188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_66905 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_66905  predicted protein  100 
 
 		 577 aa  1192    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.705777 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70645  predicted protein  79.31 
 
 		 570 aa  926    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0413957  normal  0.317652 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03408  MFS peptide transporter Ptr2, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01490)  49.37 
 
 		 587 aa  561  1e-158  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08903  MFS peptide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02550)  38.9 
 
 		 628 aa  401  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01073  MFS peptide transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_1G12240)  38.46 
 
 		 601 aa  395  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36233  proton-dependent oligopeptide transporter, POT family  32.51 
 
 		 637 aa  284  3.0000000000000004e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20752  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02440  peptide transporter, putative  31.93 
 
 		 632 aa  283  6.000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.369095  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41479  predicted protein  30.58 
 
 		 601 aa  279  1e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08915  hypothetical peptide transporter (Eurofung)  29.75 
 
 		 606 aa  256  9e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.42802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0405  amino acid/peptide transporter  28.54 
 
 		 458 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0035417  hitchhiker  0.00401498 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4020  amino acid/peptide transporter  30.16 
 
 		 456 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.319297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4136  amino acid/peptide transporter  29.98 
 
 		 456 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4162  amino acid/peptide transporter  29.75 
 
 		 456 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.790543  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47218  predicted protein  25.49 
 
 		 619 aa  147  7.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.134275  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2147  proton-dependent oligopeptide transporter family protein  27.13 
 
 		 478 aa  145  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1598  amino acid/peptide transporter  26.83 
 
 		 451 aa  136  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1599  oligopeptide transporter  25.27 
 
 		 522 aa  130  8.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.941268  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1524  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  25.86 
 
 		 450 aa  130  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.868386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4137  amino acid/peptide transporter  26.14 
 
 		 437 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.728655  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4163  amino acid/peptide transporter  25.23 
 
 		 437 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.65473  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1248  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  25.93 
 
 		 513 aa  118  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0301309  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0404  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  26.02 
 
 		 434 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117264  hitchhiker  0.000442814 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4021  amino acid/peptide transporter  24.55 
 
 		 435 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.925576  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1274  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  23.35 
 
 		 517 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2411  proton/peptide symporter family protein  23.43 
 
 		 517 aa  102  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0002  proton/peptide symporter family protein  23.2 
 
 		 516 aa  100  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4030  amino acid/peptide transporter  24.02 
 
 		 515 aa  100  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2667  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  23.92 
 
 		 521 aa  99.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.63918  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3938  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  23.82 
 
 		 515 aa  99.4  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000127118 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0004  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  23.61 
 
 		 515 aa  98.2  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000099426 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3969  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  22.36 
 
 		 517 aa  96.3  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47148  predicted protein  23.06 
 
 		 775 aa  81.6  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  24.12 
 
 		 489 aa  77  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  24.12 
 
 		 489 aa  77  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  23.93 
 
 		 489 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  25.59 
 
 		 490 aa  73.9  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  23.25 
 
 		 491 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  23.94 
 
 		 490 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  28.77 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  22.55 
 
 		 461 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  24.54 
 
 		 489 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  28.04 
 
 		 484 aa  68.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  23.4 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  21.77 
 
 		 462 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  24.02 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2746  amino acid/peptide transporter  27.1 
 
 		 482 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210246  normal  0.74954 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  21.81 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  22.81 
 
 		 501 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  27.57 
 
 		 482 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  24.33 
 
 		 489 aa  66.6  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  27.68 
 
 		 558 aa  65.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  34.02 
 
 		 497 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  27.5 
 
 		 501 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  22.24 
 
 		 500 aa  64.3  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  22.31 
 
 		 461 aa  63.5  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  22.22 
 
 		 461 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  22.42 
 
 		 461 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  22.45 
 
 		 451 aa  63.5  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  22.22 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  22.22 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  22.22 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  22.22 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  22.22 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  22.03 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  22.03 
 
 		 461 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  28.16 
 
 		 497 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  22.29 
 
 		 489 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50811  POT family transporter: dipeptide/tripeptide:proton  21.3 
 
 		 449 aa  61.2  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.030888 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  30.53 
 
 		 497 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  20.41 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  25.89 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  30.05 
 
 		 509 aa  60.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  31.38 
 
 		 498 aa  60.1  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00673  oligopeptide transporter  25 
 
 		 284 aa  59.3  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.340061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  23.74 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  23.74 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  22.06 
 
 		 463 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4252  amino acid/peptide transporter  26.92 
 
 		 486 aa  58.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  22.52 
 
 		 501 aa  57  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  26.73 
 
 		 504 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17650  amino acid/peptide transporter (peptide:H symporter)  25.59 
 
 		 511 aa  57  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  28.42 
 
 		 495 aa  57  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  31.16 
 
 		 501 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  22.52 
 
 		 501 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  32.8 
 
 		 499 aa  55.8  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  27.81 
 
 		 498 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194.1  peptide transporter  31.88 
 
 		 324 aa  55.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  31.2 
 
 		 498 aa  54.7  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  22.22 
 
 		 449 aa  53.9  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  22.22 
 
 		 449 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0742  proton/peptide symporter family protein  34.74 
 
 		 395 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4685  amino acid/peptide transporter  22.64 
 
 		 485 aa  53.9  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04001  predicted transporter  22.64 
 
 		 485 aa  53.9  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03963  hypothetical protein  22.64 
 
 		 485 aa  53.9  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  34.74 
 
 		 449 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  20.57 
 
 		 449 aa  53.9  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4599  amino acid/peptide transporter  22.67 
 
 		 485 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.148198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1255  amino acid/peptide transporter  25.48 
 
 		 551 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  31.54 
 
 		 497 aa  53.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3261  amino acid/peptide transporter  25.65 
 
 		 506 aa  53.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0234728 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>