243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3230 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3809  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  50.19 
 
 		 775 aa  656    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0483302  normal  0.0563214 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0119  hydrogenase maturation protein HypF  50.13 
 
 		 760 aa  639    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0111799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1847  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  50.13 
 
 		 779 aa  637    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.962683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1072  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  60.99 
 
 		 848 aa  792    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.825071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1945  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  56.3 
 
 		 816 aa  750    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4854  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  62.29 
 
 		 795 aa  797    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623858  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2136  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  54.51 
 
 		 745 aa  700    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07990  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  51.24 
 
 		 762 aa  644    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.442936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2780  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  50.26 
 
 		 780 aa  658    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2182  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  54.66 
 
 		 752 aa  707    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.64195  normal  0.285243 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2359  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  56.54 
 
 		 777 aa  710    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658058  normal  0.0687846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2407  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  54.14 
 
 		 756 aa  698    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258708 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1643  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.98 
 
 		 778 aa  640    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0466  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  50.19 
 
 		 778 aa  647    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.252806  normal  0.0404368 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2123  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  54.66 
 
 		 752 aa  718    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0252603 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3979  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  53.89 
 
 		 756 aa  686    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803247  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3230  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  100 
 
 		 783 aa  1538    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2556  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  50.59 
 
 		 776 aa  662    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.34978  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4013  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  47.85 
 
 		 770 aa  633  1e-180  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1950  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  48.36 
 
 		 756 aa  632  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0533  hydrogenase maturation protein HypF  45.59 
 
 		 749 aa  631  1e-179  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.515959  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1785  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  47.19 
 
 		 764 aa  627  1e-178  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00144703  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0306  hydrogenase maturation protein HypF  48.82 
 
 		 763 aa  624  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3291  hydrogenase maturation protein HypF  41.53 
 
 		 776 aa  624  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1764  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.22 
 
 		 767 aa  621  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3070  hydrogenase maturation protein HypF  41.27 
 
 		 776 aa  621  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3313  hydrogenase maturation protein HypF  41.27 
 
 		 776 aa  621  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0722  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.48 
 
 		 773 aa  622  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.180457  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3065  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  49.54 
 
 		 740 aa  618  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.735347  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03890  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.1 
 
 		 751 aa  618  1e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0310  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  47.42 
 
 		 792 aa  616  1e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0462  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.81 
 
 		 790 aa  608  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.336397  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2051  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.84 
 
 		 849 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3132  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  50.26 
 
 		 758 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1130  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  48.96 
 
 		 758 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4584  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  49.68 
 
 		 774 aa  601  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1303  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.77 
 
 		 781 aa  600  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.083014  normal  0.0845078 
 
 
-
 
NC_002936  DET1432  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  43.6 
 
 		 763 aa  598  1e-169  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3682  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.71 
 
 		 780 aa  596  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1645  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  47.01 
 
 		 773 aa  598  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0080  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.53 
 
 		 741 aa  597  1e-169  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.442925  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2593  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  49.36 
 
 		 773 aa  595  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1214  hydrogenase maturation protein HypF  43.55 
 
 		 763 aa  595  1e-169  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3588  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.39 
 
 		 776 aa  594  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0476  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  50 
 
 		 773 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0504  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  50.53 
 
 		 773 aa  595  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1240  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.8 
 
 		 763 aa  594  1e-168  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2179  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.66 
 
 		 767 aa  591  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.474067 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2526  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.91 
 
 		 780 aa  585  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.908669  normal  0.241645 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0555  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.66 
 
 		 777 aa  581  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1787  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.69 
 
 		 766 aa  579  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0518  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  48.72 
 
 		 781 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00540  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.43 
 
 		 785 aa  577  1.0000000000000001e-163  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.48639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3875  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40 
 
 		 781 aa  570  1e-161  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0509  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  50 
 
 		 773 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7272  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.07 
 
 		 791 aa  566  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.270214 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0926  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.2 
 
 		 740 aa  567  1e-160  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154315 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2539  hydrogenase maturation protein HypF  40.49 
 
 		 741 aa  560  1e-158  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2394  hydrogenase maturation protein HypF  40.62 
 
 		 741 aa  561  1e-158  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4097  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.47 
 
 		 789 aa  560  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2017  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.77 
 
 		 773 aa  559  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2009  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.32 
 
 		 773 aa  559  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0792  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.19 
 
 		 785 aa  557  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2481  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  50.93 
 
 		 735 aa  557  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4602  hydrogenase maturation protein HypF  38.52 
 
 		 786 aa  550  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3636  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.96 
 
 		 758 aa  550  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6177  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.4 
 
 		 784 aa  547  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  0.0868727 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4555  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.17 
 
 		 785 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0469  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.1 
 
 		 818 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.77158  normal  0.0779955 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2326  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.42 
 
 		 978 aa  546  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1537  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.7 
 
 		 785 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0523392  normal  0.0813171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3446  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.7 
 
 		 764 aa  539  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1457  hydrogenase maturation protein HypF  43.13 
 
 		 719 aa  536  1e-151  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1175  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.14 
 
 		 763 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.311862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1167  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.33 
 
 		 757 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3977  hydrogenase maturation protein HypF  43.3 
 
 		 763 aa  532  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2355  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.99 
 
 		 852 aa  535  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218654 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4514  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.49 
 
 		 788 aa  523  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47049 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0535  hydrogenase maturation protein HypF  43.04 
 
 		 812 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50470  hydrogenase maturation carbamoyltransferase, HypF  45.42 
 
 		 768 aa  522  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.597235  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1760  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40 
 
 		 781 aa  523  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0341  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  48.13 
 
 		 763 aa  521  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1674  hydrogenase maturation protein HypF  42.07 
 
 		 771 aa  522  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3016  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.13 
 
 		 753 aa  521  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0860  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.48 
 
 		 803 aa  513  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.729638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0712  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  43.48 
 
 		 803 aa  513  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1218  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.75 
 
 		 762 aa  512  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0610478 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1817  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.15 
 
 		 836 aa  511  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0172  carbamoyltransferase hypF  43.94 
 
 		 755 aa  512  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0382  hydrogenase maturation protein  39.14 
 
 		 767 aa  509  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2409  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.06 
 
 		 840 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0878931  hitchhiker  0.000263976 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1884  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.55 
 
 		 837 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0471  carbamoyl phosphate phosphatase, (NiFe) hydrogenase maturation protein  41.76 
 
 		 824 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0655217 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2342  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.7 
 
 		 766 aa  505  1e-141  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1898  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  37.4 
 
 		 739 aa  505  1e-141  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2160  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.49 
 
 		 840 aa  504  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.66513 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1276  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.86 
 
 		 757 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.853267  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1875  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.67 
 
 		 835 aa  505  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2028  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.58 
 
 		 800 aa  505  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0391  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.52 
 
 		 736 aa  503  1e-141  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000910038  hitchhiker  0.000000117936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>