More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1666 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1666  Cysteine desulfurase  100 
 
 		 420 aa  816    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1288  aminotransferase class V  56.67 
 
 		 393 aa  382  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.322266  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2669  aminotransferase, class V  52.86 
 
 		 378 aa  375  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3079  aminotransferase class V  52.63 
 
 		 398 aa  361  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000765371  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3301  aminotransferase, class V  52.87 
 
 		 439 aa  326  5e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.207407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4129  aminotransferase class V  47.14 
 
 		 376 aa  325  9e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3533  cysteine desulfurase  53.35 
 
 		 383 aa  324  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1800  aminotransferase class V  49.77 
 
 		 409 aa  303  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.345473 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3118  aminotransferase, class V  47.28 
 
 		 436 aa  296  3e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3142  cysteine desulfurase  45.35 
 
 		 379 aa  281  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15620  cysteine desulfurase family protein  44.26 
 
 		 384 aa  273  6e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.715718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1454  Cysteine desulfurase  40.81 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369262  normal  0.276847 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2083  Cysteine desulfurase  41.01 
 
 		 371 aa  210  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  34.98 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  32.86 
 
 		 392 aa  203  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  32.08 
 
 		 400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  32.02 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  30.28 
 
 		 389 aa  193  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  32.04 
 
 		 409 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  30.28 
 
 		 403 aa  189  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  29.34 
 
 		 394 aa  187  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  30.15 
 
 		 396 aa  186  8e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  31.07 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  31.55 
 
 		 380 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  32.08 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  31.15 
 
 		 398 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  29.27 
 
 		 398 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  33.93 
 
 		 395 aa  180  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  32.63 
 
 		 390 aa  179  8e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  30.21 
 
 		 392 aa  179  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  30.92 
 
 		 407 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  29.06 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  27.36 
 
 		 384 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  28.81 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  28.47 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  27.83 
 
 		 384 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  29.81 
 
 		 414 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  29.53 
 
 		 401 aa  177  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  27.4 
 
 		 382 aa  177  4e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  29.06 
 
 		 381 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  28.81 
 
 		 381 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  28.84 
 
 		 396 aa  176  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  32.39 
 
 		 399 aa  176  6e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  33.73 
 
 		 400 aa  176  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  30.32 
 
 		 393 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  31.22 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  28.84 
 
 		 398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  28.33 
 
 		 381 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  34.64 
 
 		 388 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  28.57 
 
 		 381 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  28.57 
 
 		 381 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  28.57 
 
 		 381 aa  172  9e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6046  aminotransferase class V  33.72 
 
 		 391 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  33.87 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  31.29 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  33.56 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  28.33 
 
 		 381 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  31.29 
 
 		 404 aa  170  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  27.6 
 
 		 381 aa  170  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  28.81 
 
 		 381 aa  169  6e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  26.89 
 
 		 392 aa  169  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  31.92 
 
 		 388 aa  169  8e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  31.81 
 
 		 400 aa  167  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  27.36 
 
 		 381 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  30.12 
 
 		 396 aa  167  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  28.07 
 
 		 398 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  31.31 
 
 		 402 aa  166  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  32.09 
 
 		 407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  33.03 
 
 		 422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  29.23 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  32.32 
 
 		 394 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  30 
 
 		 401 aa  164  4.0000000000000004e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  39.02 
 
 		 400 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  29.47 
 
 		 398 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1713  aminotransferase class V  28.2 
 
 		 380 aa  161  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  30.54 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1680  aminotransferase, class V  28.2 
 
 		 380 aa  161  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.399532  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  31.89 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  28.71 
 
 		 402 aa  160  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  30.61 
 
 		 399 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  29.41 
 
 		 401 aa  159  8e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  31.01 
 
 		 384 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  34.57 
 
 		 381 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  30.98 
 
 		 412 aa  157  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  31.72 
 
 		 418 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  30.35 
 
 		 386 aa  156  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  37.64 
 
 		 407 aa  156  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1186  aminotransferase, class V  26.24 
 
 		 380 aa  155  9e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  38.4 
 
 		 410 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  39.54 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  27.63 
 
 		 398 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  27.63 
 
 		 398 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0403  aminotransferase class V  31.13 
 
 		 378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  28.07 
 
 		 394 aa  154  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  30.47 
 
 		 388 aa  153  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  34.57 
 
 		 381 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  31.34 
 
 		 400 aa  153  7e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  29.34 
 
 		 380 aa  152  8e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  29.68 
 
 		 398 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  30.91 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>