More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_36445 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_32433  predicted protein  76.37 
 
 		 488 aa  762    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0387014  normal  0.485977 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36445  predicted protein  100 
 
 		 474 aa  968    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0311033  normal  0.112227 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37839  predicted protein  50 
 
 		 488 aa  498  1e-140  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.350145  normal  0.85819 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09289  conserved hypothetical protein  48.42 
 
 		 524 aa  449  1e-125  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.916138 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04173  conserved hypothetical protein  43.36 
 
 		 516 aa  380  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0570265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43272  predicted protein  36.02 
 
 		 540 aa  310  4e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.639575  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11196  conserved hypothetical protein  33.54 
 
 		 553 aa  258  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11167  sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01740)  33.05 
 
 		 521 aa  255  1.0000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.760659  normal  0.519488 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04482  sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03500)  33.06 
 
 		 579 aa  253  7e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.289204 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04480  membrane transporter, putative  34.91 
 
 		 648 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0251444  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 459 aa  124  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 464 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 447 aa  111  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  25.11 
 
 		 473 aa  99.4  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  24.6 
 
 		 526 aa  95.5  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  24.61 
 
 		 451 aa  94.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  24.66 
 
 		 455 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 438 aa  92.8  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  24.44 
 
 		 455 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 437 aa  90.9  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  24.31 
 
 		 436 aa  90.5  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  25.11 
 
 		 476 aa  90.1  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  23.7 
 
 		 438 aa  87.8  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  24.54 
 
 		 450 aa  87  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 473 aa  86.7  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  24.88 
 
 		 449 aa  86.3  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  27.03 
 
 		 459 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 474 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 474 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  25 
 
 		 457 aa  85.9  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 474 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 		 435 aa  83.6  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  24.09 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  24.04 
 
 		 472 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  23.5 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 472 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  23.5 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  23.5 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  23.5 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  23.5 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  23.5 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 451 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  23.22 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  23.22 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 474 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 465 aa  79.7  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  22.57 
 
 		 456 aa  79.7  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  23.77 
 
 		 470 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38010  MFS family transporter: sugar  22.46 
 
 		 576 aa  79  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.286894 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  22.98 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  22.98 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  22.45 
 
 		 468 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  22.45 
 
 		 473 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  22.37 
 
 		 462 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  23.83 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 		 447 aa  76.6  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  20.75 
 
 		 468 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  25 
 
 		 473 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  22.02 
 
 		 456 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 438 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  23.38 
 
 		 474 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  24.1 
 
 		 478 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  24.1 
 
 		 478 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  22.32 
 
 		 462 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  24.1 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  24.1 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1189  major facilitator transporter  23.47 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00252456  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  24.1 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  24.1 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  24.1 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1266  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.693096  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  22.57 
 
 		 459 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  28.51 
 
 		 492 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  23.64 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  23.91 
 
 		 477 aa  72.4  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 492 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  24.82 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4791  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 492 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263491  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  22.9 
 
 		 436 aa  68.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5470  major facilitator transporter  23.36 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  22.84 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 484 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 445 aa  67  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2604  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 467 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.792684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 490 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2499  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 465 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728984 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  24.14 
 
 		 460 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  22.3 
 
 		 481 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2580  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 467 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  22.74 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2628  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 465 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1969  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 467 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>