274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4021 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_4137  amino acid/peptide transporter  94.85 
 
 		 437 aa  763    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.728655  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4021  amino acid/peptide transporter  100 
 
 		 435 aa  858    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.925576  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4163  amino acid/peptide transporter  95.08 
 
 		 437 aa  763    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.65473  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0404  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  74.94 
 
 		 434 aa  568  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117264  hitchhiker  0.000442814 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0405  amino acid/peptide transporter  49.34 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0035417  hitchhiker  0.00401498 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4020  amino acid/peptide transporter  49.56 
 
 		 456 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.319297  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4162  amino acid/peptide transporter  49.12 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.790543  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4136  amino acid/peptide transporter  49.12 
 
 		 456 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2147  proton-dependent oligopeptide transporter family protein  44.06 
 
 		 478 aa  323  3e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1599  oligopeptide transporter  42.01 
 
 		 522 aa  311  2e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.941268  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1524  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  40.56 
 
 		 450 aa  305  8.000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.868386  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1248  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  34.4 
 
 		 513 aa  279  6e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0301309  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1598  amino acid/peptide transporter  38.74 
 
 		 451 aa  277  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2411  proton/peptide symporter family protein  36.08 
 
 		 517 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1274  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  33.41 
 
 		 517 aa  239  5.999999999999999e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0002  proton/peptide symporter family protein  45.1 
 
 		 516 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3938  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  45.1 
 
 		 515 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000127118 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4030  amino acid/peptide transporter  45.1 
 
 		 515 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0004  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  45.1 
 
 		 515 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000099426 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3969  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  44.61 
 
 		 517 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2667  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  43.06 
 
 		 521 aa  176  7e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.63918  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00673  oligopeptide transporter  44.83 
 
 		 284 aa  158  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.340061  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  30.93 
 
 		 504 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  28.22 
 
 		 446 aa  131  3e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  28.22 
 
 		 446 aa  131  3e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  28.5 
 
 		 432 aa  130  4.0000000000000003e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  28.57 
 
 		 471 aa  130  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03408  MFS peptide transporter Ptr2, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01490)  26.62 
 
 		 587 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  28.4 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  29.38 
 
 		 479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  28.4 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  28.15 
 
 		 461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47218  predicted protein  32.9 
 
 		 619 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.134275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  27.45 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  27.45 
 
 		 461 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  27.21 
 
 		 461 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  27.21 
 
 		 461 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  27.21 
 
 		 461 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  27.21 
 
 		 461 aa  123  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  27.21 
 
 		 461 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  27.21 
 
 		 461 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  27.21 
 
 		 461 aa  123  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  29.8 
 
 		 462 aa  122  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  25.89 
 
 		 499 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  27.67 
 
 		 463 aa  120  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70645  predicted protein  25.54 
 
 		 570 aa  119  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0413957  normal  0.317652 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  25.56 
 
 		 461 aa  117  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0510  permease  27.21 
 
 		 463 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  28.4 
 
 		 452 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  28.4 
 
 		 452 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  29.74 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  27.4 
 
 		 498 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  26.71 
 
 		 527 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  26.5 
 
 		 451 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  27.8 
 
 		 449 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  27.8 
 
 		 449 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  28.71 
 
 		 449 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  28.71 
 
 		 449 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  26.35 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0920  amino acid/peptide transporter  25.45 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000308736  unclonable  5.10372e-19 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  26.98 
 
 		 501 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  28.83 
 
 		 464 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  26.87 
 
 		 501 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  26.87 
 
 		 501 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66905  predicted protein  25.23 
 
 		 577 aa  106  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.705777 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  25.57 
 
 		 501 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0742  proton/peptide symporter family protein  29.08 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  27.87 
 
 		 490 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  27.21 
 
 		 484 aa  104  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  27.32 
 
 		 489 aa  104  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  26.43 
 
 		 491 aa  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  26.33 
 
 		 501 aa  103  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  28.22 
 
 		 463 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  26.79 
 
 		 490 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  25.21 
 
 		 489 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  25.21 
 
 		 489 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  25.53 
 
 		 489 aa  102  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  26.92 
 
 		 489 aa  101  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  22.99 
 
 		 497 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  23.36 
 
 		 501 aa  99.8  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  23.36 
 
 		 501 aa  99.8  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1525  di-/tripeptide transporter  25.64 
 
 		 528 aa  98.2  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0251804  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4613  amino acid/peptide transporter  26.46 
 
 		 445 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  27.7 
 
 		 496 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  31.4 
 
 		 497 aa  97.4  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  25.27 
 
 		 483 aa  97.8  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  26.05 
 
 		 482 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03345  predicted transporter  23.87 
 
 		 489 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.199197  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3785  inner membrane transporter YhiP  25.06 
 
 		 490 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0323752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03298  hypothetical protein  23.87 
 
 		 489 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.240113  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3978  inner membrane transporter YhiP  23.87 
 
 		 489 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3826  inner membrane transporter YhiP  23.87 
 
 		 489 aa  94.4  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4843  inner membrane transporter YhiP  23.87 
 
 		 489 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3785  inner membrane transporter YhiP  23.93 
 
 		 489 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0219  amino acid/peptide transporter  23.87 
 
 		 489 aa  94  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3696  inner membrane transporter YhiP  23.87 
 
 		 489 aa  94  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0220  inner membrane transporter YhiP  23.87 
 
 		 489 aa  94  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3966  inner membrane transporter YhiP  24.82 
 
 		 490 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.826151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3795  inner membrane transporter YhiP  24.82 
 
 		 490 aa  93.2  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3862  inner membrane transporter YhiP  24.82 
 
 		 490 aa  93.2  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31175  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>