More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4518 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4518  response regulator  100 
 
 		 162 aa  317  6e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.864476  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4036  response regulator  85.19 
 
 		 154 aa  231  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.170794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4406  response regulator  85.19 
 
 		 154 aa  231  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402272  normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0622  response regulator  71.83 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4556  response regulator  52.86 
 
 		 155 aa  128  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5541  response regulator  48.8 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6935  response regulator  45 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4704  two-component response regulator  37.84 
 
 		 268 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.868333  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1388  two-component response regulator  37.96 
 
 		 268 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.740256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7150  response regulator  43.22 
 
 		 146 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1368  two-component response regulator  37.04 
 
 		 268 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2771  two-component response regulator  37.33 
 
 		 268 aa  85.5  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6002  response regulator  41.53 
 
 		 136 aa  84  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.282143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4028  two-component response regulator  36.5 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7001  two-component response regulator  35.38 
 
 		 254 aa  81.3  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4738  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2485  response regulator  34.65 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1604  two-component response regulator  33.07 
 
 		 264 aa  77  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476211  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1657  two-component response regulator  34.75 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1246  two-component response regulator  33.91 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.660623  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2822  two-component response regulator  35.88 
 
 		 267 aa  74.3  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.230061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2186  two-component response regulator  32.28 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2193  response regulator  36.94 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0128803  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2725  two-component response regulator  34 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0250  two-component response regulator  37.78 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0488  two-component response regulator  30 
 
 		 265 aa  71.6  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4399  two-component response regulator  35.04 
 
 		 267 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.042433  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3837  two-component response regulator  34.19 
 
 		 271 aa  71.6  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.539705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2024  two-component response regulator  32.58 
 
 		 263 aa  70.9  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.363014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2347  two-component response regulator  29.84 
 
 		 264 aa  70.9  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 352 aa  70.9  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3026  two-component response regulator  32.17 
 
 		 264 aa  70.9  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.246349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3278  two-component response regulator  32.2 
 
 		 264 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.442682  hitchhiker  0.00956717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5008  two-component response regulator  34.78 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.16011  normal  0.0859661 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1274  two-component response regulator  34.19 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3285  two-component response regulator  30.37 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3109  two-component response regulator  31.43 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2703  two-component response regulator  35.04 
 
 		 269 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2932  two-component response regulator  35.04 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3239  two-component response regulator  35.65 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  38.39 
 
 		 336 aa  68.2  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3925  two-component response regulator  30.77 
 
 		 264 aa  68.6  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2285  response regulator receiver  33.33 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000158247  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2510  transcriptional regulator  31.36 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000843612  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 472 aa  67.8  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5416  response regulator  35.48 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122104 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6000  two-component response regulator  34.69 
 
 		 264 aa  67.4  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0337  two-component response regulator  29.41 
 
 		 265 aa  67.4  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.101907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3131  two-component response regulator  32.61 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.734649 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  36.7 
 
 		 603 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2905  two-component response regulator  32.61 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.68 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0268  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.23 
 
 		 651 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3566  two-component response regulator  35.83 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3029  two-component response regulator  32.61 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1348  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.19 
 
 		 461 aa  65.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 450 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3671  Sigma 54 interacting domain protein  35.04 
 
 		 657 aa  65.1  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1488  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 450 aa  64.7  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.379239 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0287  two-component response regulator  32.56 
 
 		 264 aa  64.3  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1807  putative PAS/PAC sensor protein  30.17 
 
 		 258 aa  64.3  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.254511 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  34.23 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.04 
 
 		 426 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  35.19 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3521  two-component response regulator  38.1 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4365  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.54 
 
 		 471 aa  63.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.71 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1012  response regulator receiver domain-containing protein  38.75 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2336  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 355 aa  62.4  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404573  normal  0.642469 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0841  response regulator receiver  34.82 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 377 aa  62  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  33.63 
 
 		 380 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  34.58 
 
 		 340 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4327  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  35.4 
 
 		 875 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  39.47 
 
 		 852 aa  61.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 373 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  35.04 
 
 		 429 aa  61.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2722  two-component response regulator  31.3 
 
 		 273 aa  61.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.625093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4302  signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 343 aa  61.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219335  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0089  two-component response regulator  29.92 
 
 		 266 aa  61.2  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 355 aa  60.8  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  35.96 
 
 		 257 aa  60.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4165  hypothetical protein  34.19 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  36.28 
 
 		 667 aa  60.8  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  33.96 
 
 		 429 aa  60.5  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0052  two-component response regulator  28.57 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5755  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4195  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81513  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5460  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.79 
 
 		 650 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.665291  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0286  two-component response regulator  33.01 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173395 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0694  response regulator  29.1 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0834  response regulator receiver  29.73 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000017528  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2294  response regulator receiver  32.04 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.371138  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 		 498 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4326  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 		 571 aa  58.9  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0115  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.96 
 
 		 481 aa  58.9  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4307  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.48 
 
 		 635 aa  58.9  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.056389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>