More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3118 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3118  aminotransferase, class V  100 
 
 		 436 aa  846    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1800  aminotransferase class V  77.45 
 
 		 409 aa  526  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.345473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3079  aminotransferase class V  60.32 
 
 		 398 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000765371  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1288  aminotransferase class V  62.27 
 
 		 393 aa  386  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.322266  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2669  aminotransferase, class V  60.16 
 
 		 378 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3301  aminotransferase, class V  57.33 
 
 		 439 aa  338  8e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.207407 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3533  cysteine desulfurase  57.47 
 
 		 383 aa  338  9e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4129  aminotransferase class V  50.52 
 
 		 376 aa  317  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3142  cysteine desulfurase  50.51 
 
 		 379 aa  305  8.000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  41.27 
 
 		 392 aa  272  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  39.69 
 
 		 392 aa  270  4e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  39.58 
 
 		 402 aa  269  8.999999999999999e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  40.58 
 
 		 394 aa  266  8e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  39.58 
 
 		 394 aa  261  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15620  cysteine desulfurase family protein  46.15 
 
 		 384 aa  259  6e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.715718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  39.15 
 
 		 400 aa  259  6e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  39.64 
 
 		 403 aa  251  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  36.65 
 
 		 414 aa  250  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  38.03 
 
 		 396 aa  247  4e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  36.44 
 
 		 384 aa  243  5e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  40.68 
 
 		 382 aa  242  7e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  36.81 
 
 		 384 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  40.49 
 
 		 409 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  36.17 
 
 		 393 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2083  Cysteine desulfurase  48.02 
 
 		 371 aa  238  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  35.7 
 
 		 398 aa  238  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  36.48 
 
 		 394 aa  236  7e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  38.99 
 
 		 390 aa  236  9e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  39.69 
 
 		 398 aa  235  9e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  39.43 
 
 		 388 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  35.43 
 
 		 396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  34.75 
 
 		 398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  35.14 
 
 		 404 aa  233  5e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  38.48 
 
 		 401 aa  232  8.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  42.08 
 
 		 388 aa  231  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  37.31 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  34.73 
 
 		 398 aa  230  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  35.08 
 
 		 398 aa  230  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  35.08 
 
 		 398 aa  230  4e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  41.77 
 
 		 395 aa  227  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  36.65 
 
 		 401 aa  225  1e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  36.7 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  37.3 
 
 		 379 aa  224  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  35.64 
 
 		 401 aa  224  3e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  37.56 
 
 		 392 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  35.86 
 
 		 389 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  36.07 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  35.75 
 
 		 397 aa  219  6e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  33.77 
 
 		 406 aa  219  7e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  36.72 
 
 		 384 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  40.71 
 
 		 422 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  35.08 
 
 		 407 aa  217  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1454  Cysteine desulfurase  43.47 
 
 		 397 aa  216  9e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369262  normal  0.276847 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  36.34 
 
 		 404 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  35.36 
 
 		 380 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  40.1 
 
 		 418 aa  211  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2295  aminotransferase class V  35.55 
 
 		 394 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0121543 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  34.88 
 
 		 398 aa  210  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  34.15 
 
 		 381 aa  209  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  36.72 
 
 		 400 aa  209  6e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  34.97 
 
 		 398 aa  209  8e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  35.34 
 
 		 399 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  33.97 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  33.97 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  35.62 
 
 		 396 aa  207  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  34.91 
 
 		 386 aa  207  4e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  33.33 
 
 		 402 aa  207  4e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  33.7 
 
 		 381 aa  206  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  33.7 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  34.75 
 
 		 396 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1666  Cysteine desulfurase  51.17 
 
 		 420 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2910  Cysteine desulfurase  41.83 
 
 		 401 aa  205  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  33.88 
 
 		 381 aa  204  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  40.58 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  34.96 
 
 		 404 aa  203  5e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  33.42 
 
 		 381 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  34.96 
 
 		 404 aa  202  9e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  35.5 
 
 		 389 aa  202  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  33.15 
 
 		 381 aa  202  9e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  34.45 
 
 		 404 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  34.45 
 
 		 404 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  34.45 
 
 		 404 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  33.42 
 
 		 381 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  36.41 
 
 		 389 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  33.42 
 
 		 381 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  33.68 
 
 		 389 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  34.45 
 
 		 404 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  34.45 
 
 		 404 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  34.45 
 
 		 404 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  34.45 
 
 		 404 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  34.45 
 
 		 404 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  41.71 
 
 		 384 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  38.16 
 
 		 410 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  34.45 
 
 		 404 aa  202  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  30.61 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  35.6 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  34.7 
 
 		 404 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  33.15 
 
 		 381 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  34.38 
 
 		 404 aa  200  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  41.39 
 
 		 388 aa  200  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>