299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1525 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1525  di-/tripeptide transporter  100 
 
 
528 aa  1059    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0251804  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0652  tripeptide permease TppB  99.6 
 
 
504 aa  1003    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.068993  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  46.91 
 
 
495 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3785  inner membrane transporter YhiP  46.79 
 
 
490 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0323752  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  47.05 
 
 
506 aa  436  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3785  inner membrane transporter YhiP  45.61 
 
 
489 aa  435  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03345  predicted transporter  45.4 
 
 
489 aa  434  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.199197  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0219  amino acid/peptide transporter  45.4 
 
 
489 aa  434  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3905  inner membrane transporter YhiP  46.58 
 
 
490 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3696  inner membrane transporter YhiP  45.4 
 
 
489 aa  434  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3795  inner membrane transporter YhiP  46.58 
 
 
490 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3978  inner membrane transporter YhiP  45.4 
 
 
489 aa  434  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3826  inner membrane transporter YhiP  45.4 
 
 
489 aa  435  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3862  inner membrane transporter YhiP  46.58 
 
 
490 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31175  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4843  inner membrane transporter YhiP  45.4 
 
 
489 aa  434  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3966  inner membrane transporter YhiP  46.58 
 
 
490 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.826151  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0220  inner membrane transporter YhiP  45.4 
 
 
489 aa  434  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03298  hypothetical protein  45.4 
 
 
489 aa  434  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.240113  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1549  putative tripeptide transporter permease  46.99 
 
 
501 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.507438  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1622  putative tripeptide transporter permease  47.08 
 
 
501 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.185719  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  46.6 
 
 
506 aa  431  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1722  putative tripeptide transporter permease  47.08 
 
 
501 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00217506  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1562  putative tripeptide transporter permease  47.08 
 
 
501 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0485322  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1890  putative tripeptide transporter permease  47.08 
 
 
501 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1995  putative tripeptide transporter permease  48 
 
 
500 aa  427  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46141  normal  0.0309863 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01604  putative tripeptide transporter permease  48 
 
 
500 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00542523  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01594  hypothetical protein  48 
 
 
500 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00471162  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2006  amino acid/peptide transporter  48 
 
 
500 aa  427  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0749107  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1824  putative tripeptide transporter permease  48 
 
 
500 aa  426  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  48 
 
 
500 aa  427  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1844  putative tripeptide transporter permease  48 
 
 
500 aa  426  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345542  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1814  putative tripeptide transporter permease  47.58 
 
 
502 aa  428  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000684589  decreased coverage  0.000347242 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1565  putative tripeptide transporter permease  48 
 
 
500 aa  427  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2346  putative tripeptide transporter permease  47.58 
 
 
500 aa  423  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0609489  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1886  putative tripeptide transporter permease  47.72 
 
 
511 aa  422  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348979  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1778  putative tripeptide transporter permease  47.72 
 
 
501 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2548  putative tripeptide transporter permease  47.72 
 
 
488 aa  421  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2233  putative tripeptide transporter permease  46.12 
 
 
506 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000348133 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0509  putative tripeptide transporter permease  46.14 
 
 
514 aa  410  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2992  amino acid/peptide transporter  40.83 
 
 
516 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0360187  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3261  amino acid/peptide transporter  41.82 
 
 
506 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0234728 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3089  amino acid/peptide transporter  40.83 
 
 
516 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000368989  normal  0.0911268 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1102  amino acid/peptide transporter  41.27 
 
 
546 aa  391  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4508  amino acid/peptide transporter  41.27 
 
 
507 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182547  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2910  amino acid/peptide transporter  40.63 
 
 
516 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.380758  normal  0.476442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3183  amino acid/peptide transporter  41.07 
 
 
517 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0376329 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1277  proton-dependent oligopeptide transporter (POT) family protein  41.82 
 
 
516 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1117  amino acid/peptide transporter  40.87 
 
 
523 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1207  amino acid/peptide transporter  41.07 
 
 
517 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0390922  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5415  amino acid/peptide transporter  41.63 
 
 
506 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1255  amino acid/peptide transporter  40.2 
 
 
551 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0113  amino acid/peptide transporter  41.82 
 
 
506 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4868  amino acid/peptide transporter  41.63 
 
 
507 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1174  amino acid/peptide transporter  41.41 
 
 
521 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.211879  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3023  amino acid/peptide transporter  40.77 
 
 
500 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4728  amino acid/peptide transporter  41.77 
 
 
506 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2907  amino acid/peptide transporter  40.77 
 
 
500 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0348  amino acid/peptide transporter  40.57 
 
 
500 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.781642  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2221  amino acid/peptide transporter  40.57 
 
 
551 aa  375  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5316  amino acid/peptide transporter  41.98 
 
 
506 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179594  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0382  amino acid/peptide transporter  40.57 
 
 
500 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5544  amino acid/peptide transporter  41.98 
 
 
506 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1531  amino acid/peptide transporter  40.57 
 
 
500 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1721  amino acid/peptide transporter  40.57 
 
 
500 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97984  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2851  hypothetical protein  42.55 
 
 
500 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2720  hypothetical protein  42.34 
 
 
500 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0759  major facilitator superfamily peptide/H(+)symporter  41.74 
 
 
513 aa  369  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1177  proton-dependent oligopeptide transporter (POT) family protein  41.12 
 
 
506 aa  365  1e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.980946  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4440  amino acid/peptide transporter  41.86 
 
 
513 aa  361  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1189  amino acid/peptide transporter  35.92 
 
 
501 aa  269  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.500547 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  32.19 
 
 
516 aa  238  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  30.86 
 
 
527 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  31.6 
 
 
516 aa  232  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0783  di/tripeptide transporter homolog IraB  32.29 
 
 
502 aa  230  4e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0812  di/tripeptide transporter homolog IraB  32.08 
 
 
502 aa  230  6e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  32.51 
 
 
492 aa  226  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  32.51 
 
 
492 aa  225  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  30.43 
 
 
509 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  31.91 
 
 
507 aa  217  4e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  30.06 
 
 
534 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  30.34 
 
 
544 aa  214  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  28.65 
 
 
539 aa  210  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  28.43 
 
 
539 aa  210  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  28.24 
 
 
539 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  28.65 
 
 
539 aa  209  9e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  31.97 
 
 
499 aa  206  8e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  29.31 
 
 
495 aa  205  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  29.96 
 
 
498 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  27.54 
 
 
499 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  29.96 
 
 
510 aa  204  3e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  28.95 
 
 
497 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  30.22 
 
 
510 aa  204  3e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  31 
 
 
497 aa  202  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  28.4 
 
 
498 aa  202  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  29.69 
 
 
544 aa  200  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  29.85 
 
 
496 aa  200  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  28.14 
 
 
501 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  28.95 
 
 
497 aa  197  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  29.66 
 
 
462 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  28.9 
 
 
497 aa  196  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>