More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2669 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2669  aminotransferase, class V  100 
 
 		 378 aa  743    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1288  aminotransferase class V  79.58 
 
 		 393 aa  551  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.322266  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3079  aminotransferase class V  72.07 
 
 		 398 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000765371  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4129  aminotransferase class V  61.44 
 
 		 376 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3301  aminotransferase, class V  66.04 
 
 		 439 aa  396  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.207407 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3142  cysteine desulfurase  58.82 
 
 		 379 aa  392  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3533  cysteine desulfurase  64.44 
 
 		 383 aa  385  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3118  aminotransferase, class V  60.16 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1800  aminotransferase class V  61.88 
 
 		 409 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.345473 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15620  cysteine desulfurase family protein  50.79 
 
 		 384 aa  305  8.000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.715718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2083  Cysteine desulfurase  49.73 
 
 		 371 aa  271  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1666  Cysteine desulfurase  58.87 
 
 		 420 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1454  Cysteine desulfurase  46.52 
 
 		 397 aa  265  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369262  normal  0.276847 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  38.3 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  37.47 
 
 		 402 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  36.07 
 
 		 414 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  36.24 
 
 		 394 aa  243  5e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  35.81 
 
 		 396 aa  238  9e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  37.3 
 
 		 403 aa  238  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  35.71 
 
 		 394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  33.07 
 
 		 398 aa  236  6e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  38.36 
 
 		 379 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  36.34 
 
 		 398 aa  229  9e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  33.24 
 
 		 392 aa  228  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  34.75 
 
 		 400 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  35.37 
 
 		 407 aa  227  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  36.55 
 
 		 404 aa  227  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  36.87 
 
 		 399 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  33.51 
 
 		 404 aa  225  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  37.02 
 
 		 409 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  36.53 
 
 		 399 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  37.2 
 
 		 388 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  32.8 
 
 		 398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  32.27 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  32.45 
 
 		 396 aa  220  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  31.47 
 
 		 384 aa  219  5e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  34.67 
 
 		 394 aa  219  8.999999999999998e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  32.28 
 
 		 398 aa  219  8.999999999999998e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  40.94 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  35.2 
 
 		 402 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  36.53 
 
 		 390 aa  217  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  37.04 
 
 		 388 aa  216  4e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  34.91 
 
 		 382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  35.81 
 
 		 400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  31.3 
 
 		 393 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  40.26 
 
 		 422 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  38.48 
 
 		 395 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  34.13 
 
 		 384 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  32.45 
 
 		 398 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  32.45 
 
 		 398 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  35.2 
 
 		 401 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  35.84 
 
 		 394 aa  209  6e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  34.46 
 
 		 392 aa  209  7e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  33.33 
 
 		 401 aa  209  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  33.33 
 
 		 401 aa  209  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  33.07 
 
 		 401 aa  207  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  34.2 
 
 		 397 aa  206  5e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  33.69 
 
 		 396 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  33.33 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  39.53 
 
 		 418 aa  205  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  34.56 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  39.9 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  32.63 
 
 		 389 aa  203  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  32.53 
 
 		 398 aa  202  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  41.41 
 
 		 388 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  36.07 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  32.54 
 
 		 381 aa  200  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  28.04 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  32.54 
 
 		 381 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  31.75 
 
 		 381 aa  199  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  32.28 
 
 		 381 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  32.28 
 
 		 381 aa  199  9e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  35.36 
 
 		 410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  34.66 
 
 		 402 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  32.55 
 
 		 396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  33.07 
 
 		 401 aa  197  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  32.72 
 
 		 398 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  32.01 
 
 		 381 aa  196  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  32.27 
 
 		 400 aa  196  7e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  32.01 
 
 		 381 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  32.01 
 
 		 381 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1680  aminotransferase, class V  30.61 
 
 		 380 aa  195  9e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.399532  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1713  aminotransferase class V  30.61 
 
 		 380 aa  195  9e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  32.81 
 
 		 401 aa  195  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  31.56 
 
 		 386 aa  195  1e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  35.88 
 
 		 400 aa  195  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  38.71 
 
 		 383 aa  195  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  32.45 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  32.45 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  35.6 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  33.07 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  33.07 
 
 		 402 aa  193  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  31.48 
 
 		 381 aa  193  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  36.48 
 
 		 393 aa  194  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1875  aminotransferase, class V  40.73 
 
 		 397 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6046  aminotransferase class V  41.16 
 
 		 391 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1921  aminotransferase, class V  40.73 
 
 		 397 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173921  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1855  aminotransferase, class V  40.73 
 
 		 397 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712438  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  34.92 
 
 		 400 aa  192  9e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  34.39 
 
 		 402 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>