More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1737 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1737  homocysteine desulfhydrase  100 
 
 		 373 aa  761    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.956175  normal  0.982172 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0289  aminotransferase, class V  74.12 
 
 		 389 aa  578  1e-164  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  49.06 
 
 		 384 aa  355  5e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  49.86 
 
 		 392 aa  354  1e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  48.53 
 
 		 394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  48.26 
 
 		 384 aa  351  1e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  44.8 
 
 		 392 aa  349  4e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  48.79 
 
 		 382 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  46.51 
 
 		 394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  45.33 
 
 		 398 aa  336  5e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  46.24 
 
 		 403 aa  335  7e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  46.11 
 
 		 399 aa  332  5e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  45.04 
 
 		 398 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  45.04 
 
 		 398 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  44.72 
 
 		 398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  46.81 
 
 		 394 aa  323  2e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  45.16 
 
 		 398 aa  322  6e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  43.7 
 
 		 388 aa  322  8e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  43.8 
 
 		 417 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  45.16 
 
 		 404 aa  319  6e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  45.53 
 
 		 393 aa  318  9e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  45.53 
 
 		 396 aa  317  2e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_002978  WD0997  cysteine desulfurase  44.15 
 
 		 415 aa  316  5e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  43.16 
 
 		 382 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  44.27 
 
 		 400 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  43.13 
 
 		 398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  47.15 
 
 		 390 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  43.47 
 
 		 414 aa  311  9e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  43.73 
 
 		 402 aa  311  9e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  45.14 
 
 		 404 aa  311  9e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  43.05 
 
 		 396 aa  311  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  42.93 
 
 		 405 aa  308  8e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  42.13 
 
 		 405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2373  cysteine desulfurase IscS  43.88 
 
 		 406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.934758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  42.25 
 
 		 393 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  44.04 
 
 		 409 aa  305  8.000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  44.09 
 
 		 404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  41.89 
 
 		 389 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  42.82 
 
 		 407 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  44.62 
 
 		 392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  44.77 
 
 		 396 aa  302  5.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2177  cysteine desulfurase IscS  41.87 
 
 		 430 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2059  cysteine desulfurase IscS  43.57 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0733618  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  43.57 
 
 		 406 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  42.29 
 
 		 407 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  42.02 
 
 		 407 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  42.13 
 
 		 405 aa  300  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  42.02 
 
 		 407 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  41.07 
 
 		 404 aa  300  3e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  41.76 
 
 		 407 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  42.71 
 
 		 410 aa  300  3e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  41.49 
 
 		 407 aa  299  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  41.22 
 
 		 405 aa  299  6e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  41.76 
 
 		 407 aa  299  6e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  41.02 
 
 		 407 aa  298  7e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  41.76 
 
 		 408 aa  299  7e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  41.49 
 
 		 403 aa  298  8e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  44.44 
 
 		 406 aa  298  8e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  41.49 
 
 		 407 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0830  cysteine desulfurase IscS  42.26 
 
 		 407 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  41.22 
 
 		 407 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  41.49 
 
 		 407 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  41.49 
 
 		 407 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  41.49 
 
 		 407 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  41.22 
 
 		 407 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  41.76 
 
 		 406 aa  296  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  42.67 
 
 		 422 aa  296  4e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  42.49 
 
 		 395 aa  295  6e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  41.22 
 
 		 407 aa  295  7e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  40.69 
 
 		 436 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  40.69 
 
 		 436 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  40.69 
 
 		 405 aa  295  9e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  40.69 
 
 		 405 aa  295  9e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  41.22 
 
 		 407 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  41.22 
 
 		 407 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  41.22 
 
 		 407 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  41.22 
 
 		 407 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  40.69 
 
 		 403 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  42.78 
 
 		 404 aa  293  3e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  40.75 
 
 		 400 aa  293  3e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1047  cysteine desulfurase IscS  40.43 
 
 		 411 aa  293  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  40.96 
 
 		 405 aa  293  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0303  cysteine desulfurase  43.59 
 
 		 402 aa  292  6e-78  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3999  cysteine desulfurase IscS  40.96 
 
 		 406 aa  292  8e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102036  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  40.16 
 
 		 403 aa  292  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  40.96 
 
 		 405 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2262  cysteine desulfurase  40.69 
 
 		 406 aa  291  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  41.22 
 
 		 395 aa  291  2e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  41.49 
 
 		 405 aa  290  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1164  cysteine desulfurase IscS  42.02 
 
 		 402 aa  290  2e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000196201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  41.11 
 
 		 406 aa  290  4e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2443  cysteine desulfurase IscS  40.43 
 
 		 406 aa  290  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.27 
 
 		 400 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  40.69 
 
 		 405 aa  288  9e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  39.1 
 
 		 389 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0247  cysteine desulfurase  42.82 
 
 		 403 aa  287  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  41.47 
 
 		 404 aa  287  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  41.07 
 
 		 388 aa  287  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  41.99 
 
 		 404 aa  287  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  42.93 
 
 		 404 aa  287  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>