262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3682 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1432  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  45.78 
 
 		 763 aa  680    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0306  hydrogenase maturation protein HypF  44.35 
 
 		 763 aa  649    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2593  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  53.25 
 
 		 773 aa  804    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0462  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.66 
 
 		 790 aa  642    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.336397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1950  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.43 
 
 		 756 aa  639    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0119  hydrogenase maturation protein HypF  43.08 
 
 		 760 aa  639    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0111799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2551  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.56 
 
 		 770 aa  647    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.102731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3291  hydrogenase maturation protein HypF  44.2 
 
 		 776 aa  641    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1214  hydrogenase maturation protein HypF  45.52 
 
 		 763 aa  671    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1240  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.6 
 
 		 763 aa  674    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3682  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  100 
 
 		 780 aa  1620    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2780  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.26 
 
 		 780 aa  659    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1218  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.02 
 
 		 762 aa  687    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0610478 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2526  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  62.56 
 
 		 780 aa  1018    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.908669  normal  0.241645 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3588  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  62.76 
 
 		 776 aa  1033    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3070  hydrogenase maturation protein HypF  43.94 
 
 		 776 aa  634  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3313  hydrogenase maturation protein HypF  43.94 
 
 		 776 aa  634  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3132  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.36 
 
 		 758 aa  630  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1130  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.97 
 
 		 758 aa  629  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03890  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.38 
 
 		 751 aa  629  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4013  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.38 
 
 		 770 aa  625  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4514  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.64 
 
 		 788 aa  625  1e-178  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47049 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0533  hydrogenase maturation protein HypF  41.93 
 
 		 749 aa  622  1e-176  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.515959  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2051  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.89 
 
 		 849 aa  617  1e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07990  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.82 
 
 		 762 aa  612  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.442936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0476  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.97 
 
 		 773 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1847  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.68 
 
 		 779 aa  613  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.962683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1399  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.73 
 
 		 775 aa  609  1e-173  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.159442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0469  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.52 
 
 		 818 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.77158  normal  0.0779955 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1785  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.24 
 
 		 764 aa  610  1e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00144703  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0080  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.11 
 
 		 741 aa  608  9.999999999999999e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.442925  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00540  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.04 
 
 		 785 aa  607  9.999999999999999e-173  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.48639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0722  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.91 
 
 		 773 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.180457  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1101  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.21 
 
 		 744 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0792  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.26 
 
 		 785 aa  604  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3875  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.05 
 
 		 781 aa  600  1e-170  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0310  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.61 
 
 		 792 aa  600  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1787  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.55 
 
 		 766 aa  601  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0509  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.84 
 
 		 773 aa  595  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0504  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.58 
 
 		 773 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3065  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.72 
 
 		 740 aa  595  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.735347  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3230  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.71 
 
 		 783 aa  589  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2556  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.03 
 
 		 776 aa  588  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.34978  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3809  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.87 
 
 		 775 aa  586  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0483302  normal  0.0563214 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1764  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.72 
 
 		 767 aa  587  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4602  hydrogenase maturation protein HypF  42.23 
 
 		 786 aa  588  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0555  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.34 
 
 		 777 aa  585  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1643  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.78 
 
 		 778 aa  588  1e-166  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1903  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.02 
 
 		 783 aa  580  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745392 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1431  hydrogenase maturation protein HypF  41.19 
 
 		 742 aa  582  1e-164  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0518  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.06 
 
 		 781 aa  581  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0466  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.93 
 
 		 778 aa  579  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.252806  normal  0.0404368 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4584  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.43 
 
 		 774 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1760  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.74 
 
 		 781 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6177  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.83 
 
 		 784 aa  569  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  0.0868727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2123  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.06 
 
 		 752 aa  571  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0252603 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2179  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.75 
 
 		 767 aa  566  1e-160  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.474067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4555  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.14 
 
 		 785 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2028  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.5 
 
 		 800 aa  568  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7272  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.08 
 
 		 791 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.270214 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1910  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.68 
 
 		 838 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.402426  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1875  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.75 
 
 		 835 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3636  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.63 
 
 		 758 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2182  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.44 
 
 		 752 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.64195  normal  0.285243 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2094  hydrogenase maturation protein HypF  41.34 
 
 		 808 aa  561  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1817  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.64 
 
 		 836 aa  559  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0046  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.74 
 
 		 736 aa  560  1e-158  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.890039  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1945  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.15 
 
 		 816 aa  556  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2136  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.48 
 
 		 745 aa  557  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2160  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.81 
 
 		 840 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.66513 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1837  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.23 
 
 		 758 aa  558  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1674  hydrogenase maturation protein HypF  40.49 
 
 		 771 aa  555  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1884  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.63 
 
 		 837 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2355  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.16 
 
 		 852 aa  549  1e-155  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218654 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1668  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.3 
 
 		 770 aa  550  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1303  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.51 
 
 		 781 aa  550  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.083014  normal  0.0845078 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2409  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.6 
 
 		 840 aa  552  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0878931  hitchhiker  0.000263976 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3979  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.03 
 
 		 756 aa  551  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803247  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2394  hydrogenase maturation protein HypF  40.13 
 
 		 741 aa  548  1e-154  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3977  hydrogenase maturation protein HypF  40.77 
 
 		 763 aa  548  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2407  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.52 
 
 		 756 aa  548  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258708 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1917  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.31 
 
 		 840 aa  548  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.998639  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2539  hydrogenase maturation protein HypF  39.77 
 
 		 741 aa  544  1e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1175  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.92 
 
 		 763 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.311862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0471  carbamoyl phosphate phosphatase, (NiFe) hydrogenase maturation protein  37.75 
 
 		 824 aa  545  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0655217 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1645  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.34 
 
 		 773 aa  545  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4097  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.19 
 
 		 789 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2009  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.44 
 
 		 773 aa  541  9.999999999999999e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3753  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.07 
 
 		 809 aa  538  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1457  hydrogenase maturation protein HypF  40.96 
 
 		 719 aa  538  1e-151  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2093  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.59 
 
 		 801 aa  536  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2108  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.92 
 
 		 803 aa  538  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1167  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.84 
 
 		 757 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01180  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.94 
 
 		 848 aa  532  1e-150  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3880  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.1 
 
 		 778 aa  533  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.956436 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2017  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.8 
 
 		 773 aa  532  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2035  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.79 
 
 		 775 aa  526  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0356  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  38.95 
 
 		 741 aa  527  1e-148  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0522956  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0172  carbamoyltransferase hypF  40.26 
 
 		 755 aa  527  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3377  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  39.3 
 
 		 758 aa  527  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.457459  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>