More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_1604 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_1604  two-component response regulator  100 
 
 
264 aa  535  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476211  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1657  two-component response regulator  99.62 
 
 
264 aa  532  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1246  two-component response regulator  89.02 
 
 
264 aa  480  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.660623  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2347  two-component response regulator  75.76 
 
 
264 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3026  two-component response regulator  71.21 
 
 
264 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.246349  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3278  two-component response regulator  70.83 
 
 
264 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.442682  hitchhiker  0.00956717 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3109  two-component response regulator  71.97 
 
 
265 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0337  two-component response regulator  69.35 
 
 
265 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.101907 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0250  two-component response regulator  66.67 
 
 
264 aa  370  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6000  two-component response regulator  66.28 
 
 
264 aa  359  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4704  two-component response regulator  52.49 
 
 
268 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.868333  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2771  two-component response regulator  53.64 
 
 
268 aa  276  3e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1368  two-component response regulator  52.11 
 
 
268 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0052  two-component response regulator  52.27 
 
 
264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1388  two-component response regulator  52.11 
 
 
268 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.740256  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4028  two-component response regulator  51.72 
 
 
268 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3925  two-component response regulator  54.79 
 
 
264 aa  271  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2725  two-component response regulator  50.96 
 
 
267 aa  267  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0089  two-component response regulator  54.47 
 
 
266 aa  265  7e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4399  two-component response regulator  50.19 
 
 
267 aa  265  8e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.042433  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5008  two-component response regulator  50.76 
 
 
267 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.16011  normal  0.0859661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7001  two-component response regulator  52.82 
 
 
254 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0286  two-component response regulator  52.29 
 
 
274 aa  260  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173395 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3029  two-component response regulator  49.62 
 
 
267 aa  260  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268272  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2905  two-component response regulator  49.62 
 
 
293 aa  260  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3131  two-component response regulator  49.62 
 
 
267 aa  260  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.734649 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2932  two-component response regulator  49.05 
 
 
269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1274  two-component response regulator  48.29 
 
 
269 aa  248  8e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0488  two-component response regulator  49.61 
 
 
265 aa  248  9e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2703  two-component response regulator  49.41 
 
 
269 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3285  two-component response regulator  49.43 
 
 
265 aa  246  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3570  two-component response regulator  49.81 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0287  two-component response regulator  51.16 
 
 
264 aa  241  7e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2186  two-component response regulator  49.81 
 
 
264 aa  240  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3837  two-component response regulator  47.27 
 
 
271 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.539705  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2722  two-component response regulator  48.66 
 
 
273 aa  236  3e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.625093  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3566  two-component response regulator  46.09 
 
 
275 aa  229  4e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2822  two-component response regulator  45.88 
 
 
267 aa  229  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.230061  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3239  two-component response regulator  53.81 
 
 
235 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2024  two-component response regulator  47.66 
 
 
263 aa  217  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.363014  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3521  two-component response regulator  41.22 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  38.46 
 
 
380 aa  87  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  35 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0895  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.6 
 
 
701 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 
472 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2510  transcriptional regulator  37.72 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000843612  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  31.75 
 
 
336 aa  75.5  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1012  response regulator receiver domain-containing protein  35.58 
 
 
109 aa  74.7  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  33.87 
 
 
474 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  35.9 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.21 
 
 
426 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
989 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
603 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2285  response regulator receiver  34.48 
 
 
130 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000158247  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 
989 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1557  response regulator receiver  36.07 
 
 
131 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000412225  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4165  hypothetical protein  35.9 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  31.58 
 
 
844 aa  69.3  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.79 
 
 
701 aa  68.9  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1488  response regulator receiver protein  31.36 
 
 
450 aa  68.9  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.379239 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  39.32 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  36.45 
 
 
461 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.6 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  35.65 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.6 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2052  putative PAS/PAC sensor protein  38.75 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.6 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  28.46 
 
 
450 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.53 
 
 
194 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  31.62 
 
 
429 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
953 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1289  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.78 
 
 
221 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.132207  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5541  response regulator  40.96 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3511  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
384 aa  66.2  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6935  response regulator  37.5 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134474  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  32.5 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.25 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2302  response regulator receiver protein  37.17 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0776388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4327  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  43.59 
 
 
875 aa  65.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0622  response regulator  37.5 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3448  putative transcriptional regulator  32.76 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132297  normal  0.0606491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3427  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.47 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239231  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3671  Sigma 54 interacting domain protein  33.04 
 
 
657 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.14 
 
 
457 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2337  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
352 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0115  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.92 
 
 
481 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2485  response regulator  30.7 
 
 
125 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0841  response regulator receiver  34.19 
 
 
135 aa  64.7  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3575  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.72 
 
 
229 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10936  normal  0.0183031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.14 
 
 
199 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2212  response regulator receiver protein  34.78 
 
 
122 aa  63.9  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.092497  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2294  response regulator receiver  33.04 
 
 
134 aa  63.5  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.371138  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  31.4 
 
 
667 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 
636 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1807  putative PAS/PAC sensor protein  30.12 
 
 
258 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.254511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.02 
 
 
196 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 
817 aa  62.4  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.86 
 
 
213 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  35.71 
 
 
204 aa  62  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>