More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4556 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4556  response regulator  100 
 
 		 155 aa  312  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6935  response regulator  47.24 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4406  response regulator  53.57 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402272  normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4036  response regulator  53.57 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.170794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4518  response regulator  52.86 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.864476  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0622  response regulator  56.64 
 
 		 145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5541  response regulator  47.58 
 
 		 134 aa  110  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7150  response regulator  40.71 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6002  response regulator  38.6 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.282143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2193  response regulator  36.13 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0128803  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5416  response regulator  33.59 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2485  response regulator  36.04 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3239  two-component response regulator  31.62 
 
 		 235 aa  67  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  33.88 
 
 		 352 aa  65.5  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4738  response regulator receiver protein  40 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4330  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2822  two-component response regulator  32.77 
 
 		 267 aa  64.7  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.230061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2510  transcriptional regulator  34.4 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000843612  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4165  hypothetical protein  37.9 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 359 aa  63.9  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2347  two-component response regulator  28.83 
 
 		 264 aa  63.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0250  two-component response regulator  30.63 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3837  two-component response regulator  33.04 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.539705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4195  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81513  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1807  putative PAS/PAC sensor protein  34.48 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.254511 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3925  two-component response regulator  34.19 
 
 		 264 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 		 636 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2725  two-component response regulator  32.43 
 
 		 267 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4327  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  34.48 
 
 		 875 aa  61.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1246  two-component response regulator  29.09 
 
 		 264 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.660623  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7001  two-component response regulator  29.13 
 
 		 254 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0089  two-component response regulator  34.55 
 
 		 266 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2186  two-component response regulator  31.93 
 
 		 264 aa  61.2  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4399  two-component response regulator  32.43 
 
 		 267 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.042433  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1657  two-component response regulator  30 
 
 		 264 aa  61.2  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3029  two-component response regulator  33.93 
 
 		 267 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3131  two-component response regulator  33.93 
 
 		 267 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.734649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2905  two-component response regulator  33.93 
 
 		 293 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1368  two-component response regulator  28.03 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2722  two-component response regulator  31.93 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.625093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3109  two-component response regulator  29.75 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3026  two-component response regulator  27.93 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.246349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1274  two-component response regulator  31.58 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  38.27 
 
 		 429 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1388  two-component response regulator  28.03 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.740256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3278  two-component response regulator  27.93 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.442682  hitchhiker  0.00956717 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0834  response regulator receiver  29.73 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000017528  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4704  two-component response regulator  28.03 
 
 		 268 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.868333  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0052  two-component response regulator  32.11 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4028  two-component response regulator  28.03 
 
 		 268 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0337  two-component response regulator  29.6 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.101907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3435  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465011  normal  0.396609 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5008  two-component response regulator  32.14 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.16011  normal  0.0859661 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3285  two-component response regulator  30.58 
 
 		 265 aa  58.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3061  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.11 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00113676  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2703  two-component response regulator  31.58 
 
 		 269 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2336  response regulator receiver protein  41.25 
 
 		 355 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404573  normal  0.642469 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0123  two component transcriptional regulator  36.57 
 
 		 241 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2932  two-component response regulator  31.58 
 
 		 269 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1604  two-component response regulator  29.09 
 
 		 264 aa  58.2  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476211  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  31.73 
 
 		 461 aa  57  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0286  two-component response regulator  30.65 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3896  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.26 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3566  two-component response regulator  30.63 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 1066 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1488  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 450 aa  57  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.379239 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6000  two-component response regulator  27.87 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2052  putative PAS/PAC sensor protein  32.71 
 
 		 414 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2771  two-component response regulator  30.43 
 
 		 268 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4365  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.47 
 
 		 471 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.26 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 472 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  31.9 
 
 		 336 aa  55.1  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0287  two-component response regulator  31.36 
 
 		 264 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 386 aa  54.7  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0895  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.58 
 
 		 701 aa  54.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  35.63 
 
 		 404 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2024  two-component response regulator  33.64 
 
 		 263 aa  54.3  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.363014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3671  Sigma 54 interacting domain protein  37.88 
 
 		 657 aa  53.9  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1557  response regulator receiver  31.53 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000412225  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.81 
 
 		 210 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.81 
 
 		 210 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0573  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 261 aa  53.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.332219 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1629  response regulator receiver domain-containing protein  34.13 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.19 
 
 		 199 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.144201  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  35 
 
 		 337 aa  53.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0840  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  29.82 
 
 		 380 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.36 
 
 		 426 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.81 
 
 		 210 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3575  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.96 
 
 		 229 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10936  normal  0.0183031 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.45 
 
 		 498 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.86 
 
 		 241 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  38.55 
 
 		 429 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4846  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0428  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.31 
 
 		 455 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0268  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.31 
 
 		 651 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 223 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>