More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1800 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1800  aminotransferase class V  100 
 
 		 409 aa  780    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.345473 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3118  aminotransferase, class V  77.45 
 
 		 436 aa  558  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2669  aminotransferase, class V  61.88 
 
 		 378 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3079  aminotransferase class V  60.89 
 
 		 398 aa  398  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000765371  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1288  aminotransferase class V  62.18 
 
 		 393 aa  396  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.322266  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3301  aminotransferase, class V  59.07 
 
 		 439 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.207407 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3533  cysteine desulfurase  60.72 
 
 		 383 aa  352  7e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4129  aminotransferase class V  51.17 
 
 		 376 aa  319  7e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3142  cysteine desulfurase  51.7 
 
 		 379 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  40.21 
 
 		 392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  39.63 
 
 		 403 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  37.89 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  37.47 
 
 		 394 aa  262  8.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15620  cysteine desulfurase family protein  46.82 
 
 		 384 aa  260  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.715718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  36.65 
 
 		 414 aa  259  6e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  37.6 
 
 		 394 aa  257  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  36.75 
 
 		 402 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  36.27 
 
 		 392 aa  255  8e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  38.16 
 
 		 396 aa  253  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  38.16 
 
 		 382 aa  248  1e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2083  Cysteine desulfurase  48.56 
 
 		 371 aa  247  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  35.53 
 
 		 398 aa  243  5e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  35 
 
 		 384 aa  243  5e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  39.54 
 
 		 409 aa  243  6e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  38.68 
 
 		 399 aa  241  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  35 
 
 		 398 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  35 
 
 		 398 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  34.74 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  35.96 
 
 		 394 aa  238  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  38.48 
 
 		 398 aa  237  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  38.32 
 
 		 390 aa  236  7e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  34.29 
 
 		 396 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  35.53 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  33.86 
 
 		 398 aa  233  6e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  33.67 
 
 		 404 aa  232  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  35.55 
 
 		 401 aa  230  3e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  33.33 
 
 		 398 aa  230  4e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  35.86 
 
 		 392 aa  230  4e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  36.72 
 
 		 400 aa  229  5e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1454  Cysteine desulfurase  43.24 
 
 		 397 aa  228  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369262  normal  0.276847 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  37.17 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  36.01 
 
 		 401 aa  228  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  37.43 
 
 		 379 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  40.76 
 
 		 395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  33.51 
 
 		 406 aa  224  2e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  35.51 
 
 		 380 aa  223  4e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  34.01 
 
 		 401 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  34.26 
 
 		 398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  34.21 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  39.9 
 
 		 422 aa  218  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  34.85 
 
 		 397 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  35.7 
 
 		 389 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  38.48 
 
 		 388 aa  216  7e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  34.74 
 
 		 384 aa  216  7e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  34.38 
 
 		 396 aa  215  9e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  33.16 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  34.01 
 
 		 398 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2532  cysteine desulfurase  33.6 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  34.96 
 
 		 381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  34.01 
 
 		 398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  34.15 
 
 		 381 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  34.69 
 
 		 381 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  34.38 
 
 		 400 aa  213  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  34.69 
 
 		 381 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  35.17 
 
 		 389 aa  212  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  34.91 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  34.69 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  35.15 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  34.42 
 
 		 381 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  34.42 
 
 		 381 aa  209  8e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  34.42 
 
 		 381 aa  209  8e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  35.43 
 
 		 404 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  34.74 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  34.2 
 
 		 391 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  34.15 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  35.75 
 
 		 389 aa  206  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  35.81 
 
 		 394 aa  206  6e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  40 
 
 		 418 aa  206  7e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  34.19 
 
 		 404 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  34.19 
 
 		 404 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  34.19 
 
 		 404 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  34.19 
 
 		 404 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  33.51 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  34.19 
 
 		 404 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  36.63 
 
 		 380 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2910  Cysteine desulfurase  42.57 
 
 		 401 aa  205  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  34.45 
 
 		 404 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  32.81 
 
 		 407 aa  204  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  41.18 
 
 		 384 aa  204  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5030  aminotransferase class V  38.98 
 
 		 388 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  40.31 
 
 		 387 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  33.93 
 
 		 404 aa  203  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  33.93 
 
 		 404 aa  203  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  33.93 
 
 		 404 aa  203  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  33.93 
 
 		 404 aa  203  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  33.93 
 
 		 404 aa  203  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  33.93 
 
 		 404 aa  203  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  33.93 
 
 		 404 aa  203  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  33.93 
 
 		 404 aa  203  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  33.93 
 
 		 404 aa  203  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>