More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1454 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1454  Cysteine desulfurase  100 
 
 		 397 aa  789    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369262  normal  0.276847 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15620  cysteine desulfurase family protein  51.44 
 
 		 384 aa  331  1e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.715718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2083  Cysteine desulfurase  54.3 
 
 		 371 aa  300  3e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1288  aminotransferase class V  47.99 
 
 		 393 aa  290  3e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.322266  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3079  aminotransferase class V  47.59 
 
 		 398 aa  289  7e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000765371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2669  aminotransferase, class V  46.52 
 
 		 378 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4129  aminotransferase class V  45.38 
 
 		 376 aa  283  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3301  aminotransferase, class V  51.72 
 
 		 439 aa  281  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.207407 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3533  cysteine desulfurase  50 
 
 		 383 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3142  cysteine desulfurase  44.5 
 
 		 379 aa  268  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3118  aminotransferase, class V  43.32 
 
 		 436 aa  233  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1800  aminotransferase class V  43.24 
 
 		 409 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.345473 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  26.89 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  27.22 
 
 		 393 aa  140  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  28.29 
 
 		 392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  30.35 
 
 		 384 aa  139  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  30.51 
 
 		 400 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  29.48 
 
 		 402 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  26.72 
 
 		 396 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  27.61 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  33.15 
 
 		 387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  28.53 
 
 		 404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  31.1 
 
 		 388 aa  126  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  27.06 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  29.83 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  27.4 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  34.17 
 
 		 388 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  25.41 
 
 		 396 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  26.39 
 
 		 414 aa  123  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  28.34 
 
 		 407 aa  122  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  28.65 
 
 		 399 aa  122  9e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  26.33 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  24.65 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  25.63 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  26.72 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  25.27 
 
 		 398 aa  120  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  25.94 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6046  aminotransferase class V  33.52 
 
 		 391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  27.17 
 
 		 394 aa  119  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  27.32 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  27.44 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  24.05 
 
 		 401 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  24.05 
 
 		 401 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  29.4 
 
 		 409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  31.64 
 
 		 384 aa  117  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  27.69 
 
 		 393 aa  117  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  24.87 
 
 		 384 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  25.4 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  27.18 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  27.6 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  25.14 
 
 		 398 aa  112  9e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  27.56 
 
 		 382 aa  112  9e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2409  aminotransferase class V  33.15 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  31.19 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  26.92 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  25.66 
 
 		 405 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  24.72 
 
 		 398 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  24.72 
 
 		 398 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  28.3 
 
 		 379 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  25.7 
 
 		 401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  26.46 
 
 		 394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  31.44 
 
 		 400 aa  109  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  30.38 
 
 		 395 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  27.59 
 
 		 396 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  29.15 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  32.64 
 
 		 399 aa  109  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1737  homocysteine desulfhydrase  27.14 
 
 		 373 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.956175  normal  0.982172 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10430  cysteine desulfurase family protein  31.98 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  27.63 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  25.34 
 
 		 403 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  30.79 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  25.13 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  28.94 
 
 		 410 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  25.07 
 
 		 403 aa  107  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  27.7 
 
 		 397 aa  106  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  25.19 
 
 		 389 aa  106  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2257  aminotransferase class V  28.38 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  32.3 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  25.14 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  29.16 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  25 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  26.83 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  27.59 
 
 		 407 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  25.19 
 
 		 389 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1175  aminotransferase class V  32.58 
 
 		 381 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  25.27 
 
 		 398 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5192  aminotransferase class V  28.32 
 
 		 392 aa  102  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.34588 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  27.87 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2360  Cysteine desulfurase  30.95 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.66071 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  25.27 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2294  aminotransferase class V  29.38 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  26.72 
 
 		 407 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  29.53 
 
 		 418 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  27.32 
 
 		 383 aa  101  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  25.2 
 
 		 401 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  31.49 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  28.09 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1443  Cysteine desulfurase  30.59 
 
 		 400 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.751675  normal  0.957597 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  25.41 
 
 		 406 aa  100  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  27.85 
 
 		 381 aa  99.8  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>