More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3079 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3079  aminotransferase class V  100 
 
 		 398 aa  779    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000765371  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1288  aminotransferase class V  78.07 
 
 		 393 aa  518  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.322266  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2669  aminotransferase, class V  72.07 
 
 		 378 aa  505  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3533  cysteine desulfurase  64.27 
 
 		 383 aa  385  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3118  aminotransferase, class V  60.32 
 
 		 436 aa  380  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3142  cysteine desulfurase  59.33 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4129  aminotransferase class V  56.95 
 
 		 376 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3301  aminotransferase, class V  62.27 
 
 		 439 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.207407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1800  aminotransferase class V  60.89 
 
 		 409 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.345473 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2083  Cysteine desulfurase  51.22 
 
 		 371 aa  278  1e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15620  cysteine desulfurase family protein  47.64 
 
 		 384 aa  276  4e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.715718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1454  Cysteine desulfurase  47.59 
 
 		 397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369262  normal  0.276847 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  39.89 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  39.52 
 
 		 402 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  39.2 
 
 		 392 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  39.3 
 
 		 403 aa  258  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  37.87 
 
 		 414 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  40.91 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  35.83 
 
 		 392 aa  250  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  35.98 
 
 		 404 aa  250  4e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  35.36 
 
 		 393 aa  249  6e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  35.56 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1666  Cysteine desulfurase  56.97 
 
 		 420 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  40.64 
 
 		 379 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  36.1 
 
 		 396 aa  242  6e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  37.5 
 
 		 400 aa  242  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  37.67 
 
 		 394 aa  241  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  37.87 
 
 		 399 aa  238  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  34.04 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  34.93 
 
 		 398 aa  238  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  36.9 
 
 		 394 aa  236  4e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  37.77 
 
 		 404 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  37.7 
 
 		 382 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  33.95 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  33.16 
 
 		 384 aa  230  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  35.11 
 
 		 398 aa  230  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  35.11 
 
 		 398 aa  230  4e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  36.7 
 
 		 400 aa  229  9e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  37.14 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  36.88 
 
 		 409 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  35.83 
 
 		 396 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  37.23 
 
 		 384 aa  227  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  36.97 
 
 		 398 aa  226  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  36.9 
 
 		 399 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  40.95 
 
 		 395 aa  226  6e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  39.69 
 
 		 394 aa  224  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  38.3 
 
 		 388 aa  223  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  34.76 
 
 		 407 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  35.64 
 
 		 396 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  34.04 
 
 		 398 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  38.5 
 
 		 394 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  42.32 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  35.37 
 
 		 400 aa  220  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  37.14 
 
 		 400 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  34.22 
 
 		 389 aa  217  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  36.27 
 
 		 380 aa  216  7e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  37.73 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  35.54 
 
 		 392 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  35.71 
 
 		 389 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1297  aminotransferase class V  35.01 
 
 		 403 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.216598  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  34.57 
 
 		 401 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  34.57 
 
 		 401 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  32.9 
 
 		 406 aa  212  7e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  35.73 
 
 		 385 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  35.43 
 
 		 389 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  33.95 
 
 		 381 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  30.67 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  36.68 
 
 		 402 aa  211  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  33.95 
 
 		 381 aa  211  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  35.37 
 
 		 383 aa  210  4e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  33.16 
 
 		 402 aa  209  5e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  36.24 
 
 		 383 aa  209  7e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  33.95 
 
 		 381 aa  209  7e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  33.69 
 
 		 381 aa  209  7e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  34.76 
 
 		 401 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  33.42 
 
 		 381 aa  209  8e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  33.42 
 
 		 381 aa  209  9e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  41.71 
 
 		 381 aa  209  9e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  33.96 
 
 		 398 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  36.7 
 
 		 397 aa  207  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  33.42 
 
 		 381 aa  207  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  39.9 
 
 		 418 aa  206  5e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  31.84 
 
 		 386 aa  206  6e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  33.16 
 
 		 381 aa  205  9e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  36.2 
 
 		 389 aa  205  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  37.77 
 
 		 410 aa  205  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  33.16 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  33.16 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  39.11 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2295  aminotransferase class V  34.45 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0121543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  33.16 
 
 		 400 aa  205  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  34.31 
 
 		 402 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  33.69 
 
 		 389 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  32.89 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  39.27 
 
 		 387 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  34.2 
 
 		 400 aa  204  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  41.44 
 
 		 381 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  39.15 
 
 		 387 aa  203  5e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  33.42 
 
 		 393 aa  203  6e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  32.12 
 
 		 401 aa  202  6e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>