More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3301 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3301  aminotransferase, class V  100 
 
 		 439 aa  847    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.207407 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3533  cysteine desulfurase  90.6 
 
 		 383 aa  571  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1288  aminotransferase class V  66.58 
 
 		 393 aa  434  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.322266  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2669  aminotransferase, class V  66.04 
 
 		 378 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4129  aminotransferase class V  62.07 
 
 		 376 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3079  aminotransferase class V  63.2 
 
 		 398 aa  421  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000765371  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3118  aminotransferase, class V  57.33 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1800  aminotransferase class V  59.07 
 
 		 409 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.345473 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3142  cysteine desulfurase  58.24 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15620  cysteine desulfurase family protein  53.89 
 
 		 384 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.715718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1454  Cysteine desulfurase  51.72 
 
 		 397 aa  297  3e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369262  normal  0.276847 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2083  Cysteine desulfurase  52.67 
 
 		 371 aa  292  8e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1666  Cysteine desulfurase  58.96 
 
 		 420 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  35.98 
 
 		 392 aa  250  4e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  36.07 
 
 		 402 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  36.44 
 
 		 396 aa  246  6e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  35.11 
 
 		 394 aa  236  6e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  35.11 
 
 		 394 aa  236  8e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  33.95 
 
 		 414 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  33.07 
 
 		 392 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  38.1 
 
 		 379 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  33.78 
 
 		 398 aa  233  7.000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  35.71 
 
 		 400 aa  230  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  37.98 
 
 		 409 aa  229  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  33.95 
 
 		 393 aa  227  4e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  32.63 
 
 		 398 aa  225  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  32.03 
 
 		 384 aa  224  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  36.44 
 
 		 399 aa  223  7e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  35.88 
 
 		 398 aa  223  8e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  32.45 
 
 		 398 aa  222  9e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  35.17 
 
 		 399 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  39.39 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  36.6 
 
 		 390 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  34.38 
 
 		 384 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  34.3 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  31.94 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  31.68 
 
 		 404 aa  218  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  34.48 
 
 		 407 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  33.69 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  34.92 
 
 		 404 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  32.29 
 
 		 398 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  32.29 
 
 		 398 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  33.69 
 
 		 389 aa  216  7e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  36.34 
 
 		 388 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  31.75 
 
 		 396 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  33.78 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  35.81 
 
 		 382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  36.75 
 
 		 388 aa  211  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  31.38 
 
 		 382 aa  210  4e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  34.04 
 
 		 394 aa  209  7e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  34.31 
 
 		 396 aa  207  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  33.77 
 
 		 402 aa  207  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  32.8 
 
 		 396 aa  207  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  33.68 
 
 		 393 aa  207  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  35.26 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  32.28 
 
 		 386 aa  204  2e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  33.51 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  34.55 
 
 		 402 aa  203  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  33.24 
 
 		 381 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  32.9 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  31.93 
 
 		 389 aa  201  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  34.38 
 
 		 397 aa  200  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  32.81 
 
 		 417 aa  199  7e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  36.44 
 
 		 394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  33.42 
 
 		 392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  32.18 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  32.45 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  32.45 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  32.18 
 
 		 381 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  31.65 
 
 		 381 aa  196  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  32.36 
 
 		 401 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  34.53 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  32.36 
 
 		 401 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  31.91 
 
 		 381 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  31.91 
 
 		 381 aa  194  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  31.91 
 
 		 381 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  31.91 
 
 		 381 aa  194  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  32.81 
 
 		 403 aa  193  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  31.91 
 
 		 381 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1680  aminotransferase, class V  30 
 
 		 380 aa  193  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.399532  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  38.4 
 
 		 418 aa  193  4e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1713  aminotransferase class V  30 
 
 		 380 aa  193  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  31.78 
 
 		 401 aa  193  5e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  31.4 
 
 		 389 aa  193  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  33.95 
 
 		 400 aa  193  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1297  aminotransferase class V  32.72 
 
 		 403 aa  191  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.216598  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  32.55 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  32.45 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  34.66 
 
 		 386 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  37.11 
 
 		 422 aa  190  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  38.38 
 
 		 387 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1186  aminotransferase, class V  29.29 
 
 		 380 aa  189  8e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  32.37 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  37.2 
 
 		 404 aa  189  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  30.05 
 
 		 393 aa  189  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  30.87 
 
 		 389 aa  188  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  38.75 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  31.4 
 
 		 388 aa  187  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  32.89 
 
 		 401 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6046  aminotransferase class V  40.77 
 
 		 391 aa  186  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>