More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2532 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2532  cysteine desulfurase  100 
 
 
379 aa  784    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0916  cysteine desulfurase  73.12 
 
 
374 aa  544  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3146  cysteine desulfurase  60.38 
 
 
380 aa  481  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0347283  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4277  cysteine desulfurase  60.7 
 
 
380 aa  480  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000827813  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4564  cysteine desulfurase  60.7 
 
 
380 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4328  cysteine desulfurase  60.43 
 
 
379 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4165  cysteine desulfurase  60.16 
 
 
379 aa  476  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4511  cysteine desulfurase  60.43 
 
 
379 aa  475  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.372925 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4516  cysteine desulfurase  59.89 
 
 
379 aa  474  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4663  cysteine desulfurase  60.05 
 
 
377 aa  472  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4176  cysteine desulfurase  59.89 
 
 
380 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0211822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4549  cysteine desulfurase  59.63 
 
 
380 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000288046  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0686  cysteine desulfurase  58.82 
 
 
380 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0500544  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  43.7 
 
 
384 aa  309  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  43.43 
 
 
384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  39.68 
 
 
382 aa  293  3e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  40.21 
 
 
414 aa  288  8e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  40.74 
 
 
398 aa  288  1e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  41.27 
 
 
383 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  39.42 
 
 
403 aa  286  4e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  41.71 
 
 
398 aa  286  5e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  38.95 
 
 
392 aa  285  9e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  41.6 
 
 
400 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  40.74 
 
 
399 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  38.83 
 
 
402 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  42.48 
 
 
383 aa  281  1e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  41.8 
 
 
383 aa  278  8e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  39.62 
 
 
392 aa  278  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  41.01 
 
 
394 aa  277  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  40.72 
 
 
382 aa  277  3e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  37.83 
 
 
381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  40.11 
 
 
398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  39.9 
 
 
393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  39.3 
 
 
398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  39.3 
 
 
398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  37.57 
 
 
381 aa  273  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  38.8 
 
 
381 aa  273  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  38.1 
 
 
381 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  37.57 
 
 
381 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  37.57 
 
 
381 aa  272  7e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  37.57 
 
 
381 aa  272  7e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  37.57 
 
 
381 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  37.57 
 
 
381 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  38.89 
 
 
394 aa  271  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  38.54 
 
 
381 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  37.5 
 
 
388 aa  271  2e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  39.15 
 
 
398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  37.3 
 
 
381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  38.24 
 
 
381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2719  aminotransferase class V  39.58 
 
 
380 aa  268  8e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  39.07 
 
 
409 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22050  aminotransferase class V  40.16 
 
 
381 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.718227  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  39.79 
 
 
405 aa  267  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  38.62 
 
 
388 aa  268  2e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  39.05 
 
 
404 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  40.92 
 
 
380 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  39.47 
 
 
389 aa  264  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  39.89 
 
 
396 aa  263  4e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  39.95 
 
 
394 aa  263  4e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  38.85 
 
 
417 aa  263  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  38.03 
 
 
380 aa  260  3e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  40.16 
 
 
404 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  40.16 
 
 
404 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  40.16 
 
 
404 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  40.16 
 
 
404 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  40.16 
 
 
404 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  38.48 
 
 
383 aa  259  4e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  39.89 
 
 
404 aa  259  6e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  38.96 
 
 
396 aa  258  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  39.62 
 
 
404 aa  258  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  40.16 
 
 
404 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  37.07 
 
 
373 aa  258  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  38.96 
 
 
407 aa  258  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  38.96 
 
 
421 aa  257  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  40.16 
 
 
404 aa  257  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  39.67 
 
 
395 aa  258  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  39.89 
 
 
404 aa  257  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  39.89 
 
 
404 aa  257  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  39.89 
 
 
404 aa  257  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  38.65 
 
 
396 aa  257  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  39.89 
 
 
404 aa  257  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  39.89 
 
 
404 aa  257  3e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  39.89 
 
 
404 aa  257  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  39.89 
 
 
404 aa  257  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  39.89 
 
 
404 aa  257  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  39.89 
 
 
404 aa  257  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  39.07 
 
 
404 aa  256  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0592  cysteine desulfurase  40.11 
 
 
404 aa  256  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  39.95 
 
 
392 aa  255  8e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1186  aminotransferase, class V  36.17 
 
 
380 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  39.62 
 
 
404 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0618  cysteine desulfurase  40.11 
 
 
404 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0478  aminotransferase, class V  40 
 
 
380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000122406 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0627  cysteine desulfurase  39.84 
 
 
404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  38.24 
 
 
383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  38.9 
 
 
388 aa  254  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  37.47 
 
 
406 aa  253  3e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01356  cysteine desulfurase  39.73 
 
 
388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.350506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4757  aminotransferase, class V  39.45 
 
 
380 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  37.93 
 
 
393 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>