More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2083 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2083  Cysteine desulfurase  100 
 
 		 371 aa  698    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15620  cysteine desulfurase family protein  60.85 
 
 		 384 aa  358  9.999999999999999e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.715718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1454  Cysteine desulfurase  54.03 
 
 		 397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369262  normal  0.276847 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1288  aminotransferase class V  52.14 
 
 		 393 aa  292  7e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.322266  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3079  aminotransferase class V  52.02 
 
 		 398 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000765371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2669  aminotransferase, class V  49.73 
 
 		 378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3301  aminotransferase, class V  52.67 
 
 		 439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.207407 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3142  cysteine desulfurase  50 
 
 		 379 aa  269  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4129  aminotransferase class V  46.22 
 
 		 376 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3533  cysteine desulfurase  51.34 
 
 		 383 aa  260  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3118  aminotransferase, class V  48.81 
 
 		 436 aa  257  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1800  aminotransferase class V  48.56 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.345473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1666  Cysteine desulfurase  45.82 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  29.17 
 
 		 396 aa  157  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  30.26 
 
 		 392 aa  156  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  30.85 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  29.72 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  30.03 
 
 		 389 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  28.69 
 
 		 398 aa  152  7e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  29.95 
 
 		 403 aa  152  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  28.61 
 
 		 393 aa  150  5e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  29.89 
 
 		 414 aa  149  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  32.23 
 
 		 409 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  27.54 
 
 		 398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  28.04 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  28.76 
 
 		 394 aa  143  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  27.81 
 
 		 392 aa  139  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  33.61 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  30.29 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  29.06 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  29.07 
 
 		 394 aa  137  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  30.59 
 
 		 379 aa  136  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  31.08 
 
 		 388 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  28.31 
 
 		 394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  25.8 
 
 		 382 aa  134  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  26.49 
 
 		 384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  26.74 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  29.26 
 
 		 399 aa  130  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  31.4 
 
 		 390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  25.48 
 
 		 384 aa  129  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  28.24 
 
 		 381 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  30.13 
 
 		 396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  26.47 
 
 		 401 aa  125  9e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  27.87 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  27.01 
 
 		 398 aa  124  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  30.08 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  27.59 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  30.08 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  29.79 
 
 		 388 aa  123  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  28.23 
 
 		 400 aa  123  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  29.09 
 
 		 400 aa  123  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  26.78 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  32.37 
 
 		 384 aa  123  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6046  aminotransferase class V  35.34 
 
 		 391 aa  123  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  27.3 
 
 		 381 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  27.3 
 
 		 381 aa  122  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  25.91 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  27.51 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  33.81 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  28.91 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  27.3 
 
 		 381 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  27.2 
 
 		 397 aa  120  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  28.29 
 
 		 381 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  29.12 
 
 		 382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  29.92 
 
 		 410 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  27.3 
 
 		 381 aa  119  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  27.01 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  27.89 
 
 		 407 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  27.01 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1297  aminotransferase class V  27.6 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.216598  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  28.12 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  26.02 
 
 		 398 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  26.02 
 
 		 398 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  34.44 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  27.01 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3560  aminotransferase class V  34.77 
 
 		 377 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0251631  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  29.81 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1672  aminotransferase class V  28.89 
 
 		 384 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.374492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3965  cysteine desulfurase  34.24 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.707417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  27.59 
 
 		 401 aa  117  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  26.33 
 
 		 398 aa  116  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  28.8 
 
 		 383 aa  116  6e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  29.06 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  32.99 
 
 		 422 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  31.38 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2557  aminotransferase, class V  32.73 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102305  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  25.39 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  28.1 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  28.1 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2532  cysteine desulfurase  25.13 
 
 		 379 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  28.92 
 
 		 396 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2294  aminotransferase class V  32.37 
 
 		 385 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  30.89 
 
 		 400 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  27.69 
 
 		 389 aa  113  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  27.97 
 
 		 389 aa  113  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1680  aminotransferase, class V  25.52 
 
 		 380 aa  113  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.399532  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1713  aminotransferase class V  25.52 
 
 		 380 aa  113  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  24.14 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  27.32 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  30.42 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>