272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1884 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2409  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  94.27 
 
 
840 aa  1623    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0878931  hitchhiker  0.000263976 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2093  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  76.82 
 
 
801 aa  1267    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2094  hydrogenase maturation protein HypF  73.14 
 
 
808 aa  1195    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1760  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  53.2 
 
 
781 aa  825    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1903  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  56.17 
 
 
783 aa  890    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745392 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1817  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  72.15 
 
 
836 aa  1188    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2160  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  71.8 
 
 
840 aa  1169    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.66513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1910  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  93.91 
 
 
838 aa  1609    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.402426  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2108  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  52.14 
 
 
803 aa  815    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2028  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  52.96 
 
 
800 aa  867    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1875  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  72.03 
 
 
835 aa  1202    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386195  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1674  hydrogenase maturation protein HypF  49.5 
 
 
771 aa  745    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1884  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  100 
 
 
837 aa  1738    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1917  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  94.15 
 
 
840 aa  1619    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.998639  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1431  hydrogenase maturation protein HypF  41.18 
 
 
742 aa  610  1e-173  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1101  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.81 
 
 
744 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3588  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.58 
 
 
776 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2526  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.38 
 
 
780 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.908669  normal  0.241645 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3682  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.75 
 
 
780 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2035  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.04 
 
 
775 aa  553  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0080  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.41 
 
 
741 aa  541  9.999999999999999e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.442925  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0533  hydrogenase maturation protein HypF  39.5 
 
 
749 aa  538  1e-151  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.515959  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2593  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.34 
 
 
773 aa  538  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3070  hydrogenase maturation protein HypF  38.51 
 
 
776 aa  521  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3313  hydrogenase maturation protein HypF  38.51 
 
 
776 aa  521  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3291  hydrogenase maturation protein HypF  38.39 
 
 
776 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1950  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.86 
 
 
756 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0792  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.58 
 
 
785 aa  518  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00540  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.34 
 
 
785 aa  509  1e-143  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.48639  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0722  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.3 
 
 
773 aa  509  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.180457  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0466  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.3 
 
 
778 aa  512  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.252806  normal  0.0404368 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1787  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.26 
 
 
766 aa  510  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1432  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  39.32 
 
 
763 aa  507  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1847  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.72 
 
 
779 aa  506  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.962683  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03890  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.37 
 
 
751 aa  507  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07990  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39 
 
 
762 aa  509  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.442936  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2051  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.99 
 
 
849 aa  503  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3230  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.05 
 
 
783 aa  504  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1898  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  38.42 
 
 
739 aa  505  1e-141  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1240  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.64 
 
 
763 aa  501  1e-140  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1214  hydrogenase maturation protein HypF  38.94 
 
 
763 aa  500  1e-140  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4013  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.51 
 
 
770 aa  496  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1785  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.27 
 
 
764 aa  496  1e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00144703  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1764  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.92 
 
 
767 aa  498  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0792  transcriptional regulatory protein HypF  36.35 
 
 
732 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0531432  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2556  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.87 
 
 
776 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.34978  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0935  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  36.54 
 
 
741 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.993147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2182  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.36 
 
 
752 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.64195  normal  0.285243 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3809  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.78 
 
 
775 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0483302  normal  0.0563214 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0046  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.39 
 
 
736 aa  490  1e-137  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.890039  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3875  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.81 
 
 
781 aa  489  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0310  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.2 
 
 
792 aa  489  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2123  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.24 
 
 
752 aa  492  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0252603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1167  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.55 
 
 
757 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0119  hydrogenase maturation protein HypF  36.86 
 
 
760 aa  488  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0111799  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0555  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.64 
 
 
777 aa  488  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2136  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.28 
 
 
745 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1303  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.19 
 
 
781 aa  483  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.083014  normal  0.0845078 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2179  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.91 
 
 
767 aa  485  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.474067 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0356  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  36.05 
 
 
741 aa  484  1e-135  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0522956  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2780  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.78 
 
 
780 aa  484  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1604  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  38.88 
 
 
754 aa  482  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4602  hydrogenase maturation protein HypF  38.23 
 
 
786 aa  482  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879827  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6177  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.14 
 
 
784 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  0.0868727 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1945  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.46 
 
 
816 aa  480  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368168  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01180  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.23 
 
 
848 aa  481  1e-134  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3065  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.95 
 
 
740 aa  478  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.735347  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0306  hydrogenase maturation protein HypF  37.66 
 
 
763 aa  476  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2394  hydrogenase maturation protein HypF  37.03 
 
 
741 aa  476  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1457  hydrogenase maturation protein HypF  39.58 
 
 
719 aa  478  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1668  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.4 
 
 
770 aa  478  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1643  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.76 
 
 
778 aa  477  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0469  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.19 
 
 
818 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.77158  normal  0.0779955 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4555  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39 
 
 
785 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0476  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.45 
 
 
773 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1175  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.85 
 
 
763 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.311862  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2551  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.22 
 
 
770 aa  471  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.102731  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1837  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.12 
 
 
758 aa  470  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131227  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2359  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.02 
 
 
777 aa  472  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658058  normal  0.0687846 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2539  hydrogenase maturation protein HypF  37.03 
 
 
741 aa  466  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4097  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.67 
 
 
789 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0504  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.2 
 
 
773 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3377  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  38.12 
 
 
758 aa  469  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.457459  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0172  carbamoyltransferase hypF  37.28 
 
 
755 aa  468  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0462  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.64 
 
 
790 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.336397  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2017  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.59 
 
 
773 aa  466  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0518  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.81 
 
 
781 aa  469  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1645  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.14 
 
 
773 aa  469  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0509  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.58 
 
 
773 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4514  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.29 
 
 
788 aa  464  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.47049 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2355  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.32 
 
 
852 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218654 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1537  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.88 
 
 
785 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0523392  normal  0.0813171 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0140  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.75 
 
 
920 aa  463  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2407  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.93 
 
 
756 aa  463  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.258708 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0651  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  36.09 
 
 
728 aa  464  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3636  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.4 
 
 
758 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4584  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.75 
 
 
774 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1047  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  35.61 
 
 
729 aa  458  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0365052  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1399  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.37 
 
 
775 aa  457  1e-127  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.159442  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0926  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.82 
 
 
740 aa  457  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>