More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3533 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3533  cysteine desulfurase  100 
 
 
383 aa  731    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3301  aminotransferase, class V  90.6 
 
 
439 aa  569  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.207407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3079  aminotransferase class V  64.27 
 
 
398 aa  427  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000765371  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1288  aminotransferase class V  65.78 
 
 
393 aa  422  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.322266  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2669  aminotransferase, class V  64.44 
 
 
378 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190508  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4129  aminotransferase class V  60.74 
 
 
376 aa  411  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3118  aminotransferase, class V  57.47 
 
 
436 aa  381  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646431  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1800  aminotransferase class V  60.72 
 
 
409 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.345473 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3142  cysteine desulfurase  57.18 
 
 
379 aa  359  4e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15620  cysteine desulfurase family protein  54.15 
 
 
384 aa  323  3e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.715718  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1454  Cysteine desulfurase  50 
 
 
397 aa  287  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369262  normal  0.276847 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2083  Cysteine desulfurase  51.34 
 
 
371 aa  280  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1666  Cysteine desulfurase  58.96 
 
 
420 aa  266  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  36.7 
 
 
396 aa  251  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  36.34 
 
 
402 aa  249  8e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  35.98 
 
 
392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  35.37 
 
 
394 aa  237  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  33.07 
 
 
392 aa  234  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  33.95 
 
 
414 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  34.65 
 
 
394 aa  232  9e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  33.25 
 
 
393 aa  232  1e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  37.3 
 
 
379 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  35.94 
 
 
398 aa  228  9e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  37.21 
 
 
409 aa  226  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  32.98 
 
 
398 aa  226  6e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  31.77 
 
 
384 aa  225  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  38.64 
 
 
395 aa  223  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  32.71 
 
 
398 aa  223  4.9999999999999996e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  32.28 
 
 
398 aa  223  6e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  34.66 
 
 
400 aa  222  7e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  32.45 
 
 
404 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  36.6 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  35.64 
 
 
399 aa  219  6e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  36.64 
 
 
382 aa  218  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  36.07 
 
 
388 aa  218  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  31.41 
 
 
384 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  34.57 
 
 
403 aa  218  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  35.32 
 
 
399 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  37.05 
 
 
388 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  35 
 
 
404 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  32.2 
 
 
389 aa  212  7e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  32.98 
 
 
402 aa  212  9e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  30.95 
 
 
396 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  33.95 
 
 
394 aa  210  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  33.25 
 
 
400 aa  209  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  33.51 
 
 
384 aa  209  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  31.65 
 
 
382 aa  209  9e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  33.42 
 
 
407 aa  207  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  31.51 
 
 
398 aa  206  5e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  31.51 
 
 
398 aa  206  5e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  34.55 
 
 
402 aa  206  7e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  33.16 
 
 
402 aa  203  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  32.28 
 
 
396 aa  202  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  34.38 
 
 
397 aa  202  6e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  33.33 
 
 
400 aa  202  9e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  32.99 
 
 
401 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1297  aminotransferase class V  33.77 
 
 
403 aa  200  3e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.216598  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  34.47 
 
 
394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  33.51 
 
 
396 aa  199  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  33.07 
 
 
393 aa  199  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  33.42 
 
 
392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  38.12 
 
 
393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  39.64 
 
 
418 aa  196  6e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  32.65 
 
 
401 aa  196  7e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  33.07 
 
 
417 aa  195  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  39.95 
 
 
384 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  33.76 
 
 
394 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  39.03 
 
 
387 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  31.23 
 
 
386 aa  192  6e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  33.42 
 
 
383 aa  192  1e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  31.65 
 
 
381 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  33.77 
 
 
397 aa  191  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  30.18 
 
 
393 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  35.08 
 
 
386 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  35.14 
 
 
394 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  37.2 
 
 
404 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  37.82 
 
 
422 aa  190  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  30.87 
 
 
389 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  39.33 
 
 
387 aa  189  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  32.9 
 
 
383 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  31.12 
 
 
381 aa  188  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  30.85 
 
 
381 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  30.85 
 
 
381 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  32.55 
 
 
403 aa  188  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  31.12 
 
 
381 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  31.32 
 
 
401 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6046  aminotransferase class V  41.75 
 
 
391 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  31.32 
 
 
401 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  30.59 
 
 
381 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  31.4 
 
 
389 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  31.52 
 
 
401 aa  187  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1713  aminotransferase class V  29.47 
 
 
380 aa  186  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1680  aminotransferase, class V  29.47 
 
 
380 aa  186  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.399532  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  29.55 
 
 
406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  30.59 
 
 
381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  30.59 
 
 
381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  32.9 
 
 
400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  30.59 
 
 
381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  30.59 
 
 
381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  30.59 
 
 
381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>