More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1604 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1604  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  100 
 
 
754 aa  1507    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1385  hydrogenase maturation protein HypF  53.93 
 
 
753 aa  723    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0172  carbamoyltransferase hypF  51.83 
 
 
755 aa  717    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1668  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  51.4 
 
 
770 aa  688    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1837  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  49.87 
 
 
758 aa  669    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131227  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1276  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  54.34 
 
 
757 aa  707    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.853267  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0328  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  52.24 
 
 
754 aa  581  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00352  Hydrogenase maturation protein HypF  40.48 
 
 
768 aa  556  1e-157  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0119  hydrogenase maturation protein HypF  44.69 
 
 
760 aa  547  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0111799  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3682  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.46 
 
 
780 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0306  hydrogenase maturation protein HypF  44.39 
 
 
763 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3588  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.61 
 
 
776 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3065  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.3 
 
 
740 aa  535  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.735347  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2526  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.6 
 
 
780 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.908669  normal  0.241645 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3291  hydrogenase maturation protein HypF  37.61 
 
 
776 aa  528  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2028  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.29 
 
 
800 aa  527  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3070  hydrogenase maturation protein HypF  37.01 
 
 
776 aa  522  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3313  hydrogenase maturation protein HypF  37.01 
 
 
776 aa  522  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0080  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.17 
 
 
741 aa  525  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.442925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1950  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.39 
 
 
756 aa  520  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1903  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.18 
 
 
783 aa  513  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745392 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0310  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.21 
 
 
792 aa  514  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03890  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.02 
 
 
751 aa  515  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1760  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.23 
 
 
781 aa  509  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0466  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.35 
 
 
778 aa  506  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.252806  normal  0.0404368 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07990  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.2 
 
 
762 aa  508  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.442936  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3132  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.39 
 
 
758 aa  504  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1945  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.15 
 
 
816 aa  499  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368168  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2780  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.77 
 
 
780 aa  499  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1130  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.67 
 
 
758 aa  501  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3809  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.33 
 
 
775 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0483302  normal  0.0563214 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2035  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.66 
 
 
775 aa  496  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0792  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.26 
 
 
785 aa  496  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1674  hydrogenase maturation protein HypF  40.16 
 
 
771 aa  497  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2593  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.89 
 
 
773 aa  498  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1432  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  38.59 
 
 
763 aa  494  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1817  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.53 
 
 
836 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1875  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.25 
 
 
835 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386195  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2182  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.82 
 
 
752 aa  495  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.64195  normal  0.285243 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1884  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.51 
 
 
837 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1240  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.4 
 
 
763 aa  492  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2123  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.21 
 
 
752 aa  492  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0252603 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1910  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.28 
 
 
838 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.402426  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2409  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.54 
 
 
840 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0878931  hitchhiker  0.000263976 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0462  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.06 
 
 
790 aa  486  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.336397  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2094  hydrogenase maturation protein HypF  38.52 
 
 
808 aa  488  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1214  hydrogenase maturation protein HypF  38.33 
 
 
763 aa  488  1e-136  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2136  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.74 
 
 
745 aa  489  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2160  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.02 
 
 
840 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.66513 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1917  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.33 
 
 
840 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.998639  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4013  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.84 
 
 
770 aa  486  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1399  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.87 
 
 
775 aa  483  1e-135  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.159442  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0476  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.71 
 
 
773 aa  485  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2108  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.19 
 
 
803 aa  485  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2093  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.28 
 
 
801 aa  484  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2407  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.57 
 
 
756 aa  484  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.258708 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3230  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.86 
 
 
783 aa  481  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1101  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.85 
 
 
744 aa  479  1e-134  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2017  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.73 
 
 
773 aa  482  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1218  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.58 
 
 
762 aa  480  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0610478 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0504  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.85 
 
 
773 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3875  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.24 
 
 
781 aa  478  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0533  hydrogenase maturation protein HypF  37.6 
 
 
749 aa  477  1e-133  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.515959  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4514  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.02 
 
 
788 aa  477  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.47049 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1785  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.89 
 
 
764 aa  478  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00144703  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4602  hydrogenase maturation protein HypF  36.08 
 
 
786 aa  474  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879827  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1167  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.54 
 
 
757 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4555  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.37 
 
 
785 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3446  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.28 
 
 
764 aa  474  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0722  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.91 
 
 
773 aa  475  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.180457  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3979  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.51 
 
 
756 aa  474  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803247  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1643  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.38 
 
 
778 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1764  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.99 
 
 
767 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0046  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.99 
 
 
736 aa  468  9.999999999999999e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.890039  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3377  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  43.06 
 
 
758 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.457459  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1175  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.29 
 
 
763 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.311862  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0509  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.24 
 
 
773 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2551  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.29 
 
 
770 aa  465  1e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.102731  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1422  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.02 
 
 
766 aa  462  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0926  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.81 
 
 
740 aa  462  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154315 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1303  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.28 
 
 
781 aa  464  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.083014  normal  0.0845078 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00540  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.78 
 
 
785 aa  464  1e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.48639  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01180  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.63 
 
 
848 aa  460  9.999999999999999e-129  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1847  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.61 
 
 
779 aa  460  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.962683  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1431  hydrogenase maturation protein HypF  34.18 
 
 
742 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3185  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.6 
 
 
751 aa  462  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2539  hydrogenase maturation protein HypF  37.09 
 
 
741 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0341  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.48 
 
 
763 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744113  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2145  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.32 
 
 
758 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.252172  normal  0.367666 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0469  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.75 
 
 
818 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.77158  normal  0.0779955 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3636  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.32 
 
 
758 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0356  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  33.99 
 
 
741 aa  454  1.0000000000000001e-126  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0522956  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0555  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.75 
 
 
777 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2523  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.6 
 
 
769 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0264789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4854  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.56 
 
 
795 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623858  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2051  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.43 
 
 
849 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2423  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.16 
 
 
765 aa  454  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.344696 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1645  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.48 
 
 
773 aa  449  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4097  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.02 
 
 
789 aa  449  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2342  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.45 
 
 
766 aa  449  1e-125  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>