More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15620 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_15620  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 		 384 aa  735    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.715718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2083  Cysteine desulfurase  60.85 
 
 		 371 aa  352  8.999999999999999e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1454  Cysteine desulfurase  52.22 
 
 		 397 aa  329  6e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369262  normal  0.276847 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1288  aminotransferase class V  53.14 
 
 		 393 aa  322  7e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.322266  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4129  aminotransferase class V  49.61 
 
 		 376 aa  321  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2669  aminotransferase, class V  50.79 
 
 		 378 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3533  cysteine desulfurase  54.15 
 
 		 383 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3301  aminotransferase, class V  53.89 
 
 		 439 aa  298  8e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.207407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3079  aminotransferase class V  47.64 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000765371  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3142  cysteine desulfurase  47.12 
 
 		 379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3118  aminotransferase, class V  46.15 
 
 		 436 aa  264  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1800  aminotransferase class V  46.82 
 
 		 409 aa  248  9e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.345473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1666  Cysteine desulfurase  50.6 
 
 		 420 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  32.16 
 
 		 402 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  32.07 
 
 		 396 aa  186  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  30.05 
 
 		 414 aa  186  8e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  33.77 
 
 		 404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  31.11 
 
 		 400 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  31.25 
 
 		 398 aa  182  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  31.95 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  30.65 
 
 		 403 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  31.25 
 
 		 402 aa  178  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  30.43 
 
 		 392 aa  177  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  29.43 
 
 		 393 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  32.81 
 
 		 399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  28.17 
 
 		 398 aa  173  5.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  29.61 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  27.41 
 
 		 396 aa  171  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  37.63 
 
 		 387 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  32.48 
 
 		 400 aa  169  5e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  28.61 
 
 		 394 aa  169  7e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  28.05 
 
 		 384 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  27.39 
 
 		 404 aa  167  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  30.21 
 
 		 400 aa  166  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  32.47 
 
 		 379 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  32.73 
 
 		 388 aa  166  8e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  29.27 
 
 		 394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  27.86 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  28.39 
 
 		 384 aa  164  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  30.05 
 
 		 398 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  32.13 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  32.9 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  31.17 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  32.22 
 
 		 397 aa  160  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  31.25 
 
 		 399 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  30.65 
 
 		 396 aa  158  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  30.39 
 
 		 396 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  26.87 
 
 		 382 aa  158  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  31.87 
 
 		 382 aa  158  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  31.03 
 
 		 384 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  32.21 
 
 		 400 aa  156  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  29.53 
 
 		 407 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  32.09 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  34.97 
 
 		 388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  29.95 
 
 		 400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  34.97 
 
 		 387 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  31.01 
 
 		 390 aa  152  8e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  30.05 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  28.42 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  30.91 
 
 		 401 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  29.7 
 
 		 397 aa  150  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  30.75 
 
 		 388 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  34.18 
 
 		 418 aa  150  5e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  33.25 
 
 		 387 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  32.56 
 
 		 384 aa  149  9e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  35.04 
 
 		 388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  26.87 
 
 		 389 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  29.61 
 
 		 398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  32.34 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  30.33 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  29.85 
 
 		 403 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  29.17 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  30.85 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  29.17 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  29.74 
 
 		 391 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  26.55 
 
 		 398 aa  145  9e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  26.55 
 
 		 398 aa  145  9e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  29.31 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  28.97 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  29.08 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  29.79 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  34.26 
 
 		 422 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  32.92 
 
 		 412 aa  143  6e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  28.83 
 
 		 393 aa  142  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  32.65 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  29.16 
 
 		 391 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  32.13 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1105  Cysteine desulfurase  38.61 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.00251554 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1672  aminotransferase class V  30.96 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.374492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  36.3 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  26.22 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  27.06 
 
 		 386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  29.27 
 
 		 389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  30.38 
 
 		 397 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1680  aminotransferase, class V  24.55 
 
 		 380 aa  139  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.399532  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  29.34 
 
 		 401 aa  139  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  31.27 
 
 		 407 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  30.77 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1713  aminotransferase class V  24.55 
 
 		 380 aa  139  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1297  aminotransferase class V  27.16 
 
 		 403 aa  138  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.216598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>