280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_43272 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_43272  predicted protein  100 
 
 		 540 aa  1092    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.639575  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11167  sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01740)  45.72 
 
 		 521 aa  409  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.760659  normal  0.519488 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04482  sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03500)  41.41 
 
 		 579 aa  377  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.289204 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09289  conserved hypothetical protein  37.29 
 
 		 524 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.916138 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11196  conserved hypothetical protein  39.14 
 
 		 553 aa  346  6e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36445  predicted protein  36.02 
 
 		 474 aa  310  5e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0311033  normal  0.112227 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32433  predicted protein  35.05 
 
 		 488 aa  305  9.000000000000001e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0387014  normal  0.485977 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04173  conserved hypothetical protein  35.45 
 
 		 516 aa  302  9e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0570265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37839  predicted protein  32.4 
 
 		 488 aa  288  2.9999999999999996e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.350145  normal  0.85819 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 459 aa  156  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04480  membrane transporter, putative  34.21 
 
 		 648 aa  151  4e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0251444  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 464 aa  137  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  27.42 
 
 		 438 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 450 aa  125  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 438 aa  121  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 437 aa  120  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  26.14 
 
 		 526 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 451 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 447 aa  116  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 451 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 450 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  25.1 
 
 		 436 aa  101  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  25.1 
 
 		 436 aa  101  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 436 aa  99.4  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  23.31 
 
 		 451 aa  99.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  25.75 
 
 		 469 aa  95.5  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 457 aa  91.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 437 aa  91.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  25.32 
 
 		 456 aa  90.9  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 436 aa  90.9  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38010  MFS family transporter: sugar  27 
 
 		 576 aa  91.3  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.286894 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  25.25 
 
 		 476 aa  90.1  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 465 aa  89.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 474 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 473 aa  87.8  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 		 472 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  24.02 
 
 		 459 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 447 aa  84  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 473 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1266  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.693096  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 382 aa  83.2  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  24.71 
 
 		 472 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1189  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 422 aa  83.2  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00252456  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 473 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  26.05 
 
 		 485 aa  80.5  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  22.18 
 
 		 455 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 474 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  23.22 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 479 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  25.23 
 
 		 478 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 474 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  25.23 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  25.23 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 415 aa  76.3  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  25.23 
 
 		 478 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  25.65 
 
 		 478 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  24.3 
 
 		 478 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  25.23 
 
 		 478 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 474 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  25.23 
 
 		 478 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 		 467 aa  73.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 		 467 aa  73.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  24.93 
 
 		 467 aa  74.3  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 		 456 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  26.34 
 
 		 449 aa  71.2  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  36.73 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4244  major facilitator transporter  23.93 
 
 		 467 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1414  major facilitator transporter  23.17 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  22.14 
 
 		 470 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  27.79 
 
 		 477 aa  67.4  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  22.99 
 
 		 446 aa  67  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 422 aa  67  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  23.2 
 
 		 459 aa  66.6  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5470  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46251  predicted protein  23.01 
 
 		 564 aa  65.1  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.164515  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  23.82 
 
 		 481 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 480 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 480 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  37.5 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  37.5 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  37.5 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  37.5 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  37.5 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  37.5 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  37.5 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  37.5 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  37.5 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  35.65 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  24.87 
 
 		 468 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1010  major facilitator family transporter  26.03 
 
 		 398 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82453  inorganic phosphate transporter, transmembrane protein  24.71 
 
 		 555 aa  63.2  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.10716  normal  0.589163 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  25.72 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 487 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  25.72 
 
 		 433 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>