More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43349 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43349  predicted protein  100 
 
 		 651 aa  1334    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15280  predicted protein  28.37 
 
 		 534 aa  192  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  27.66 
 
 		 1831 aa  106  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  28.04 
 
 		 1454 aa  98.2  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  26.77 
 
 		 1247 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  32.63 
 
 		 1193 aa  90.5  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  27.48 
 
 		 1523 aa  89  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  32.54 
 
 		 1188 aa  88.6  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  29.88 
 
 		 696 aa  85.1  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  29.11 
 
 		 1188 aa  84.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  27.36 
 
 		 1236 aa  84.3  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  31.5 
 
 		 1161 aa  84  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  33.5 
 
 		 1183 aa  84  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  31.5 
 
 		 1161 aa  84  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  26.33 
 
 		 947 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.75 
 
 		 1363 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  31.21 
 
 		 778 aa  82.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  29.13 
 
 		 1364 aa  82  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 1474 aa  82  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  28.07 
 
 		 1196 aa  80.5  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.07 
 
 		 677 aa  80.5  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  26.38 
 
 		 774 aa  80.1  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  30.06 
 
 		 1652 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  30.49 
 
 		 316 aa  79.3  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  29.2 
 
 		 742 aa  79  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.36 
 
 		 676 aa  79.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  25.36 
 
 		 1807 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.16 
 
 		 740 aa  79.3  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  29.89 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  22.99 
 
 		 1208 aa  77.4  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  30.18 
 
 		 589 aa  77  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.91 
 
 		 698 aa  75.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.84 
 
 		 630 aa  75.1  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  30.32 
 
 		 1901 aa  75.1  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  27.04 
 
 		 1213 aa  74.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  24.91 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  27.27 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  26.32 
 
 		 657 aa  73.6  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  22.61 
 
 		 1868 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  28.32 
 
 		 589 aa  73.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  28.64 
 
 		 1190 aa  73.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01208  Pre-mRNA-splicing factor prp46 (Pre-mRNA-processing protein 46) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BE22]  22.86 
 
 		 452 aa  73.2  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  32.92 
 
 		 1217 aa  73.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  30.57 
 
 		 1443 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05450  conserved hypothetical protein  29.41 
 
 		 523 aa  72.4  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.723357  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  27.98 
 
 		 1242 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.23 
 
 		 1686 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3581  WD40 domain-containing protein  29.81 
 
 		 334 aa  73.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  32 
 
 		 1214 aa  72.8  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  28.65 
 
 		 317 aa  72  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  25.63 
 
 		 505 aa  72  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.76 
 
 		 930 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  28.19 
 
 		 522 aa  71.2  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.14 
 
 		 1557 aa  71.2  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.32 
 
 		 636 aa  70.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  34.13 
 
 		 1789 aa  70.9  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  26.9 
 
 		 728 aa  70.5  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 1221 aa  70.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  30.23 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  27.18 
 
 		 1330 aa  70.5  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  24.76 
 
 		 1878 aa  70.1  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36759  protein required for amino acid permease transport from the Golgi to the cell surface  27.18 
 
 		 318 aa  70.5  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  29.23 
 
 		 344 aa  70.1  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2798  WD40 domain-containing protein  28.29 
 
 		 597 aa  70.1  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.85 
 
 		 576 aa  70.5  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25989  predicted protein  32.26 
 
 		 215 aa  69.3  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  27.33 
 
 		 1163 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2302  WD-40 repeat protein  30.46 
 
 		 1142 aa  69.7  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.616134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  29.23 
 
 		 344 aa  69.7  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.64 
 
 		 682 aa  69.7  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  26.64 
 
 		 954 aa  68.9  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  28.57 
 
 		 564 aa  68.6  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.95 
 
 		 596 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  30.26 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50593  predicted protein  25.45 
 
 		 617 aa  68.6  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.594901  normal  0.592668 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  27.06 
 
 		 1211 aa  68.2  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  31.47 
 
 		 1176 aa  68.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  28.08 
 
 		 565 aa  68.6  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  28.49 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  27.44 
 
 		 1416 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  26.19 
 
 		 578 aa  68.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.2 
 
 		 608 aa  68.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_50173  predicted protein  25.95 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.828985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.01 
 
 		 664 aa  68.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32128  predicted protein  24.42 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599879 
 
 
-
 
NC_006686  CND02590  conserved hypothetical protein  25.13 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  31.71 
 
 		 464 aa  67.8  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.64 
 
 		 692 aa  67.8  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  26.87 
 
 		 687 aa  67.4  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  29.71 
 
 		 1041 aa  67.4  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  30.98 
 
 		 1510 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.8 
 
 		 1262 aa  67  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.48 
 
 		 1599 aa  67  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.42 
 
 		 733 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  27.74 
 
 		 1164 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.46 
 
 		 1823 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.69 
 
 		 1481 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  29.03 
 
 		 1264 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  29.03 
 
 		 1264 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03370  ubiquitin-protein ligase, putative  26.22 
 
 		 928 aa  66.2  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.307571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>