188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2481 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_07990  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  58.63 
 
 
762 aa  727    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.442936  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3809  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  62.37 
 
 
775 aa  762    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0483302  normal  0.0563214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4584  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  60.49 
 
 
774 aa  705    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2481  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  100 
 
 
735 aa  1451    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2556  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  52.91 
 
 
776 aa  643    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.34978  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1847  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  53.23 
 
 
779 aa  630  1e-179  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.962683  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1950  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  51.62 
 
 
756 aa  623  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0462  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.03 
 
 
790 aa  621  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.336397  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0306  hydrogenase maturation protein HypF  52.83 
 
 
763 aa  615  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0466  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  52.69 
 
 
778 aa  611  1e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.252806  normal  0.0404368 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3291  hydrogenase maturation protein HypF  43.42 
 
 
776 aa  596  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3070  hydrogenase maturation protein HypF  43.27 
 
 
776 aa  592  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3313  hydrogenase maturation protein HypF  43.27 
 
 
776 aa  592  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4013  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  50.82 
 
 
770 aa  587  1e-166  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2780  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  48.23 
 
 
780 aa  587  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0119  hydrogenase maturation protein HypF  50.36 
 
 
760 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0111799  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2123  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  51.16 
 
 
752 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0252603 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3230  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  50.99 
 
 
783 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0533  hydrogenase maturation protein HypF  46.56 
 
 
749 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.515959  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2136  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  51.16 
 
 
745 aa  571  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2182  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  51.16 
 
 
752 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.64195  normal  0.285243 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1945  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  50.07 
 
 
816 aa  565  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368168  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1240  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.75 
 
 
763 aa  567  1e-160  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1432  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  44.41 
 
 
763 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03890  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.19 
 
 
751 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1764  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  47.21 
 
 
767 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1785  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  47.48 
 
 
764 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00144703  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1214  hydrogenase maturation protein HypF  44.4 
 
 
763 aa  559  1e-158  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0722  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.18 
 
 
773 aa  558  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.180457  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1130  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  49.71 
 
 
758 aa  552  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3875  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.23 
 
 
781 aa  550  1e-155  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0469  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.95 
 
 
818 aa  548  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.77158  normal  0.0779955 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3132  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  50.07 
 
 
758 aa  546  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3065  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  50 
 
 
740 aa  546  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.735347  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1643  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.18 
 
 
778 aa  547  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3588  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.73 
 
 
776 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4602  hydrogenase maturation protein HypF  44.59 
 
 
786 aa  544  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879827  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0080  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.36 
 
 
741 aa  538  9.999999999999999e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.442925  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2550  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  49.38 
 
 
818 aa  536  1e-151  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51841  normal  0.259672 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1457  hydrogenase maturation protein HypF  45.86 
 
 
719 aa  533  1e-150  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0792  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.8 
 
 
785 aa  535  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2051  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.9 
 
 
849 aa  533  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0310  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.43 
 
 
792 aa  535  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3682  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.83 
 
 
780 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2526  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.63 
 
 
780 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.908669  normal  0.241645 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2407  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  50.8 
 
 
756 aa  529  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.258708 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00540  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.21 
 
 
785 aa  530  1e-149  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.48639  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1645  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  47.01 
 
 
773 aa  525  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3979  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  49.13 
 
 
756 aa  527  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803247  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1787  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.79 
 
 
766 aa  521  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0535  hydrogenase maturation protein HypF  45.33 
 
 
812 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0504  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  48.21 
 
 
773 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6177  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.22 
 
 
784 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  0.0868727 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1303  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.76 
 
 
781 aa  510  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.083014  normal  0.0845078 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2179  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.9 
 
 
767 aa  506  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.474067 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3377  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  49.13 
 
 
758 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.457459  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2593  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  48.02 
 
 
773 aa  504  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0476  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  48.25 
 
 
773 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2359  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.58 
 
 
777 aa  502  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658058  normal  0.0687846 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2009  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.16 
 
 
773 aa  499  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0471  carbamoyl phosphate phosphatase, (NiFe) hydrogenase maturation protein  44.07 
 
 
824 aa  500  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0655217 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0555  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.13 
 
 
777 aa  498  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4555  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.13 
 
 
785 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0509  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  48.8 
 
 
773 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2394  hydrogenase maturation protein HypF  38.86 
 
 
741 aa  490  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3636  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.98 
 
 
758 aa  490  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2355  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.27 
 
 
852 aa  489  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218654 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2539  hydrogenase maturation protein HypF  38.86 
 
 
741 aa  487  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3207  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.12 
 
 
793 aa  487  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0341  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  47.04 
 
 
763 aa  486  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744113  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1537  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.58 
 
 
785 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0523392  normal  0.0813171 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3096  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  47.38 
 
 
749 aa  483  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2145  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  47.16 
 
 
758 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.252172  normal  0.367666 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7272  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44 
 
 
791 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.270214 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0494  hydrogenase maturation factor F  47.16 
 
 
758 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3753  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.74 
 
 
809 aa  479  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1167  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.97 
 
 
757 aa  482  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0926  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.36 
 
 
740 aa  479  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154315 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3446  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.86 
 
 
764 aa  479  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1148  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.94 
 
 
779 aa  473  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2017  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.51 
 
 
773 aa  472  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0518  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.71 
 
 
781 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4097  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.89 
 
 
789 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1175  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.83 
 
 
763 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.311862  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1760  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.82 
 
 
781 aa  464  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1101  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.3 
 
 
744 aa  464  1e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0140  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.99 
 
 
920 aa  462  9.999999999999999e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01180  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.31 
 
 
848 aa  461  9.999999999999999e-129  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4514  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.57 
 
 
788 aa  459  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.47049 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0860  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.51 
 
 
803 aa  452  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.729638  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0712  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  43.51 
 
 
803 aa  452  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4854  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  47.09 
 
 
795 aa  452  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623858  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3977  hydrogenase maturation protein HypF  41.39 
 
 
763 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1218  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.97 
 
 
762 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0610478 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1898  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  36.5 
 
 
739 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2160  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.48 
 
 
840 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.66513 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2523  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.17 
 
 
769 aa  443  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0264789  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3185  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.54 
 
 
751 aa  443  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2409  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.41 
 
 
840 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0878931  hitchhiker  0.000263976 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1875  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.5 
 
 
835 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386195  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>