282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0469 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0712  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  50.25 
 
 
803 aa  753    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3753  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  52.33 
 
 
809 aa  798    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4602  hydrogenase maturation protein HypF  63.57 
 
 
786 aa  1022    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879827  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0469  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  100 
 
 
818 aa  1688    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.77158  normal  0.0779955 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4555  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.82 
 
 
785 aa  669    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0535  hydrogenase maturation protein HypF  49.75 
 
 
812 aa  753    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0341  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.37 
 
 
763 aa  648    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744113  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3207  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  50.93 
 
 
793 aa  778    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0860  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  50.25 
 
 
803 aa  753    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.729638  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0792  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  59.53 
 
 
785 aa  986    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3377  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  45.14 
 
 
758 aa  645    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.457459  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3875  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  60.88 
 
 
781 aa  1005    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0471  carbamoyl phosphate phosphatase, (NiFe) hydrogenase maturation protein  51.94 
 
 
824 aa  815    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0655217 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1240  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.89 
 
 
763 aa  634  1e-180  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3682  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.52 
 
 
780 aa  631  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3588  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.33 
 
 
776 aa  627  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2145  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.84 
 
 
758 aa  626  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.252172  normal  0.367666 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0494  hydrogenase maturation factor F  44.96 
 
 
758 aa  624  1e-177  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1950  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.19 
 
 
756 aa  622  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1645  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.57 
 
 
773 aa  619  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3070  hydrogenase maturation protein HypF  42.07 
 
 
776 aa  617  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3313  hydrogenase maturation protein HypF  42.07 
 
 
776 aa  617  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3291  hydrogenase maturation protein HypF  42.07 
 
 
776 aa  617  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2526  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.66 
 
 
780 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.908669  normal  0.241645 
 
 
-
 
NC_002936  DET1432  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  41.03 
 
 
763 aa  606  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1214  hydrogenase maturation protein HypF  40.9 
 
 
763 aa  606  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1148  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.54 
 
 
779 aa  608  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2523  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.06 
 
 
769 aa  605  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0264789  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1422  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.35 
 
 
766 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0119  hydrogenase maturation protein HypF  43.11 
 
 
760 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0111799  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2179  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.71 
 
 
767 aa  605  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.474067 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1847  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45 
 
 
779 aa  604  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.962683  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0306  hydrogenase maturation protein HypF  43.95 
 
 
763 aa  599  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0462  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.93 
 
 
790 aa  599  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.336397  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2780  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.8 
 
 
780 aa  599  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0080  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.04 
 
 
741 aa  597  1e-169  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.442925  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07990  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.09 
 
 
762 aa  598  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.442936  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3809  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.41 
 
 
775 aa  598  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0483302  normal  0.0563214 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3096  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.5 
 
 
749 aa  595  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0722  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.6 
 
 
773 aa  590  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.180457  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3132  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.63 
 
 
758 aa  588  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4013  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.73 
 
 
770 aa  587  1e-166  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2009  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.44 
 
 
773 aa  587  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0533  hydrogenase maturation protein HypF  42.08 
 
 
749 aa  580  1e-164  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.515959  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0555  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.2 
 
 
777 aa  580  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1764  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.6 
 
 
767 aa  582  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0466  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.88 
 
 
778 aa  579  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.252806  normal  0.0404368 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1130  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.31 
 
 
758 aa  579  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0310  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.81 
 
 
792 aa  581  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3065  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.22 
 
 
740 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.735347  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1785  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.96 
 
 
764 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00144703  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2593  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.07 
 
 
773 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2556  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.89 
 
 
776 aa  578  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.34978  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1643  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.23 
 
 
778 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1303  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.64 
 
 
781 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.083014  normal  0.0845078 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1787  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.98 
 
 
766 aa  575  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4584  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.51 
 
 
774 aa  570  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3185  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.82 
 
 
751 aa  570  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02562  carbamoyl phosphate phosphatase and maturation protein for [NiFe] hydrogenases  44.21 
 
 
750 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0977  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.08 
 
 
750 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.229585  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1000  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.08 
 
 
750 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000948603 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02527  hypothetical protein  44.21 
 
 
750 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3044  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  42.8 
 
 
746 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0442522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2993  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  42.3 
 
 
746 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.017038 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0518  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.62 
 
 
781 aa  561  1e-158  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0504  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.31 
 
 
773 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2996  carbamoyltransferase HypF  44.08 
 
 
750 aa  561  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03890  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.47 
 
 
751 aa  559  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3165  carbamoyltransferase HypF  43.83 
 
 
750 aa  561  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2962  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  42.43 
 
 
746 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2848  carbamoyltransferase HypF  44.08 
 
 
750 aa  557  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3151  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  42.3 
 
 
746 aa  558  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.114477 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00540  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.5 
 
 
785 aa  558  1e-157  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.48639  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3230  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.1 
 
 
783 aa  558  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3028  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  42.43 
 
 
746 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000447787 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3962  carbamoyltransferase HypF  43.7 
 
 
766 aa  557  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2051  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.79 
 
 
849 aa  553  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0476  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.68 
 
 
773 aa  554  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2423  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.97 
 
 
765 aa  554  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.344696 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2835  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  43.91 
 
 
762 aa  549  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0257983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3636  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.68 
 
 
758 aa  550  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2123  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.88 
 
 
752 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0252603 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2182  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.88 
 
 
752 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.64195  normal  0.285243 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2394  hydrogenase maturation protein HypF  39.85 
 
 
741 aa  544  1e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3977  hydrogenase maturation protein HypF  40.98 
 
 
763 aa  544  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4097  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.93 
 
 
789 aa  544  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0509  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.19 
 
 
773 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1537  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.23 
 
 
785 aa  541  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0523392  normal  0.0813171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2136  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.71 
 
 
745 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0140  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.83 
 
 
920 aa  540  9.999999999999999e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2481  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.11 
 
 
735 aa  542  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2539  hydrogenase maturation protein HypF  39.28 
 
 
741 aa  537  1e-151  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2017  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.37 
 
 
773 aa  534  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2355  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.91 
 
 
852 aa  529  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218654 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6177  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.6 
 
 
784 aa  525  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  0.0868727 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1945  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.82 
 
 
816 aa  524  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368168  normal 
 
 
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NC_008709  Ping_1218  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.33 
 
 
762 aa  523  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0610478 
 
 
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NC_009901  Spea_2028  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.01 
 
 
800 aa  523  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_1167  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.49 
 
 
757 aa  522  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010571  Oter_4514  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.61 
 
 
788 aa  520  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.47049 
 
 
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