More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4129 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4129  aminotransferase class V  100 
 
 		 376 aa  743    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2669  aminotransferase, class V  60.37 
 
 		 378 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1288  aminotransferase class V  63.32 
 
 		 393 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.322266  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3079  aminotransferase class V  56.95 
 
 		 398 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000765371  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3301  aminotransferase, class V  61.8 
 
 		 439 aa  361  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.207407 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3142  cysteine desulfurase  55.65 
 
 		 379 aa  355  5e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3533  cysteine desulfurase  60.58 
 
 		 383 aa  350  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3118  aminotransferase, class V  50.52 
 
 		 436 aa  300  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15620  cysteine desulfurase family protein  49.61 
 
 		 384 aa  297  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.715718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1800  aminotransferase class V  50.91 
 
 		 409 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.345473 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1454  Cysteine desulfurase  45.38 
 
 		 397 aa  249  6e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369262  normal  0.276847 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2083  Cysteine desulfurase  44.72 
 
 		 371 aa  237  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  34.99 
 
 		 392 aa  237  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  33.42 
 
 		 402 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  33.16 
 
 		 394 aa  222  7e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  32.62 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  30.29 
 
 		 392 aa  220  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  31.77 
 
 		 384 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  34.28 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  31.51 
 
 		 384 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  31.32 
 
 		 398 aa  212  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  32.54 
 
 		 398 aa  210  3e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  31.94 
 
 		 394 aa  210  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  32.22 
 
 		 414 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  29.44 
 
 		 404 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  32.11 
 
 		 396 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  34.66 
 
 		 398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  35.2 
 
 		 390 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  34.73 
 
 		 388 aa  196  7e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  32.8 
 
 		 394 aa  192  7e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  30.37 
 
 		 382 aa  192  8e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  32.53 
 
 		 399 aa  192  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  32.11 
 
 		 407 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  38.18 
 
 		 388 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  32.81 
 
 		 404 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  30.4 
 
 		 398 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  34.56 
 
 		 388 aa  189  5.999999999999999e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  28.84 
 
 		 396 aa  189  7e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  33.25 
 
 		 403 aa  189  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  32.9 
 
 		 401 aa  189  7e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  34.1 
 
 		 382 aa  189  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1186  aminotransferase, class V  30.45 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  28.76 
 
 		 398 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  28.76 
 
 		 398 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  32.72 
 
 		 379 aa  186  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  37.08 
 
 		 387 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  36.27 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  33.16 
 
 		 409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  32.12 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  30.71 
 
 		 393 aa  183  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  32.47 
 
 		 398 aa  184  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  34.28 
 
 		 410 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  32.98 
 
 		 400 aa  182  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4176  cysteine desulfurase  29.16 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0211822  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  32.64 
 
 		 401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  31.88 
 
 		 384 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  29.47 
 
 		 389 aa  179  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  31.77 
 
 		 402 aa  179  7e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  36.88 
 
 		 384 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  33.42 
 
 		 407 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  31.85 
 
 		 396 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  31.33 
 
 		 389 aa  177  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  31.58 
 
 		 400 aa  177  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  32.46 
 
 		 393 aa  177  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  32.25 
 
 		 381 aa  176  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1680  aminotransferase, class V  29.4 
 
 		 380 aa  176  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.399532  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1713  aminotransferase class V  29.4 
 
 		 380 aa  176  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  32.63 
 
 		 399 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  32.39 
 
 		 392 aa  176  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  33.07 
 
 		 400 aa  176  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  31.35 
 
 		 398 aa  176  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4511  cysteine desulfurase  28.61 
 
 		 379 aa  175  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.372925 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4328  cysteine desulfurase  28.61 
 
 		 379 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4663  cysteine desulfurase  28.61 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  31.84 
 
 		 407 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  32.47 
 
 		 401 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4564  cysteine desulfurase  28.61 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4165  cysteine desulfurase  28.34 
 
 		 379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  32.9 
 
 		 402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  33.16 
 
 		 395 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  32.01 
 
 		 402 aa  173  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  36.43 
 
 		 418 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  30.39 
 
 		 391 aa  172  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4516  cysteine desulfurase  28.65 
 
 		 379 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  31.68 
 
 		 404 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  31.17 
 
 		 381 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  31.68 
 
 		 404 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  31.68 
 
 		 404 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  31.68 
 
 		 404 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  31.01 
 
 		 406 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  31.68 
 
 		 404 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  36.03 
 
 		 422 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08620  cysteine desulfurase family protein  35.79 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.702147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  32.63 
 
 		 397 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  31.27 
 
 		 398 aa  170  4e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  30.29 
 
 		 396 aa  170  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  31.78 
 
 		 380 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  31.41 
 
 		 404 aa  169  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  31.68 
 
 		 404 aa  169  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  31.68 
 
 		 404 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>