More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3566 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3566  two-component response regulator  100 
 
 		 275 aa  552  1e-156  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2932  two-component response regulator  59.63 
 
 		 269 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2703  two-component response regulator  59.26 
 
 		 269 aa  315  7e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2722  two-component response regulator  61.03 
 
 		 273 aa  311  5.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.625093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1274  two-component response regulator  58.89 
 
 		 269 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2822  two-component response regulator  60.67 
 
 		 267 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.230061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3837  two-component response regulator  58.56 
 
 		 271 aa  299  4e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.539705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3925  two-component response regulator  53.12 
 
 		 264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2347  two-component response regulator  48.28 
 
 		 264 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1368  two-component response regulator  48.85 
 
 		 268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4704  two-component response regulator  48.85 
 
 		 268 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.868333  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1388  two-component response regulator  48.85 
 
 		 268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.740256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5008  two-component response regulator  49.81 
 
 		 267 aa  232  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.16011  normal  0.0859661 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4399  two-component response regulator  49.81 
 
 		 267 aa  232  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.042433  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2725  two-component response regulator  49.42 
 
 		 267 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4028  two-component response regulator  48.85 
 
 		 268 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0052  two-component response regulator  46.54 
 
 		 264 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0089  two-component response regulator  45.66 
 
 		 266 aa  231  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3278  two-component response regulator  45.8 
 
 		 264 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.442682  hitchhiker  0.00956717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3026  two-component response regulator  45.8 
 
 		 264 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.246349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6000  two-component response regulator  47.1 
 
 		 264 aa  229  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1657  two-component response regulator  46.09 
 
 		 264 aa  229  5e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1604  two-component response regulator  46.09 
 
 		 264 aa  229  5e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476211  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1246  two-component response regulator  45.31 
 
 		 264 aa  227  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.660623  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3109  two-component response regulator  47.66 
 
 		 265 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2771  two-component response regulator  48.08 
 
 		 268 aa  227  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3131  two-component response regulator  48.45 
 
 		 267 aa  227  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.734649 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3029  two-component response regulator  48.45 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2905  two-component response regulator  48.45 
 
 		 293 aa  226  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7001  two-component response regulator  48 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3285  two-component response regulator  47.88 
 
 		 265 aa  222  6e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0250  two-component response regulator  43.75 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0488  two-component response regulator  46.15 
 
 		 265 aa  218  8.999999999999998e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0286  two-component response regulator  44.57 
 
 		 274 aa  216  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173395 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0337  two-component response regulator  43.73 
 
 		 265 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.101907 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2024  two-component response regulator  44.31 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.363014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0287  two-component response regulator  45.77 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2186  two-component response regulator  43.63 
 
 		 264 aa  203  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3570  two-component response regulator  43.89 
 
 		 252 aa  192  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3239  two-component response regulator  44.71 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3521  two-component response regulator  36.9 
 
 		 249 aa  131  9e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 450 aa  85.9  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1557  response regulator receiver  36.36 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000412225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3448  putative transcriptional regulator  34.4 
 
 		 143 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132297  normal  0.0606491 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1488  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.379239 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2285  response regulator receiver  32.26 
 
 		 130 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000158247  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2510  transcriptional regulator  33.08 
 
 		 157 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000843612  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1807  putative PAS/PAC sensor protein  32.79 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.254511 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  34.15 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0048  putative PAS/PAC sensor protein  32.81 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0895  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.67 
 
 		 701 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  34.38 
 
 		 603 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  32.79 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 472 aa  68.9  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  32 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  34.65 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.531352 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  35.59 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 359 aa  67  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0841  response regulator receiver  34.71 
 
 		 135 aa  67  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 		 953 aa  67  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1012  response regulator receiver domain-containing protein  35.85 
 
 		 109 aa  64.7  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2294  response regulator receiver  32.35 
 
 		 134 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.371138  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.48 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 		 989 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.69 
 
 		 817 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 		 989 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  31.15 
 
 		 474 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3510  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 521 aa  62.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.269968 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 498 aa  62  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3669  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.4 
 
 		 432 aa  62  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  34.13 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 		 386 aa  62  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4330  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 127 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  31.15 
 
 		 667 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0428  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.36 
 
 		 455 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4302  signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219335  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 499 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0622  response regulator  42.86 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0834  response regulator receiver  30.58 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000017528  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0439  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.36 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.444664 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  30.83 
 
 		 404 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4326  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 571 aa  58.9  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0455  response regulator receiver domain-containing protein  30.33 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.21261 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1007  putative GAF sensor protein  33.61 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164021  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05930  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  31.62 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2193  response regulator  33.04 
 
 		 124 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0128803  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1289  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.82 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.132207  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2485  response regulator  32.17 
 
 		 125 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 		 1172 aa  57.4  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 591 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4556  response regulator  30.63 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  25.98 
 
 		 429 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  31.2 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4327  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  33.03 
 
 		 875 aa  56.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4165  hypothetical protein  30.77 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 377 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>