More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46568 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_46568  predicted protein  100 
 
 
821 aa  1675    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.927409  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31786  peroxisomal assembly protein  43.7 
 
 
1178 aa  268  2e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03110  hypothetical protein  46.36 
 
 
1124 aa  266  2e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02925  microbody (peroxisome) biogenesis protein peroxin 6 (Eurofung)  46.71 
 
 
1476 aa  257  5e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.637827  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  32.08 
 
 
810 aa  212  2e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  41.04 
 
 
804 aa  209  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  40.25 
 
 
814 aa  209  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.38 
 
 
759 aa  204  7e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.03 
 
 
736 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.1 
 
 
718 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.13 
 
 
735 aa  201  5e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  39.14 
 
 
756 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  39.48 
 
 
754 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.22 
 
 
738 aa  197  6e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.01 
 
 
732 aa  195  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.58 
 
 
754 aa  196  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  46.96 
 
 
722 aa  195  3e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.06 
 
 
737 aa  194  5e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  54.64 
 
 
808 aa  194  5e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.73 
 
 
742 aa  194  7e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.51 
 
 
736 aa  193  1e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.14 
 
 
737 aa  193  1e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  38.51 
 
 
550 aa  192  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.73 
 
 
740 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.06 
 
 
743 aa  192  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.55 
 
 
727 aa  191  4e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.91 
 
 
738 aa  191  5e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.1 
 
 
757 aa  191  5.999999999999999e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.34 
 
 
719 aa  191  7e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.87 
 
 
754 aa  190  9e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  42.16 
 
 
806 aa  189  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.06 
 
 
740 aa  189  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.23 
 
 
754 aa  190  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.74 
 
 
742 aa  190  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.55 
 
 
738 aa  189  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.22 
 
 
760 aa  189  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.34 
 
 
721 aa  189  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.8 
 
 
801 aa  188  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  38.63 
 
 
829 aa  188  4e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.21 
 
 
709 aa  187  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.26 
 
 
723 aa  187  7e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.42 
 
 
739 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  40.92 
 
 
691 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.82 
 
 
806 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  38.23 
 
 
832 aa  184  5.0000000000000004e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.190339 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01366  AAA family ATPase/60S ribosome export protein Rix7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09210)  36.65 
 
 
729 aa  183  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  0.790284 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.39 
 
 
800 aa  183  1e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50 
 
 
784 aa  183  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_41850  predicted protein  32.58 
 
 
685 aa  183  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  49.73 
 
 
810 aa  182  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.81 
 
 
731 aa  182  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50 
 
 
781 aa  182  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.87 
 
 
754 aa  182  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.94 
 
 
781 aa  181  7e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.28 
 
 
715 aa  181  7e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.01 
 
 
769 aa  180  8e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  38.26 
 
 
775 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.85 
 
 
731 aa  179  1e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.99 
 
 
731 aa  179  1e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.6 
 
 
731 aa  179  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.74 
 
 
805 aa  179  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.86 
 
 
753 aa  178  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  41.2 
 
 
732 aa  178  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.09 
 
 
701 aa  178  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  44.07 
 
 
930 aa  177  7e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06230  conserved hypothetical protein  43.97 
 
 
1076 aa  177  8e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.16 
 
 
768 aa  177  8e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.28 
 
 
756 aa  177  8e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.57 
 
 
773 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  50.56 
 
 
718 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.74 
 
 
805 aa  174  5.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  50.55 
 
 
713 aa  173  1e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.39 
 
 
763 aa  173  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  35.53 
 
 
703 aa  172  3e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  41.3 
 
 
613 aa  172  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.7 
 
 
852 aa  171  6e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23826  predicted protein  38.41 
 
 
552 aa  171  7e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.73 
 
 
810 aa  169  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  34.94 
 
 
763 aa  169  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  38.49 
 
 
826 aa  169  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.89 
 
 
804 aa  169  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83848  AAA ATPase, peroxisomal biogenesis  48.31 
 
 
1053 aa  169  2.9999999999999998e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.979611  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  36.69 
 
 
764 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.7 
 
 
704 aa  168  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  40.25 
 
 
407 aa  167  9e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05991  peroxisome biogenesis protein peroxin 1 (Eurofung)  43.3 
 
 
1225 aa  166  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.453589 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  39.83 
 
 
407 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  31.74 
 
 
639 aa  166  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.91 
 
 
772 aa  164  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.2 
 
 
757 aa  164  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0436  Adenosinetriphosphatase  39.55 
 
 
749 aa  163  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.544283 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  39.41 
 
 
407 aa  163  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.63 
 
 
801 aa  161  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  40 
 
 
739 aa  161  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0432  Microtubule-severing ATPase  47.47 
 
 
734 aa  161  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0369558  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  36.36 
 
 
803 aa  161  5e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  36.36 
 
 
405 aa  161  5e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.18 
 
 
730 aa  160  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  34.85 
 
 
599 aa  160  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.82 
 
 
757 aa  159  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>