More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3026 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3026  two-component response regulator  100 
 
 		 264 aa  535  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.246349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3278  two-component response regulator  97.35 
 
 		 264 aa  520  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.442682  hitchhiker  0.00956717 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2347  two-component response regulator  78.41 
 
 		 264 aa  428  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1246  two-component response regulator  73.48 
 
 		 264 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.660623  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1657  two-component response regulator  71.59 
 
 		 264 aa  391  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6000  two-component response regulator  72.41 
 
 		 264 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1604  two-component response regulator  71.21 
 
 		 264 aa  388  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476211  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3109  two-component response regulator  71.21 
 
 		 265 aa  388  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0337  two-component response regulator  69.58 
 
 		 265 aa  380  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.101907 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0250  two-component response regulator  64.39 
 
 		 264 aa  355  2.9999999999999997e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4028  two-component response regulator  53.61 
 
 		 268 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4704  two-component response regulator  52.85 
 
 		 268 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.868333  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1388  two-component response regulator  52.47 
 
 		 268 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.740256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1368  two-component response regulator  52.09 
 
 		 268 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2771  two-component response regulator  52.67 
 
 		 268 aa  277  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3925  two-component response regulator  55.56 
 
 		 264 aa  276  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4399  two-component response regulator  52.85 
 
 		 267 aa  275  7e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.042433  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2725  two-component response regulator  52.11 
 
 		 267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0052  two-component response regulator  53.03 
 
 		 264 aa  273  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2932  two-component response regulator  51.71 
 
 		 269 aa  271  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7001  two-component response regulator  54 
 
 		 254 aa  271  8.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3131  two-component response regulator  51.91 
 
 		 267 aa  270  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.734649 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0286  two-component response regulator  51.53 
 
 		 274 aa  270  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173395 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2905  two-component response regulator  51.91 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3029  two-component response regulator  51.91 
 
 		 267 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1274  two-component response regulator  50.95 
 
 		 269 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2703  two-component response regulator  51.16 
 
 		 269 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0089  two-component response regulator  54.14 
 
 		 266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5008  two-component response regulator  50.76 
 
 		 267 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.16011  normal  0.0859661 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2722  two-component response regulator  53.28 
 
 		 273 aa  257  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.625093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0488  two-component response regulator  48.66 
 
 		 265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2186  two-component response regulator  51.91 
 
 		 264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3837  two-component response regulator  46.88 
 
 		 271 aa  247  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.539705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3570  two-component response regulator  49.43 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3285  two-component response regulator  48.67 
 
 		 265 aa  244  9e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2822  two-component response regulator  46.48 
 
 		 267 aa  244  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.230061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0287  two-component response regulator  50.19 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3566  two-component response regulator  45.8 
 
 		 275 aa  230  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2024  two-component response regulator  48.64 
 
 		 263 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.363014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3239  two-component response regulator  51.63 
 
 		 235 aa  220  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3521  two-component response regulator  39.68 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  36.21 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1012  response regulator receiver domain-containing protein  36.89 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 472 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0895  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.67 
 
 		 701 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2510  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000843612  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2285  response regulator receiver  37.39 
 
 		 130 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000158247  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.65 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  33.06 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  36.97 
 
 		 474 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1557  response regulator receiver  34.96 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000412225  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2294  response regulator receiver  35.25 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.371138  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  35.29 
 
 		 603 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 989 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1488  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.379239 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  36.45 
 
 		 461 aa  68.6  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 		 636 aa  68.6  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  33.59 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  32.77 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  28.69 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.37 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 		 989 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.76 
 
 		 701 aa  67.4  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0841  response regulator receiver  34.19 
 
 		 135 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0616  two component transcriptional regulator  28.45 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6935  response regulator  41.67 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  31.15 
 
 		 429 aa  65.5  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3448  putative transcriptional regulator  31.9 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132297  normal  0.0606491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3671  Sigma 54 interacting domain protein  30.65 
 
 		 657 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2212  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 122 aa  65.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.092497  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5541  response regulator  38.55 
 
 		 134 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2671  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000586434 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  31.62 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2052  putative PAS/PAC sensor protein  36.71 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 		 817 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 		 953 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.01 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  33.61 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.96 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3427  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.03 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1289  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.59 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.132207  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.89 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2576  response regulator receiver domain-containing protein  29.57 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0428  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.17 
 
 		 455 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0900  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000110071 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0439  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.17 
 
 		 455 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.444664 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  29.03 
 
 		 429 aa  62  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0115  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.89 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4327  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  36.89 
 
 		 875 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.43 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.43 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.43 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0622  response regulator  36.08 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  29.2 
 
 		 844 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.38 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4165  hypothetical protein  35.14 
 
 		 153 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>