More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1288 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1288  aminotransferase class V  100 
 
 		 393 aa  765    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.322266  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2669  aminotransferase, class V  79.58 
 
 		 378 aa  565  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3079  aminotransferase class V  78.07 
 
 		 398 aa  543  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000765371  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4129  aminotransferase class V  63.49 
 
 		 376 aa  438  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3301  aminotransferase, class V  66.58 
 
 		 439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.207407 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3118  aminotransferase, class V  62.27 
 
 		 436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3142  cysteine desulfurase  61.5 
 
 		 379 aa  403  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3533  cysteine desulfurase  65.78 
 
 		 383 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1800  aminotransferase class V  62.18 
 
 		 409 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.345473 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15620  cysteine desulfurase family protein  53.14 
 
 		 384 aa  326  5e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.715718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2083  Cysteine desulfurase  52.14 
 
 		 371 aa  301  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1454  Cysteine desulfurase  47.99 
 
 		 397 aa  291  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369262  normal  0.276847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1666  Cysteine desulfurase  61.75 
 
 		 420 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  38.46 
 
 		 392 aa  259  7e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  36.7 
 
 		 414 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  37.23 
 
 		 402 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  38.16 
 
 		 400 aa  247  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  37.07 
 
 		 394 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  37.4 
 
 		 403 aa  241  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  34.57 
 
 		 392 aa  239  5.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  34.48 
 
 		 398 aa  239  8e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  35.71 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  39.73 
 
 		 379 aa  236  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  37.3 
 
 		 398 aa  232  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  37.77 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  37.89 
 
 		 409 aa  230  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  35.53 
 
 		 394 aa  229  9e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  37.14 
 
 		 404 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  38.62 
 
 		 388 aa  227  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  32.8 
 
 		 393 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  35.47 
 
 		 407 aa  225  9e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  33.24 
 
 		 384 aa  225  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  35.79 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  33.24 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  33.25 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  33.78 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  33.95 
 
 		 404 aa  223  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  36.53 
 
 		 399 aa  223  4e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  37.3 
 
 		 388 aa  222  7e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  37.57 
 
 		 400 aa  222  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  40.88 
 
 		 395 aa  219  7e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  34.74 
 
 		 400 aa  219  8.999999999999998e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  34.84 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  37.04 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  35 
 
 		 389 aa  217  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  39.79 
 
 		 393 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  35.71 
 
 		 399 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  37.92 
 
 		 394 aa  216  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  40.26 
 
 		 387 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  32.72 
 
 		 396 aa  216  7e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  34.04 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  37.43 
 
 		 410 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  35 
 
 		 400 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  33.16 
 
 		 398 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  33.16 
 
 		 398 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  33.42 
 
 		 401 aa  213  5.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  33.33 
 
 		 402 aa  211  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  35.37 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  34.72 
 
 		 401 aa  210  3e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  35.06 
 
 		 392 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  35.93 
 
 		 407 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  36.41 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  36.84 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  39.64 
 
 		 384 aa  206  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  34.92 
 
 		 407 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  41.28 
 
 		 388 aa  206  7e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  35.43 
 
 		 402 aa  205  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  33.6 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  39.16 
 
 		 422 aa  203  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  40.05 
 
 		 383 aa  204  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  33.24 
 
 		 404 aa  203  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  37.8 
 
 		 404 aa  203  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  32.9 
 
 		 386 aa  202  9.999999999999999e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  39.18 
 
 		 418 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  35.09 
 
 		 397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  34.82 
 
 		 397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  35 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  34.25 
 
 		 381 aa  200  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  28.84 
 
 		 382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  32.55 
 
 		 400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  33.7 
 
 		 381 aa  199  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  32.81 
 
 		 398 aa  199  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  34.91 
 
 		 381 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  33.7 
 
 		 381 aa  199  9e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  34.91 
 
 		 381 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  34.32 
 
 		 381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  32.8 
 
 		 401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  32.8 
 
 		 401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  33.25 
 
 		 401 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  33.16 
 
 		 389 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  40.94 
 
 		 381 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  32.81 
 
 		 397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  33.07 
 
 		 398 aa  196  7e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  32.98 
 
 		 398 aa  195  9e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  34.62 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  34.62 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  34.62 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  36.68 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  33.95 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  38.28 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>