More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3142 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3142  cysteine desulfurase  100 
 
 		 379 aa  740    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2669  aminotransferase, class V  58.56 
 
 		 378 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1288  aminotransferase class V  61.5 
 
 		 393 aa  378  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.322266  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3079  aminotransferase class V  59.63 
 
 		 398 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000765371  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4129  aminotransferase class V  55.65 
 
 		 376 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3301  aminotransferase, class V  58.24 
 
 		 439 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.207407 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3533  cysteine desulfurase  56.65 
 
 		 383 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3118  aminotransferase, class V  50.64 
 
 		 436 aa  299  6e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1800  aminotransferase class V  51.17 
 
 		 409 aa  293  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.345473 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2083  Cysteine desulfurase  49.2 
 
 		 371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15620  cysteine desulfurase family protein  47.12 
 
 		 384 aa  253  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.715718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1454  Cysteine desulfurase  44.5 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369262  normal  0.276847 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  38.52 
 
 		 402 aa  229  8e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  34.83 
 
 		 394 aa  209  8e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  35.79 
 
 		 400 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  33.16 
 
 		 392 aa  207  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  32.36 
 
 		 404 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  33.77 
 
 		 398 aa  203  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  34.2 
 
 		 392 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  34.3 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  33.33 
 
 		 394 aa  199  6e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1666  Cysteine desulfurase  49.6 
 
 		 420 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  36.32 
 
 		 388 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  36.32 
 
 		 390 aa  192  6e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  32.72 
 
 		 414 aa  192  7e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  30.81 
 
 		 393 aa  192  8e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  32.28 
 
 		 389 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  35.71 
 
 		 399 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  31.32 
 
 		 396 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  37.69 
 
 		 422 aa  189  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  32.45 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  34.64 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  35.58 
 
 		 388 aa  186  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  34.45 
 
 		 409 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  32.63 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  33.25 
 
 		 392 aa  182  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  33.77 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  32.18 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  35.54 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  34.84 
 
 		 404 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  37.4 
 
 		 384 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  34.74 
 
 		 398 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  33.07 
 
 		 393 aa  178  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  33.69 
 
 		 400 aa  176  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  31.83 
 
 		 407 aa  176  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  34.38 
 
 		 403 aa  175  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  37.24 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  31.73 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  32.72 
 
 		 400 aa  173  5e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  32.8 
 
 		 396 aa  172  9e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  28.84 
 
 		 398 aa  172  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  31.11 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  37.56 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  35.62 
 
 		 395 aa  169  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  31.91 
 
 		 401 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  31.91 
 
 		 401 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1875  aminotransferase, class V  36.25 
 
 		 397 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1855  aminotransferase, class V  36.25 
 
 		 397 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712438  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1921  aminotransferase, class V  36.25 
 
 		 397 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173921  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  33.95 
 
 		 394 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  31.32 
 
 		 386 aa  167  2e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  31.84 
 
 		 397 aa  167  4e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  31.09 
 
 		 398 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  31.09 
 
 		 398 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  33.33 
 
 		 402 aa  167  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  31.5 
 
 		 401 aa  166  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  31.4 
 
 		 400 aa  166  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  32.98 
 
 		 399 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  29.63 
 
 		 393 aa  166  8e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  33.77 
 
 		 410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  32.1 
 
 		 396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  33.16 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1297  aminotransferase class V  31.33 
 
 		 403 aa  164  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.216598  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  28.53 
 
 		 382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4811  cysteine desulfurase  33.16 
 
 		 398 aa  163  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  32.63 
 
 		 401 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  31.2 
 
 		 402 aa  163  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  31.41 
 
 		 401 aa  162  9e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  31.96 
 
 		 401 aa  160  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  30.77 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  29.37 
 
 		 404 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  31.13 
 
 		 398 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  35.51 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13041  cysteine desulfurase iscS  35.47 
 
 		 393 aa  160  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315275  hitchhiker  0.00290952 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  31.05 
 
 		 400 aa  159  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  32.54 
 
 		 389 aa  159  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1186  aminotransferase, class V  30.71 
 
 		 380 aa  159  9e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  30.24 
 
 		 389 aa  159  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  33.87 
 
 		 394 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  30.81 
 
 		 391 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  32.37 
 
 		 400 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  31.3 
 
 		 391 aa  158  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  35.16 
 
 		 418 aa  157  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2910  Cysteine desulfurase  38.62 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  30.61 
 
 		 391 aa  157  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  30.97 
 
 		 398 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  34.83 
 
 		 387 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4080  aminotransferase class V  33.25 
 
 		 393 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  30.24 
 
 		 389 aa  155  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  34.92 
 
 		 387 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>