More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_36797 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009358  OSTLU_36797  predicted protein  100 
 
 		 465 aa  952    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_2089  predicted protein  46.27 
 
 		 449 aa  341  2e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.56 
 
 		 731 aa  275  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3541  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.38 
 
 		 644 aa  270  5e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.39 
 
 		 709 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.15 
 
 		 709 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.04 
 
 		 709 aa  262  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02087  Putative uncharacterized proteinRecQ helicase MUSN ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P8H3]  36.64 
 
 		 1534 aa  261  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.13 
 
 		 718 aa  260  5.0000000000000005e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3200  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.28 
 
 		 600 aa  258  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.74 
 
 		 606 aa  256  5e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.76 
 
 		 626 aa  255  1.0000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.38 
 
 		 608 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.71 
 
 		 607 aa  254  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01900  ATP-dependent DNA helicase recQ  36.1 
 
 		 698 aa  253  3e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.490742  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.35 
 
 		 599 aa  254  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47969  ATP-dependent DNA helicase  35.01 
 
 		 1148 aa  253  4.0000000000000004e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.8 
 
 		 607 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.15 
 
 		 608 aa  253  6e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.86 
 
 		 707 aa  252  8.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.38 
 
 		 606 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.08 
 
 		 736 aa  252  9.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0084  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.08 
 
 		 623 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1047  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.86 
 
 		 657 aa  251  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.763377  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.97 
 
 		 725 aa  251  3e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.6 
 
 		 615 aa  250  5e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.21 
 
 		 613 aa  249  5e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0020  hypothetical protein  35.99 
 
 		 493 aa  249  6e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1229  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.98 
 
 		 779 aa  249  6e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.67 
 
 		 607 aa  249  8e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.74 
 
 		 610 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3687  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.95 
 
 		 612 aa  248  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1711  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.63 
 
 		 624 aa  248  1e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18280  predicted protein  35.9 
 
 		 504 aa  248  2e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.22 
 
 		 611 aa  248  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.83 
 
 		 608 aa  248  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2335  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.62 
 
 		 593 aa  248  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.699983  normal  0.515906 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1318  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.1 
 
 		 419 aa  248  2e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.227704  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.67 
 
 		 607 aa  248  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.18 
 
 		 607 aa  247  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.75 
 
 		 717 aa  247  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.1 
 
 		 607 aa  247  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.67 
 
 		 607 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.53 
 
 		 611 aa  246  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.22 
 
 		 609 aa  247  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.12 
 
 		 611 aa  246  6e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.63 
 
 		 728 aa  246  6e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.98 
 
 		 609 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.98 
 
 		 609 aa  246  6.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.98 
 
 		 611 aa  246  8e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.98 
 
 		 611 aa  246  8e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.695622 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  37.98 
 
 		 611 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  37.98 
 
 		 609 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.98 
 
 		 609 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.62 
 
 		 605 aa  244  3e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00245617  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0153  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.93 
 
 		 633 aa  244  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.18 
 
 		 607 aa  244  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.53 
 
 		 633 aa  243  3.9999999999999997e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1868  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.2 
 
 		 719 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.31 
 
 		 609 aa  243  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.56 
 
 		 601 aa  243  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.56 
 
 		 596 aa  243  6e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.93 
 
 		 607 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1545  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.74 
 
 		 592 aa  243  7.999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.93 
 
 		 607 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.96 
 
 		 610 aa  242  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.96 
 
 		 610 aa  242  9e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0695  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.33 
 
 		 612 aa  242  9e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.96 
 
 		 597 aa  242  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.77 
 
 		 451 aa  242  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1840  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.57 
 
 		 486 aa  242  1e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.747153  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.93 
 
 		 607 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.93 
 
 		 607 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.32 
 
 		 705 aa  241  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.18 
 
 		 617 aa  241  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1976  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.02 
 
 		 602 aa  241  2e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0114  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.26 
 
 		 639 aa  241  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.186389 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.49 
 
 		 644 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0876032  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.23 
 
 		 611 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.23 
 
 		 611 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0900  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.46 
 
 		 605 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.586975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.89 
 
 		 615 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.89 
 
 		 615 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.21 
 
 		 602 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0459  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.71 
 
 		 618 aa  239  5e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.89 
 
 		 615 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.89 
 
 		 615 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.62 
 
 		 615 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3752  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.76 
 
 		 615 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2638  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.76 
 
 		 615 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.923469  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3472  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.76 
 
 		 615 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.290967  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.76 
 
 		 615 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  36.92 
 
 		 608 aa  239  8e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3783  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.76 
 
 		 647 aa  239  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0410934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.45 
 
 		 737 aa  239  8e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0839  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.12 
 
 		 626 aa  239  9e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.305009 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.89 
 
 		 615 aa  239  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1918  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.76 
 
 		 658 aa  239  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0352657  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.89 
 
 		 707 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3175  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.76 
 
 		 763 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0819328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>