223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_37839 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_37839  predicted protein  100 
 
 		 488 aa  997    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.350145  normal  0.85819 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32433  predicted protein  51.22 
 
 		 488 aa  517  1.0000000000000001e-145  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0387014  normal  0.485977 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36445  predicted protein  50 
 
 		 474 aa  498  1e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0311033  normal  0.112227 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09289  conserved hypothetical protein  38.49 
 
 		 524 aa  372  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.916138 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04173  conserved hypothetical protein  39.23 
 
 		 516 aa  340  2e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0570265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43272  predicted protein  32.4 
 
 		 540 aa  288  2e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.639575  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04482  sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03500)  31.44 
 
 		 579 aa  249  7e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.289204 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11167  sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01740)  31.42 
 
 		 521 aa  227  3e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.760659  normal  0.519488 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11196  conserved hypothetical protein  31.76 
 
 		 553 aa  227  4e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04480  membrane transporter, putative  27.66 
 
 		 648 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0251444  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 447 aa  107  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 		 451 aa  94.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  25 
 
 		 438 aa  94.4  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  23.23 
 
 		 464 aa  94  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  25.05 
 
 		 438 aa  94  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 		 446 aa  90.1  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 		 473 aa  89.7  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38010  MFS family transporter: sugar  24.27 
 
 		 576 aa  86.7  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.286894 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  24.83 
 
 		 526 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  23.29 
 
 		 456 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  23.42 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  23.52 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  23.75 
 
 		 436 aa  76.6  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  23.21 
 
 		 468 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  22.97 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  23.48 
 
 		 436 aa  75.1  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  22.84 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  20.48 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  23.13 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  22.34 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  22.34 
 
 		 462 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  23.67 
 
 		 435 aa  69.7  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  23.83 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  23.73 
 
 		 449 aa  67.8  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  22.54 
 
 		 473 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  22.27 
 
 		 485 aa  65.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  22.05 
 
 		 450 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  23.24 
 
 		 465 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  22.62 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  23.22 
 
 		 460 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  23.76 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  23.76 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  23.76 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  23.76 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  23.55 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  23.9 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  23.76 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  22.89 
 
 		 468 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  23.76 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  23.23 
 
 		 474 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  23.62 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  23.55 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  21.21 
 
 		 470 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  22.96 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  22.49 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  20.09 
 
 		 470 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  23.34 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1885  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 454 aa  61.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  22.65 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  22.35 
 
 		 476 aa  60.8  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  21.57 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  22.44 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1189  major facilitator transporter  23.15 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00252456  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1266  major facilitator transporter  23.15 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.693096  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  22.1 
 
 		 473 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  23.14 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  23.08 
 
 		 438 aa  59.3  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  22.46 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  23 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  24.44 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  22.39 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  21.37 
 
 		 474 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 		 472 aa  57  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  21.3 
 
 		 451 aa  57  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  22.07 
 
 		 480 aa  57  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 446 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3242  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 539 aa  56.2  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00325514  normal  0.76951 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 		 445 aa  56.6  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  23.29 
 
 		 457 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  22.05 
 
 		 462 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  22.35 
 
 		 459 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 438 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  22.96 
 
 		 459 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  23.02 
 
 		 490 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2054  inner membrane metabolite transport protein YdjE  20.44 
 
 		 452 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0842085 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4791  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 492 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263491  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  25.11 
 
 		 477 aa  54.7  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  22.64 
 
 		 451 aa  53.9  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3815  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 446 aa  53.9  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203479 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  23.46 
 
 		 476 aa  53.5  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  21.8 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  23.41 
 
 		 597 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  20.75 
 
 		 462 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  22.39 
 
 		 509 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>