265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1598 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1598  amino acid/peptide transporter  100 
 
 
451 aa  917    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0405  amino acid/peptide transporter  43.3 
 
 
458 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0035417  hitchhiker  0.00401498 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2667  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  40.37 
 
 
521 aa  315  9e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.63918  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1599  oligopeptide transporter  40.8 
 
 
522 aa  309  9e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.941268  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1274  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  39.91 
 
 
517 aa  306  4.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4162  amino acid/peptide transporter  43.03 
 
 
456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.790543  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4136  amino acid/peptide transporter  43.03 
 
 
456 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4020  amino acid/peptide transporter  43.03 
 
 
456 aa  303  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.319297  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1524  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  39.4 
 
 
450 aa  302  7.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.868386  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2411  proton/peptide symporter family protein  37.83 
 
 
517 aa  302  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3938  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  36.1 
 
 
515 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000127118 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4030  amino acid/peptide transporter  35.91 
 
 
515 aa  300  4e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0004  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  37.45 
 
 
515 aa  295  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000099426 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2147  proton-dependent oligopeptide transporter family protein  37.06 
 
 
478 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1248  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  34.19 
 
 
513 aa  286  5.999999999999999e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0301309  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3969  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  34.44 
 
 
517 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4137  amino acid/peptide transporter  38.04 
 
 
437 aa  275  8e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.728655  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4163  amino acid/peptide transporter  37.8 
 
 
437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.65473  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4021  amino acid/peptide transporter  37.77 
 
 
435 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.925576  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0404  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  38.2 
 
 
434 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117264  hitchhiker  0.000442814 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0002  proton/peptide symporter family protein  48.28 
 
 
516 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00673  oligopeptide transporter  45.59 
 
 
284 aa  170  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.340061  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03408  MFS peptide transporter Ptr2, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01490)  29.13 
 
 
587 aa  153  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70645  predicted protein  26.98 
 
 
570 aa  139  7.999999999999999e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0413957  normal  0.317652 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66905  predicted protein  26.36 
 
 
577 aa  127  5e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.705777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  25.88 
 
 
499 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  26.45 
 
 
498 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  28.1 
 
 
444 aa  124  5e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01073  MFS peptide transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_1G12240)  25.16 
 
 
601 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  26.41 
 
 
497 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08903  MFS peptide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02550)  25.21 
 
 
628 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  26.48 
 
 
506 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  24.82 
 
 
477 aa  117  5e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  25.57 
 
 
501 aa  116  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  26.58 
 
 
491 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  27.39 
 
 
490 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47218  predicted protein  26.76 
 
 
619 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.134275  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  27.21 
 
 
490 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  26.16 
 
 
446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  26.16 
 
 
446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1814  putative tripeptide transporter permease  26.39 
 
 
502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000684589  decreased coverage  0.000347242 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  26.2 
 
 
489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  26.2 
 
 
489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  25.98 
 
 
489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01604  putative tripeptide transporter permease  24.71 
 
 
500 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00542523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2006  amino acid/peptide transporter  24.71 
 
 
500 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0749107  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1890  putative tripeptide transporter permease  25.63 
 
 
501 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1995  putative tripeptide transporter permease  24.71 
 
 
500 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46141  normal  0.0309863 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1549  putative tripeptide transporter permease  25.4 
 
 
501 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.507438  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  24.7 
 
 
539 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  25.58 
 
 
497 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  24.7 
 
 
534 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01594  hypothetical protein  24.71 
 
 
500 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00471162  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1622  putative tripeptide transporter permease  25.4 
 
 
501 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.185719  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1565  putative tripeptide transporter permease  24.71 
 
 
500 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1844  putative tripeptide transporter permease  24.71 
 
 
500 aa  111  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345542  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  24.71 
 
 
500 aa  111  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1562  putative tripeptide transporter permease  25.4 
 
 
501 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0485322  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1722  putative tripeptide transporter permease  25.4 
 
 
501 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00217506  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2346  putative tripeptide transporter permease  24.48 
 
 
500 aa  111  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0609489  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1824  putative tripeptide transporter permease  24.71 
 
 
500 aa  111  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  25 
 
 
506 aa  110  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1886  putative tripeptide transporter permease  25.68 
 
 
511 aa  110  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348979  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1778  putative tripeptide transporter permease  25.9 
 
 
501 aa  109  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2548  putative tripeptide transporter permease  25.9 
 
 
488 aa  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  26.3 
 
 
544 aa  109  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  24.5 
 
 
539 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  24.5 
 
 
539 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  26.65 
 
 
504 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  25.1 
 
 
544 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02440  peptide transporter, putative  24.94 
 
 
632 aa  108  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.369095  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  27.94 
 
 
451 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  24.5 
 
 
539 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  26.87 
 
 
462 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0509  putative tripeptide transporter permease  26.43 
 
 
514 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  27.49 
 
 
489 aa  107  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  27.17 
 
 
489 aa  107  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  25.73 
 
 
527 aa  107  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  27.61 
 
 
462 aa  107  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  24.57 
 
 
461 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  26.58 
 
 
501 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  23.58 
 
 
516 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  24.11 
 
 
483 aa  105  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  26.58 
 
 
501 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  26.58 
 
 
501 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  24.33 
 
 
461 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  26.04 
 
 
500 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  23.42 
 
 
489 aa  104  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  29.17 
 
 
558 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  24.23 
 
 
461 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  22.58 
 
 
471 aa  103  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  25.76 
 
 
517 aa  103  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  24.09 
 
 
461 aa  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  24.45 
 
 
461 aa  103  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  24.21 
 
 
461 aa  103  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  24.56 
 
 
498 aa  103  8e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  24.23 
 
 
461 aa  103  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  24.23 
 
 
461 aa  103  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  24.23 
 
 
461 aa  103  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  24.23 
 
 
461 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>