  29.01 
 
 
486 aa  103  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.945342  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2823  inner membrane transporter YbgH  29.01 
 
 
486 aa  103  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2936  inner membrane transporter YbgH  29.01 
 
 
486 aa  103  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2761  inner membrane transporter YbgH  29.01 
 
 
486 aa  103  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2802  inner membrane transporter YbgH  29.01 
 
 
486 aa  103  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.883594  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  25.29 
 
 
461 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  26.14 
 
 
452 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  25.29 
 
 
461 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  25.29 
 
 
461 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  25.29 
 
 
461 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  25.29 
 
 
461 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  26.14 
 
 
452 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  25.29 
 
 
461 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  25.29 
 
 
461 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  23.89 
 
 
516 aa  101  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>