239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3065 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1432  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  45.72 
 
 		 763 aa  644    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0306  hydrogenase maturation protein HypF  56.93 
 
 		 763 aa  792    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03890  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.41 
 
 		 751 aa  652    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3070  hydrogenase maturation protein HypF  45.38 
 
 		 776 aa  695    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3065  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  100 
 
 		 740 aa  1487    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.735347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1130  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  56.24 
 
 		 758 aa  775    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1950  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  56.95 
 
 		 756 aa  805    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0533  hydrogenase maturation protein HypF  46.85 
 
 		 749 aa  646    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.515959  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0119  hydrogenase maturation protein HypF  57.62 
 
 		 760 aa  811    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0111799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3313  hydrogenase maturation protein HypF  45.38 
 
 		 776 aa  695    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3588  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.47 
 
 		 776 aa  642    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1240  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.41 
 
 		 763 aa  649    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3132  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  55.91 
 
 		 758 aa  760    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07990  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  47.88 
 
 		 762 aa  644    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.442936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2556  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  48.02 
 
 		 776 aa  648    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.34978  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4013  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  48.62 
 
 		 770 aa  650    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1214  hydrogenase maturation protein HypF  45.45 
 
 		 763 aa  642    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0466  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  49.47 
 
 		 778 aa  642    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.252806  normal  0.0404368 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2780  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  56.82 
 
 		 780 aa  817    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0310  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  47.04 
 
 		 792 aa  636    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3809  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  48.88 
 
 		 775 aa  651    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0483302  normal  0.0563214 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3230  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  50.33 
 
 		 783 aa  643    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0462  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.1 
 
 		 790 aa  676    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.336397  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3291  hydrogenase maturation protein HypF  45.65 
 
 		 776 aa  697    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0722  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.66 
 
 		 773 aa  633  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.180457  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2526  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.6 
 
 		 780 aa  627  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.908669  normal  0.241645 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1785  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.12 
 
 		 764 aa  623  1e-177  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00144703  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2593  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  49 
 
 		 773 aa  624  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1847  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  47.48 
 
 		 779 aa  621  1e-176  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.962683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1643  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.4 
 
 		 778 aa  619  1e-176  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1537  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  47.79 
 
 		 785 aa  617  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0523392  normal  0.0813171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3682  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.72 
 
 		 780 aa  616  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4584  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  48.44 
 
 		 774 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1764  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.64 
 
 		 767 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1787  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.74 
 
 		 766 aa  610  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7272  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.74 
 
 		 791 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.270214 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2017  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  47.33 
 
 		 773 aa  608  9.999999999999999e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0080  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.43 
 
 		 741 aa  605  1.0000000000000001e-171  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.442925  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4097  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.19 
 
 		 789 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0792  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.34 
 
 		 785 aa  602  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2051  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.3 
 
 		 849 aa  600  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0555  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.78 
 
 		 777 aa  600  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2182  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.54 
 
 		 752 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.64195  normal  0.285243 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6177  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.46 
 
 		 784 aa  596  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  0.0868727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2136  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.6 
 
 		 745 aa  595  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2123  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.09 
 
 		 752 aa  595  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0252603 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1945  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.94 
 
 		 816 aa  591  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368168  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2394  hydrogenase maturation protein HypF  42.88 
 
 		 741 aa  586  1e-166  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0476  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  48.66 
 
 		 773 aa  588  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3875  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.37 
 
 		 781 aa  585  1e-166  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0469  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.42 
 
 		 818 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.77158  normal  0.0779955 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1303  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.85 
 
 		 781 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.083014  normal  0.0845078 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0509  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  47.98 
 
 		 773 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0504  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  48.46 
 
 		 773 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3977  hydrogenase maturation protein HypF  45.63 
 
 		 763 aa  581  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4602  hydrogenase maturation protein HypF  42.44 
 
 		 786 aa  578  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2179  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.36 
 
 		 767 aa  582  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.474067 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2355  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.18 
 
 		 852 aa  580  1e-164  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218654 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2539  hydrogenase maturation protein HypF  42.56 
 
 		 741 aa  572  1e-161  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3207  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.83 
 
 		 793 aa  566  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3636  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.33 
 
 		 758 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1175  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.32 
 
 		 763 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.311862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0518  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.88 
 
 		 781 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1218  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.61 
 
 		 762 aa  561  1e-158  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0610478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1167  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.34 
 
 		 757 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2481  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  49.48 
 
 		 735 aa  561  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1645  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.39 
 
 		 773 aa  559  1e-158  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00540  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.97 
 
 		 785 aa  555  1e-157  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.48639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4514  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.94 
 
 		 788 aa  554  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47049 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0926  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.71 
 
 		 740 aa  552  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154315 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2009  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.96 
 
 		 773 aa  553  1e-156  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1604  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  46.56 
 
 		 754 aa  547  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1457  hydrogenase maturation protein HypF  42.78 
 
 		 719 aa  546  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2359  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.43 
 
 		 777 aa  546  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658058  normal  0.0687846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2407  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.31 
 
 		 756 aa  547  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258708 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3979  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.41 
 
 		 756 aa  548  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3377  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  45.45 
 
 		 758 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.457459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4555  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.53 
 
 		 785 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0341  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.37 
 
 		 763 aa  541  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0471  carbamoyl phosphate phosphatase, (NiFe) hydrogenase maturation protein  42.05 
 
 		 824 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0655217 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2551  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.61 
 
 		 770 aa  535  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.102731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2326  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.93 
 
 		 978 aa  532  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3096  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.44 
 
 		 749 aa  533  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3016  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.66 
 
 		 753 aa  533  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2523  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.95 
 
 		 769 aa  529  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0264789  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2145  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.5 
 
 		 758 aa  531  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.252172  normal  0.367666 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3753  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.16 
 
 		 809 aa  526  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2743  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.99 
 
 		 760 aa  527  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1422  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.63 
 
 		 766 aa  526  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2550  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  52.24 
 
 		 818 aa  528  1e-148  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51841  normal  0.259672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4854  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.18 
 
 		 795 aa  528  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623858  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1674  hydrogenase maturation protein HypF  43.13 
 
 		 771 aa  528  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50470  hydrogenase maturation carbamoyltransferase, HypF  45.8 
 
 		 768 aa  528  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.597235  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0382  hydrogenase maturation protein  40 
 
 		 767 aa  525  1e-147  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3446  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.09 
 
 		 764 aa  525  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1399  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.41 
 
 		 775 aa  525  1e-147  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.159442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1903  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.55 
 
 		 783 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745392 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0494  hydrogenase maturation factor F  44.11 
 
 		 758 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1072  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.47 
 
 		 848 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.825071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0356  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  37.23 
 
 		 741 aa  514  1e-144  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0522956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>