271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1599 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1599  oligopeptide transporter  100 
 
 		 522 aa  1060    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.941268  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2147  proton-dependent oligopeptide transporter family protein  53.21 
 
 		 478 aa  423  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1524  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  53.61 
 
 		 450 aa  409  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.868386  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1248  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  41.78 
 
 		 513 aa  342  9e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0301309  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0405  amino acid/peptide transporter  42.21 
 
 		 458 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0035417  hitchhiker  0.00401498 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4162  amino acid/peptide transporter  44.28 
 
 		 456 aa  323  5e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.790543  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4020  amino acid/peptide transporter  44.04 
 
 		 456 aa  321  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.319297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4136  amino acid/peptide transporter  43.8 
 
 		 456 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4163  amino acid/peptide transporter  42.31 
 
 		 437 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.65473  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1598  amino acid/peptide transporter  40.8 
 
 		 451 aa  309  1.0000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4137  amino acid/peptide transporter  42.05 
 
 		 437 aa  307  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.728655  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0404  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  42.6 
 
 		 434 aa  300  5e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117264  hitchhiker  0.000442814 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4021  amino acid/peptide transporter  41.49 
 
 		 435 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.925576  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1274  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  37.36 
 
 		 517 aa  264  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0002  proton/peptide symporter family protein  35.79 
 
 		 516 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2667  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  57.07 
 
 		 521 aa  226  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.63918  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2411  proton/peptide symporter family protein  51.27 
 
 		 517 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3969  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  52.28 
 
 		 517 aa  207  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3938  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  51.27 
 
 		 515 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000127118 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4030  amino acid/peptide transporter  51.27 
 
 		 515 aa  206  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0004  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  51.27 
 
 		 515 aa  205  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000099426 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00673  oligopeptide transporter  52.53 
 
 		 284 aa  203  8e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.340061  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  28.07 
 
 		 471 aa  134  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  27.36 
 
 		 446 aa  130  6e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  27.36 
 
 		 446 aa  130  6e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70645  predicted protein  26.15 
 
 		 570 aa  129  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0413957  normal  0.317652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  27.5 
 
 		 489 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03408  MFS peptide transporter Ptr2, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01490)  25.54 
 
 		 587 aa  127  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  26.7 
 
 		 527 aa  125  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  27.03 
 
 		 477 aa  124  5e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  28.15 
 
 		 504 aa  123  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  26.88 
 
 		 479 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  26.35 
 
 		 462 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  27.6 
 
 		 463 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66905  predicted protein  25.27 
 
 		 577 aa  122  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.705777 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  23.9 
 
 		 495 aa  121  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  29.74 
 
 		 444 aa  120  6e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  26.71 
 
 		 461 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  26.71 
 
 		 461 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  24.38 
 
 		 509 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  26.71 
 
 		 461 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  26.71 
 
 		 461 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  26.71 
 
 		 461 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  26.71 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  26.71 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  26.95 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  26.86 
 
 		 461 aa  118  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  26.71 
 
 		 461 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  25.66 
 
 		 461 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  26.93 
 
 		 497 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  26 
 
 		 461 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08903  MFS peptide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02550)  24.95 
 
 		 628 aa  117  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  26.71 
 
 		 461 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0510  permease  27.36 
 
 		 463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  26.6 
 
 		 489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  25.6 
 
 		 489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  25.6 
 
 		 489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  25.54 
 
 		 500 aa  114  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  25.18 
 
 		 462 aa  115  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2346  putative tripeptide transporter permease  25.59 
 
 		 500 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0609489  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01604  putative tripeptide transporter permease  25.54 
 
 		 500 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00542523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2006  amino acid/peptide transporter  25.54 
 
 		 500 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0749107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01594  hypothetical protein  25.54 
 
 		 500 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00471162  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1995  putative tripeptide transporter permease  25.54 
 
 		 500 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46141  normal  0.0309863 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1565  putative tripeptide transporter permease  25.54 
 
 		 500 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1824  putative tripeptide transporter permease  25.32 
 
 		 500 aa  113  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  25.36 
 
 		 489 aa  114  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  24.64 
 
 		 490 aa  114  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1844  putative tripeptide transporter permease  25.32 
 
 		 500 aa  113  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345542  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  26.78 
 
 		 451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1622  putative tripeptide transporter permease  25.21 
 
 		 501 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.185719  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1890  putative tripeptide transporter permease  25.21 
 
 		 501 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1549  putative tripeptide transporter permease  25.33 
 
 		 501 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.507438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1562  putative tripeptide transporter permease  25.21 
 
 		 501 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0485322  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1722  putative tripeptide transporter permease  25.21 
 
 		 501 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00217506  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  24.88 
 
 		 501 aa  111  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  25 
 
 		 501 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  25 
 
 		 501 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01073  MFS peptide transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_1G12240)  23.63 
 
 		 601 aa  110  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  24.77 
 
 		 501 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  24.21 
 
 		 490 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  27.79 
 
 		 497 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4252  amino acid/peptide transporter  27.44 
 
 		 486 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  25.74 
 
 		 539 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  26.18 
 
 		 463 aa  107  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  24.69 
 
 		 489 aa  107  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  24.34 
 
 		 491 aa  107  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  25.32 
 
 		 539 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  25.7 
 
 		 539 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17650  amino acid/peptide transporter (peptide:H symporter)  26.03 
 
 		 511 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  25.7 
 
 		 539 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1814  putative tripeptide transporter permease  24.73 
 
 		 502 aa  106  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000684589  decreased coverage  0.000347242 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  24.34 
 
 		 516 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  25.47 
 
 		 501 aa  105  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  24.51 
 
 		 506 aa  105  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2851  hypothetical protein  22.45 
 
 		 500 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2720  hypothetical protein  22.69 
 
 		 500 aa  103  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  26.2 
 
 		 495 aa  103  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  24.62 
 
 		 506 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  26.32 
 
 		 483 aa  102  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>