270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0163 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0163  amino acid/peptide transporter  100 
 
 		 707 aa  1419    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0078  amino acid/peptide transporter  58.61 
 
 		 603 aa  542  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0374  amino acid/peptide transporter  37.96 
 
 		 627 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1088  amino acid/peptide transporter  33.74 
 
 		 584 aa  287  5e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2239  amino acid/peptide transporter  37.04 
 
 		 603 aa  256  9e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478529  normal  0.0257492 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  36.08 
 
 		 544 aa  221  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  37.62 
 
 		 544 aa  220  6e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  32.86 
 
 		 516 aa  208  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  34.75 
 
 		 516 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2903  amino acid/peptide transporter  31.14 
 
 		 584 aa  194  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422026 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  34.55 
 
 		 539 aa  190  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  34.55 
 
 		 539 aa  190  8e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  34.55 
 
 		 539 aa  190  9e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  33.82 
 
 		 539 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  30.28 
 
 		 483 aa  172  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  30.63 
 
 		 534 aa  151  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0196  amino acid/peptide transporter  28.48 
 
 		 566 aa  148  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  37.18 
 
 		 527 aa  134  6e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  36.64 
 
 		 462 aa  127  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  39.72 
 
 		 501 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  41.21 
 
 		 498 aa  121  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  36.91 
 
 		 510 aa  120  7.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  37.09 
 
 		 462 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  36.09 
 
 		 451 aa  117  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  34.32 
 
 		 499 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  37.72 
 
 		 499 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  34.36 
 
 		 497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  28.89 
 
 		 533 aa  115  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  38.33 
 
 		 510 aa  115  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  38.79 
 
 		 489 aa  114  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  28.42 
 
 		 495 aa  114  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  26.45 
 
 		 498 aa  114  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  34.39 
 
 		 444 aa  114  7.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  34.31 
 
 		 432 aa  114  8.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  36.92 
 
 		 490 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  26.19 
 
 		 497 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  36.92 
 
 		 501 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  36.92 
 
 		 501 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  37.38 
 
 		 489 aa  112  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  36.45 
 
 		 501 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  36.68 
 
 		 501 aa  112  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  36.92 
 
 		 489 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  36.92 
 
 		 489 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  37.85 
 
 		 490 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0920  amino acid/peptide transporter  35.71 
 
 		 436 aa  110  9.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000308736  unclonable  5.10372e-19 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  36.45 
 
 		 491 aa  110  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0113  amino acid/peptide transporter  27.63 
 
 		 506 aa  110  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  34.82 
 
 		 471 aa  109  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  29.47 
 
 		 520 aa  108  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  35.51 
 
 		 500 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  35.67 
 
 		 494 aa  108  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  33.33 
 
 		 461 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  33.33 
 
 		 461 aa  107  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0799  amino acid/peptide transporter  26.84 
 
 		 493 aa  107  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.256216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2946  amino acid/peptide transporter  26.5 
 
 		 493 aa  106  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.701623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  27.65 
 
 		 524 aa  107  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0626  amino acid/peptide transporter  26.84 
 
 		 493 aa  106  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  33.33 
 
 		 461 aa  107  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0724  amino acid/peptide transporter  26.84 
 
 		 493 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.470702  normal  0.430255 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  29.81 
 
 		 461 aa  106  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  36.45 
 
 		 489 aa  106  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00669  predicted transporter  26.84 
 
 		 493 aa  105  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00658  hypothetical protein  26.84 
 
 		 493 aa  105  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0734  amino acid/peptide transporter  26.43 
 
 		 493 aa  104  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2927  amino acid/peptide transporter  26.09 
 
 		 493 aa  104  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  30.81 
 
 		 497 aa  104  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0757  amino acid/peptide transporter  26.09 
 
 		 493 aa  104  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  39.89 
 
 		 502 aa  103  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3766  amino acid/peptide transporter  30.65 
 
 		 482 aa  103  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000840749  normal  0.111557 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  29.25 
 
 		 461 aa  103  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  40.28 
 
 		 463 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  32.43 
 
 		 496 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  51.09 
 
 		 558 aa  102  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194.1  peptide transporter  51.46 
 
 		 324 aa  102  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  29.25 
 
 		 461 aa  101  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  29.25 
 
 		 461 aa  101  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0510  permease  39.58 
 
 		 463 aa  102  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  29.25 
 
 		 461 aa  101  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  29.25 
 
 		 461 aa  101  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  29.25 
 
 		 461 aa  101  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  29.25 
 
 		 461 aa  101  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  29.25 
 
 		 461 aa  101  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  31.2 
 
 		 497 aa  100  8e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1438  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  34.09 
 
 		 683 aa  100  9e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1333  hypothetical protein  40.15 
 
 		 480 aa  99.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1329  hypothetical protein  40.15 
 
 		 480 aa  99  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  31.43 
 
 		 517 aa  99.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0348  amino acid/peptide transporter  25.74 
 
 		 500 aa  99  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.781642  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  49.02 
 
 		 504 aa  99  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1531  amino acid/peptide transporter  25.74 
 
 		 500 aa  99  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1721  amino acid/peptide transporter  25.74 
 
 		 500 aa  99  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97984  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0382  amino acid/peptide transporter  25.74 
 
 		 500 aa  99  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3023  amino acid/peptide transporter  26.01 
 
 		 500 aa  97.8  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2907  amino acid/peptide transporter  26.01 
 
 		 500 aa  97.8  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  51.02 
 
 		 479 aa  97.8  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4440  amino acid/peptide transporter  46.3 
 
 		 513 aa  97.8  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  30.23 
 
 		 506 aa  97.4  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  29.17 
 
 		 495 aa  96.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0759  major facilitator superfamily peptide/H(+)symporter  43.75 
 
 		 513 aa  97.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  28.97 
 
 		 461 aa  97.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>