More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF04480 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006691  CNF04480  membrane transporter, putative  100 
 
 		 648 aa  1327    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0251444  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04482  sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03500)  34.22 
 
 		 579 aa  196  9e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.289204 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11196  conserved hypothetical protein  34.81 
 
 		 553 aa  159  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43272  predicted protein  33.69 
 
 		 540 aa  154  5e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.639575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36445  predicted protein  34.91 
 
 		 474 aa  149  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0311033  normal  0.112227 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32433  predicted protein  31.87 
 
 		 488 aa  146  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0387014  normal  0.485977 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11167  sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01740)  31.71 
 
 		 521 aa  144  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.760659  normal  0.519488 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04173  conserved hypothetical protein  27.37 
 
 		 516 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0570265  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09289  conserved hypothetical protein  27.76 
 
 		 524 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.916138 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37839  predicted protein  27.97 
 
 		 488 aa  116  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.350145  normal  0.85819 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 459 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 464 aa  108  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 447 aa  103  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  27.14 
 
 		 526 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 438 aa  102  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 437 aa  101  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  27.92 
 
 		 438 aa  99.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  32 
 
 		 399 aa  92  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  32 
 
 		 399 aa  92  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  32 
 
 		 399 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  32 
 
 		 399 aa  90.1  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  32 
 
 		 399 aa  90.1  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  32 
 
 		 399 aa  90.1  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  32 
 
 		 399 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 399 aa  89.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 450 aa  87.4  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 399 aa  87  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  29.89 
 
 		 399 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  30.86 
 
 		 399 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  30.74 
 
 		 451 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 447 aa  84  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 473 aa  84  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 436 aa  83.2  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38010  MFS family transporter: sugar  28.71 
 
 		 576 aa  82.4  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.286894 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1548  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  28.18 
 
 		 454 aa  80.9  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_2917  MFS family transporter  25.7 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.174481  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  29 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  29.07 
 
 		 436 aa  79.3  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  25.11 
 
 		 465 aa  79.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  29.07 
 
 		 436 aa  79.3  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 465 aa  78.6  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1414  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  29 
 
 		 453 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  29 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  29 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 		 470 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  26.54 
 
 		 476 aa  77  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 456 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  29 
 
 		 453 aa  77  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  33.11 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  25.75 
 
 		 456 aa  75.1  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 436 aa  74.3  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  27.59 
 
 		 461 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3242  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 		 539 aa  73.9  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00325514  normal  0.76951 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  25.35 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  27.83 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 466 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.52 
 
 		 472 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  27.43 
 
 		 449 aa  73.2  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 437 aa  72.8  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1885  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 454 aa  73.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 472 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  27.31 
 
 		 485 aa  73.2  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 480 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 480 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 460 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  27.68 
 
 		 501 aa  70.9  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 492 aa  70.5  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 492 aa  70.5  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  25.5 
 
 		 459 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 438 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  28.8 
 
 		 478 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 473 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 474 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0341  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 449 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  27.11 
 
 		 477 aa  68.9  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 451 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 485 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 461 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  25.76 
 
 		 462 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  26.34 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  28.57 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1266  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.693096  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1010  major facilitator family transporter  28.73 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 474 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  25.71 
 
 		 469 aa  67.8  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  26.12 
 
 		 478 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 483 aa  67.4  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>