More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0289 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0289  aminotransferase, class V  100 
 
 		 389 aa  797    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1737  homocysteine desulfhydrase  74.12 
 
 		 373 aa  578  1e-164  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.956175  normal  0.982172 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  44.82 
 
 		 398 aa  350  4e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  45.93 
 
 		 384 aa  347  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  46.07 
 
 		 384 aa  347  3e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  45.13 
 
 		 394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  42.56 
 
 		 392 aa  337  2.9999999999999997e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  44.56 
 
 		 392 aa  337  2.9999999999999997e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  44.22 
 
 		 398 aa  334  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  44.68 
 
 		 399 aa  332  5e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  44.68 
 
 		 400 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  44.59 
 
 		 394 aa  328  9e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  44.62 
 
 		 402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  45.85 
 
 		 390 aa  327  3e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  43.7 
 
 		 398 aa  325  8.000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  44.16 
 
 		 382 aa  322  7e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  43.33 
 
 		 393 aa  322  9.000000000000001e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  43.41 
 
 		 404 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  44.82 
 
 		 396 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  40.86 
 
 		 398 aa  316  4e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  40.86 
 
 		 398 aa  316  4e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  42.6 
 
 		 398 aa  316  4e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  43.08 
 
 		 382 aa  316  5e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  44.82 
 
 		 394 aa  315  9e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  42.16 
 
 		 407 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  42.12 
 
 		 388 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  42.23 
 
 		 404 aa  311  1e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  42.42 
 
 		 393 aa  311  2e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  41.75 
 
 		 414 aa  309  5e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  41.19 
 
 		 386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  44.33 
 
 		 392 aa  307  3e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  42.86 
 
 		 396 aa  307  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  42.3 
 
 		 403 aa  306  6e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  40.93 
 
 		 389 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  41.18 
 
 		 417 aa  305  9.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  40.78 
 
 		 400 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  40.41 
 
 		 391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.46 
 
 		 400 aa  298  8e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  42.01 
 
 		 403 aa  296  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  39.64 
 
 		 399 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  40.31 
 
 		 384 aa  296  6e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  41.5 
 
 		 409 aa  295  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  40.52 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  41.82 
 
 		 396 aa  294  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  40.41 
 
 		 389 aa  294  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  41.06 
 
 		 405 aa  294  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  40.16 
 
 		 389 aa  293  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  41.03 
 
 		 401 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  39.49 
 
 		 389 aa  293  3e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  39.12 
 
 		 388 aa  293  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  39.69 
 
 		 391 aa  293  4e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  41.34 
 
 		 394 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2373  cysteine desulfurase IscS  40.57 
 
 		 406 aa  290  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.934758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  40.77 
 
 		 388 aa  290  4e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  39.02 
 
 		 407 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  38.27 
 
 		 402 aa  289  6e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3999  cysteine desulfurase IscS  40.31 
 
 		 406 aa  289  6e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102036  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  39.03 
 
 		 406 aa  289  7e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  38.76 
 
 		 407 aa  289  7e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  38.76 
 
 		 407 aa  289  7e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  38.76 
 
 		 407 aa  289  7e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  38.76 
 
 		 407 aa  289  7e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  39.22 
 
 		 388 aa  288  8e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  38.76 
 
 		 407 aa  288  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  39.28 
 
 		 407 aa  288  9e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  39.28 
 
 		 407 aa  288  9e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  38.76 
 
 		 407 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  38.6 
 
 		 393 aa  288  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  39.28 
 
 		 405 aa  287  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  39.02 
 
 		 407 aa  288  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  39.02 
 
 		 407 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  39.02 
 
 		 407 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  39.02 
 
 		 407 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2059  cysteine desulfurase IscS  41.07 
 
 		 407 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0733618  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  39.02 
 
 		 407 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  38.76 
 
 		 407 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  38.76 
 
 		 407 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2262  cysteine desulfurase  39.02 
 
 		 406 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  40.82 
 
 		 406 aa  285  7e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  39.02 
 
 		 407 aa  285  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.16 
 
 		 398 aa  285  8e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2142  cysteine desulfurase IscS  39.28 
 
 		 406 aa  285  9e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  37.82 
 
 		 400 aa  285  9e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  39.02 
 
 		 405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  37.98 
 
 		 405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  39.02 
 
 		 405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  38.76 
 
 		 405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  38.4 
 
 		 391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1164  cysteine desulfurase IscS  40.87 
 
 		 402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000196201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  38.9 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  39.28 
 
 		 405 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  38.52 
 
 		 422 aa  282  5.000000000000001e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  39.79 
 
 		 406 aa  283  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  38.21 
 
 		 403 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0303  cysteine desulfurase  40.21 
 
 		 402 aa  281  1e-74  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  38.76 
 
 		 407 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_002978  WD0997  cysteine desulfurase  39.69 
 
 		 415 aa  280  2e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  38.21 
 
 		 436 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  38.21 
 
 		 436 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  39.06 
 
 		 400 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>